Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm25862-201ENSMUST00000158250 129 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Trim71Q1PSW8 Mir8107-201ENSMUST00000184024 117 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Trim71Q1PSW8 Gm24843-201ENSMUST00000158682 76 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Trim71Q1PSW8 Gm45741-201ENSMUST00000212661 152 ntTSL 1 (best) BASIC0.11□□□□□ -2.39
Trim71Q1PSW8 Gm29344-201ENSMUST00000068143 210 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Trim71Q1PSW8 Gm24259-201ENSMUST00000083740 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Trim71Q1PSW8 Gm26259-201ENSMUST00000104778 97 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Trim71Q1PSW8 Gm22077-201ENSMUST00000157594 93 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Trim71Q1PSW8 Gm22838-201ENSMUST00000158437 99 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Trim71Q1PSW8 Gm22474-201ENSMUST00000179407 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Trim71Q1PSW8 Gm23173-201ENSMUST00000157161 160 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Trim71Q1PSW8 Gm23036-201ENSMUST00000157885 99 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Trim71Q1PSW8 Gm24218-201ENSMUST00000180163 105 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Trim71Q1PSW8 Gm27798-201ENSMUST00000184989 71 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Trim71Q1PSW8 AC238676.2-201ENSMUST00000220910 94 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Trim71Q1PSW8 Gm24531-201ENSMUST00000157945 100 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Trim71Q1PSW8 Gm22157-201ENSMUST00000158410 104 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Trim71Q1PSW8 Gm26210-201ENSMUST00000158680 91 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Trim71Q1PSW8 Gm22401-201ENSMUST00000174927 117 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Trim71Q1PSW8 Gm27749-201ENSMUST00000183651 125 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Trim71Q1PSW8 Mir3065-201ENSMUST00000198674 87 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Trim71Q1PSW8 Gm25802-201ENSMUST00000082639 77 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Trim71Q1PSW8 Mir382-201ENSMUST00000083494 76 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Trim71Q1PSW8 Mir702-201ENSMUST00000102285 109 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Trim71Q1PSW8 Mir876-201ENSMUST00000104659 81 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Trim71Q1PSW8 Gm24651-201ENSMUST00000157107 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Trim71Q1PSW8 Gm23590-201ENSMUST00000157661 104 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Trim71Q1PSW8 Gm24903-201ENSMUST00000158131 126 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Trim71Q1PSW8 Gm24996-201ENSMUST00000158390 99 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Trim71Q1PSW8 Gm38208-201ENSMUST00000192476 114 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Trim71Q1PSW8 AC160976.1-201ENSMUST00000215092 148 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Trim71Q1PSW8 Gm24455-201ENSMUST00000083348 131 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Trim71Q1PSW8 Mir181b-1-201ENSMUST00000083524 80 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Trim71Q1PSW8 Gm10663-201ENSMUST00000098716 66 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.07□□□□□ -2.4
Trim71Q1PSW8 Snord91a-201ENSMUST00000104305 93 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Trim71Q1PSW8 Gm22965-201ENSMUST00000157958 101 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Trim71Q1PSW8 Gm23630-201ENSMUST00000175292 104 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Trim71Q1PSW8 Mir3089-201ENSMUST00000175350 84 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Trim71Q1PSW8 Mir7094-2-201ENSMUST00000184622 60 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Trim71Q1PSW8 Mir7094-1-201ENSMUST00000199671 60 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Trim71Q1PSW8 Snord42b-201ENSMUST00000083742 69 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Trim71Q1PSW8 Gm25510-201ENSMUST00000116986 123 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Trim71Q1PSW8 Gm25522-201ENSMUST00000158394 105 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Trim71Q1PSW8 Gm25703-201ENSMUST00000083123 151 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Trim71Q1PSW8 Snord85-201ENSMUST00000083262 73 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Trim71Q1PSW8 Gm23483-201ENSMUST00000104179 108 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Trim71Q1PSW8 Mir1955-201ENSMUST00000158014 98 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Trim71Q1PSW8 Gm24508-201ENSMUST00000180104 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Trim71Q1PSW8 Gm6607-201ENSMUST00000215035 328 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Trim71Q1PSW8 Gm24714-201ENSMUST00000102382 101 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Trim71Q1PSW8 