Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 AC158537.2-201ENSMUST00000223575 150 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
Ccl20O89093 Gm26233-201ENSMUST00000175530 70 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
Ccl20O89093 Gm19248-201ENSMUST00000209404 110 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
Ccl20O89093 Gm23690-201ENSMUST00000083036 94 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
Ccl20O89093 Gm23468-201ENSMUST00000157125 108 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
Ccl20O89093 Gm26466-201ENSMUST00000179615 79 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
Ccl20O89093 Gm27554-201ENSMUST00000185074 98 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
Ccl20O89093 Gm26131-201ENSMUST00000082725 110 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
Ccl20O89093 Gm22595-201ENSMUST00000104250 130 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
Ccl20O89093 Gm24605-201ENSMUST00000104772 96 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
Ccl20O89093 Gm23349-201ENSMUST00000158432 98 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
Ccl20O89093 Gm27884-201ENSMUST00000183865 76 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
Ccl20O89093 Gm22305-201ENSMUST00000082690 108 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
Ccl20O89093 Gm23904-201ENSMUST00000157567 124 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
Ccl20O89093 Gm24701-201ENSMUST00000101946 105 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
Ccl20O89093 Gm23607-201ENSMUST00000104550 126 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
Ccl20O89093 Gm23831-201ENSMUST00000158895 85 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
Ccl20O89093 Mir3083-201ENSMUST00000175377 64 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
Ccl20O89093 Gm23369-201ENSMUST00000175406 105 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
Ccl20O89093 Gm26499-201ENSMUST00000178544 79 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
Ccl20O89093 Gm26096-201ENSMUST00000179084 79 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
Ccl20O89093 Mir136-201ENSMUST00000199494 62 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
Ccl20O89093 Gm23347-201ENSMUST00000083823 82 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
Ccl20O89093 Mir702-201ENSMUST00000102285 109 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
Ccl20O89093 Gm25289-201ENSMUST00000122799 119 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
Ccl20O89093 Gm24199-201ENSMUST00000157808 136 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
Ccl20O89093 Gm24108-201ENSMUST00000175495 77 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
Ccl20O89093 Gm27415-201ENSMUST00000183720 95 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
Ccl20O89093 AC160962.3-201ENSMUST00000225914 112 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
Ccl20O89093 Mir302c-201ENSMUST00000083548 68 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
Ccl20O89093 Gm24445-201ENSMUST00000083981 107 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
Ccl20O89093 Gm24234-201ENSMUST00000104316 107 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
Ccl20O89093 Gm23173-201ENSMUST00000157161 160 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
Ccl20O89093 Gm23306-201ENSMUST00000179058 105 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
Ccl20O89093 Gm27798-201ENSMUST00000184989 71 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
Ccl20O89093 Gm22458-201ENSMUST00000082576 107 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
Ccl20O89093 Gm22213-201ENSMUST00000157564 119 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
Ccl20O89093 Gm24400-201ENSMUST00000157865 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
Ccl20O89093 Mir669m-1-201ENSMUST00000158945 98 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
Ccl20O89093 Mir6961-201ENSMUST00000183874 67 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
Ccl20O89093 Gm25225-201ENSMUST00000158197 102 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
Ccl20O89093 Gm25798-201ENSMUST00000082641 107 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
Ccl20O89093 Gm23244-201ENSMUST00000083375 92 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
Ccl20O89093 Gm24704-201ENSMUST00000093715 107 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
Ccl20O89093 Gm22938-201ENSMUST00000103956 120 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
Ccl20O89093 Gm25712-201ENSMUST00000158634 93 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
Ccl20O89093 Mir6957-201ENSMUST00000183708 64 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
Ccl20O89093 Mir7057-201ENSMUST00000184685 58 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
Ccl20O89093 Gm25542-201ENSMUST00000116889 94 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
