Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Snord53-201ENSMUST00000175146 78 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Hoxd11P23813 Gm25247-201ENSMUST00000175475 90 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Hoxd11P23813 Mir423-201ENSMUST00000083584 109 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Hoxd11P23813 Vmn1r78-202ENSMUST00000228244 7931 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Hoxd11P23813 Scarna3b-201ENSMUST00000157533 139 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Hoxd11P23813 Traj60-201ENSMUST00000167781 54 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Hoxd11P23813 Gm23811-201ENSMUST00000175155 84 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Hoxd11P23813 Gm25862-201ENSMUST00000158250 129 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Hoxd11P23813 Mir702-201ENSMUST00000102285 109 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Hoxd11P23813 Mir7681-201ENSMUST00000184834 72 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Hoxd11P23813 Gm25408-201ENSMUST00000104104 133 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Hoxd11P23813 Gm23607-201ENSMUST00000104550 126 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Hoxd11P23813 C920009B18Rik-204ENSMUST00000181733 123 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Hoxd11P23813 AC139186.1-201ENSMUST00000197610 94 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Hoxd11P23813 Mir3105-201ENSMUST00000175480 85 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Hoxd11P23813 Mir343-201ENSMUST00000102360 75 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Hoxd11P23813 Gm25128-201ENSMUST00000083339 76 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Hoxd11P23813 Gm23600-201ENSMUST00000157260 71 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Hoxd11P23813 Gm26484-201ENSMUST00000158018 106 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Hoxd11P23813 Gm24884-201ENSMUST00000158784 119 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Hoxd11P23813 Mir148b-201ENSMUST00000083626 97 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Hoxd11P23813 Mir363-201ENSMUST00000093598 75 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Hoxd11P23813 Mir6364-201ENSMUST00000183396 86 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Hoxd11P23813 Mir9-3-201ENSMUST00000175497 90 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Hoxd11P23813 Mir7678-201ENSMUST00000185076 71 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Hoxd11P23813 Mir669f-201ENSMUST00000103850 121 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Hoxd11P23813 Gm25166-201ENSMUST00000158909 111 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Hoxd11P23813 Gm21954-201ENSMUST00000179544 51 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Hoxd11P23813 Gm24381-201ENSMUST00000122697 104 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Hoxd11P23813 Gm24467-201ENSMUST00000157887 126 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Hoxd11P23813 Mir7229-201ENSMUST00000197062 53 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Hoxd11P23813 Gm44347-201ENSMUST00000199602 108 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Hoxd11P23813 Mir196b-201ENSMUST00000083509 85 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Hoxd11P23813 Gm10945-201ENSMUST00000105596 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Hoxd11P23813 AC117232.1-201ENSMUST00000197964 119 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Hoxd11P23813 Gm24387-201ENSMUST00000104625 90 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Hoxd11P23813 DQ267101-201ENSMUST00000082562 73 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Hoxd11P23813 Gm22093-201ENSMUST00000158980 111 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Hoxd11P23813 Mir7217-201ENSMUST00000200304 62 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Hoxd11P23813 Gm24258-201ENSMUST00000083739 133 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Hoxd11P23813 Gm23126-201ENSMUST00000104260 134 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Hoxd11P23813 Mir6904-201ENSMUST00000183443 67 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Hoxd11P23813 Mir873a-201ENSMUST00000104863 77 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Hoxd11P23813 Mir5124a-201ENSMUST00000175528 72 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Hoxd11P23813 Gm27784-201ENSMUST00000184926 113 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Hoxd11P23813 Gm15115-201ENSMUST00000121145 264 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Hoxd11P23813 Gm23315-201ENSMUST00000158003 109 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Hoxd11P23813 Mir466m-201ENSMUST00000175052 84 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Hoxd11P23813 Gm25495-201ENSMUST00000104431 131 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Hoxd11P23813 Gm22494-201ENSMUST00000104495 128 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Hoxd11P23813 