Gm22368-201ENSMUST00000102416 109 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Trim71Q1PSW8 Gm24793-201ENSMUST00000104289 132 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Trim71Q1PSW8 Gm26306-201ENSMUST00000157773 119 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Trim71Q1PSW8 Gm22260-201ENSMUST00000178643 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Trim71Q1PSW8 Mir7651-201ENSMUST00000184154 64 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Trim71Q1PSW8 Gm26227-201ENSMUST00000082510 101 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Trim71Q1PSW8 Gm22305-201ENSMUST00000082690 108 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Trim71Q1PSW8 9230110F11Rik-202ENSMUST00000212907 191 ntTSL 5 BASIC0.02□□□□□ -2.41
Trim71Q1PSW8 Gm24459-201ENSMUST00000082730 86 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Trim71Q1PSW8 Mir1948-201ENSMUST00000157325 85 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Trim71Q1PSW8 Gm24971-201ENSMUST00000175581 110 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Trim71Q1PSW8 Gm44375-201ENSMUST00000196657 150 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Trim71Q1PSW8 Gm24710-201ENSMUST00000175235 101 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Trim71Q1PSW8 Gm24135-201ENSMUST00000179085 101 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Trim71Q1PSW8 Gm42773-201ENSMUST00000196962 148 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Trim71Q1PSW8 Gm45374-201ENSMUST00000211388 136 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Trim71Q1PSW8 n-R5s42-201ENSMUST00000082697 104 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Trim71Q1PSW8 Gm23909-201ENSMUST00000104598 131 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Trim71Q1PSW8 Cyp2j7-ps1-201ENSMUST00000122430 173 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Trim71Q1PSW8 Gm24336-201ENSMUST00000104203 146 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Trim71Q1PSW8 Gm22335-201ENSMUST00000157724 99 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Trim71Q1PSW8 Gm23918-201ENSMUST00000175253 106 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Trim71Q1PSW8 Gm22550-201ENSMUST00000179774 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Trim71Q1PSW8 Gm22060-201ENSMUST00000082558 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Trim71Q1PSW8 Gm25023-201ENSMUST00000082977 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Trim71Q1PSW8 Gm25524-201ENSMUST00000101821 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Trim71Q1PSW8 Traj35-201ENSMUST00000103706 65 ntAPPRIS P1 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
Trim71Q1PSW8 Gm22602-201ENSMUST00000157596 95 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Trim71Q1PSW8 Gm24296-201ENSMUST00000158297 106 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Trim71Q1PSW8 Gm23992-201ENSMUST00000174981 67 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Trim71Q1PSW8 Gm25995-201ENSMUST00000175396 142 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Trim71Q1PSW8 Mir6957-201ENSMUST00000183708 64 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Trim71Q1PSW8 Mir378c-201ENSMUST00000184478 99 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Trim71Q1PSW8 Gm23749-201ENSMUST00000104223 131 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Trim71Q1PSW8 Mir3470a-201ENSMUST00000175223 77 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Trim71Q1PSW8 Mir6915-201ENSMUST00000198839 69 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Trim71Q1PSW8 Gm44328-201ENSMUST00000199331 75 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Trim71Q1PSW8 Gm22813-201ENSMUST00000199948 123 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Trim71Q1PSW8 AC167019.1-201ENSMUST00000227913 106 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Trim71Q1PSW8 Mir466f-1-201ENSMUST00000104779 94 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Trim71Q1PSW8 Mir125b-1-201ENSMUST00000175613 77 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Trim71Q1PSW8 Mir7038-201ENSMUST00000184833 71 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Trim71Q1PSW8 Gm37646-201ENSMUST00000191756 111 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Trim71Q1PSW8 Mir28c-201ENSMUST00000200096 75 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Trim71Q1PSW8 Snord58b-201ENSMUST00000082937 66 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Trim71Q1PSW8 Gm22056-201ENSMUST00000083386 81 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Trim71Q1PSW8 Mir18b-201ENSMUST00000103923 83 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Trim71Q1PSW8 Gm25388-201ENSMUST00000157339 151 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Trim71Q1PSW8 Gm23308-201ENSMUST00000179475 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Trim71Q1PSW8 Gm22301-201ENSMUST00000082656 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
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