Ccl20O89093 Gm23644-201ENSMUST00000157856 77 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
Ccl20O89093 Gm22539-201ENSMUST00000158167 117 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
Ccl20O89093 Gm25497-201ENSMUST00000104425 132 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
Ccl20O89093 Mir1948-201ENSMUST00000157325 85 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
Ccl20O89093 Gm44589-201ENSMUST00000207025 115 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
Ccl20O89093 Gm24148-201ENSMUST00000082762 80 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
Ccl20O89093 Gm23240-201ENSMUST00000083009 121 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
Ccl20O89093 Gm11084-201ENSMUST00000112062 69 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-1.11□□□□□ -2.59
Ccl20O89093 Gm24946-201ENSMUST00000158332 106 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
Ccl20O89093 Mir1839-201ENSMUST00000175366 127 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
Ccl20O89093 Gm25380-201ENSMUST00000175463 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
Ccl20O89093 Gm24641-201ENSMUST00000178055 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
Ccl20O89093 Gm25484-201ENSMUST00000178217 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
Ccl20O89093 Gm26138-201ENSMUST00000179236 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
Ccl20O89093 Gm22821-201ENSMUST00000179288 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
Ccl20O89093 Gm23298-201ENSMUST00000083181 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
Ccl20O89093 Gm24614-201ENSMUST00000083269 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
Ccl20O89093 Gm22057-201ENSMUST00000083387 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
Ccl20O89093 Gm25516-201ENSMUST00000083857 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
Ccl20O89093 Snord16a-201ENSMUST00000083895 99 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
Ccl20O89093 Gm22354-201ENSMUST00000083919 70 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
Ccl20O89093 Gm25417-201ENSMUST00000104212 131 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
Ccl20O89093 Gm23308-201ENSMUST00000179475 107 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
Ccl20O89093 Gm25644-201ENSMUST00000083209 107 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
Ccl20O89093 Gm24650-201ENSMUST00000157105 103 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
Ccl20O89093 Gm23166-201ENSMUST00000157164 101 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
Ccl20O89093 Gm25428-201ENSMUST00000157608 114 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
Ccl20O89093 Gm23072-201ENSMUST00000158243 123 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
Ccl20O89093 Gm44490-201ENSMUST00000198566 127 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
Ccl20O89093 9230110F11Rik-202ENSMUST00000212907 191 ntTSL 5 BASIC-1.14□□□□□ -2.59
Ccl20O89093 Gm25854-201ENSMUST00000082792 72 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
Ccl20O89093 Gm25740-201ENSMUST00000180247 107 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
Ccl20O89093 n-R5s96-201ENSMUST00000082574 124 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
Ccl20O89093 Gm22381-201ENSMUST00000158186 107 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
Ccl20O89093 Gm21836-201ENSMUST00000178787 63 ntAPPRIS P1 BASIC-1.16□□□□□ -2.6
Ccl20O89093 Trgj1-201ENSMUST00000200495 60 ntAPPRIS P1 BASIC-1.16□□□□□ -2.6
Ccl20O89093 Gm25987-201ENSMUST00000083234 107 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
Ccl20O89093 Gm25061-201ENSMUST00000104665 107 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
Ccl20O89093 Gm11333-201ENSMUST00000119479 148 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
Ccl20O89093 Snord49b-201ENSMUST00000082503 72 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
Ccl20O89093 Gm23199-201ENSMUST00000158812 107 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
Ccl20O89093 Gm23630-201ENSMUST00000175292 104 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
Ccl20O89093 Gm25158-201ENSMUST00000177681 121 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
Ccl20O89093 Gm26229-201ENSMUST00000179699 121 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
Ccl20O89093 Gm24988-201ENSMUST00000104460 121 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
Ccl20O89093 Gm23909-201ENSMUST00000104598 131 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
Ccl20O89093 Gm22489-201ENSMUST00000116813 62 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
Ccl20O89093 Mir7231-201ENSMUST00000196252 61 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
Ccl20O89093 Gm25815-201ENSMUST00000082755 107 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
Ccl20O89093 Gm22729-201ENSMUST00000158088 129 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
Ccl20O89093 CT030170.1-201ENSMUST00000222183 148 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 175.4 ms