Gm27974-201ENSMUST00000183415 105 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Hoxd11P23813 Gm23008-201ENSMUST00000158946 80 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Hoxd11P23813 Gm23813-201ENSMUST00000175153 77 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Hoxd11P23813 CT009723.2-201ENSMUST00000215702 124 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Hoxd11P23813 Gm23909-201ENSMUST00000104598 131 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Hoxd11P23813 Mir3096-201ENSMUST00000116685 71 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Hoxd11P23813 Gm23469-201ENSMUST00000157131 104 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Hoxd11P23813 Mir219b-201ENSMUST00000198317 65 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Hoxd11P23813 AC144671.1-201ENSMUST00000215265 99 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Hoxd11P23813 Gm25796-201ENSMUST00000082645 163 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Hoxd11P23813 Mir141-201ENSMUST00000083540 72 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Hoxd11P23813 Gm24579-201ENSMUST00000103964 144 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Hoxd11P23813 Gm27248-201ENSMUST00000184004 166 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Hoxd11P23813 Gm44803-201ENSMUST00000204384 156 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Hoxd11P23813 Mir7065-201ENSMUST00000185110 61 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Hoxd11P23813 Gm25375-201ENSMUST00000158157 135 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Hoxd11P23813 Gm37750-201ENSMUST00000193563 129 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Hoxd11P23813 Gm25995-201ENSMUST00000175396 142 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Hoxd11P23813 Gm27749-201ENSMUST00000183651 125 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Hoxd11P23813 Mir320-201ENSMUST00000083594 82 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Hoxd11P23813 Mir7016-201ENSMUST00000184308 72 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Hoxd11P23813 Mir3069-201ENSMUST00000198802 65 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Hoxd11P23813 Gm22981-201ENSMUST00000082611 75 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Hoxd11P23813 Mir33-201ENSMUST00000083531 69 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Hoxd11P23813 Gm24222-201ENSMUST00000158834 93 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Hoxd11P23813 Gm23342-201ENSMUST00000158958 115 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Hoxd11P23813 Gm23636-201ENSMUST00000175070 95 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Hoxd11P23813 Gm38208-201ENSMUST00000192476 114 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Hoxd11P23813 Traj13-201ENSMUST00000103728 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Hoxd11P23813 Gm45754-201ENSMUST00000212380 279 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Hoxd11P23813 Gm24661-201ENSMUST00000083205 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Hoxd11P23813 Mir7663-201ENSMUST00000183950 61 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Hoxd11P23813 Gm24678-201ENSMUST00000158756 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Hoxd11P23813 Gm22780-201ENSMUST00000104084 132 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Hoxd11P23813 Gm24772-201ENSMUST00000158507 110 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Hoxd11P23813 Mir3065-201ENSMUST00000198674 87 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Hoxd11P23813 Mir18-201ENSMUST00000083469 96 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Hoxd11P23813 Gm27493-201ENSMUST00000184128 78 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Hoxd11P23813 Gm44457-201ENSMUST00000198109 76 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Hoxd11P23813 Mir6389-201ENSMUST00000183661 102 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Hoxd11P23813 Snord32a-201ENSMUST00000083285 83 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Hoxd11P23813 Gm24252-201ENSMUST00000083700 132 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Hoxd11P23813 Gm25506-201ENSMUST00000104339 70 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Hoxd11P23813 Gm23122-201ENSMUST00000157645 103 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Hoxd11P23813 Gm44962-201ENSMUST00000206460 279 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Hoxd11P23813 Gm22602-201ENSMUST00000157596 95 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Hoxd11P23813 Mir6995-201ENSMUST00000183658 71 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Hoxd11P23813 Tex15-201ENSMUST00000009772 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
Hoxd11P23813 Snord35a-201ENSMUST00000083884 90 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Hoxd11P23813 Mir224-201ENSMUST00000083608 82 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
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