Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Gm25322-201ENSMUST00000122556 104 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
ApobE9Q414 Mir465-201ENSMUST00000093563 74 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
ApobE9Q414 Gm26180-201ENSMUST00000179942 107 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
ApobE9Q414 Gm22196-201ENSMUST00000116865 109 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
ApobE9Q414 Gm22339-201ENSMUST00000157718 62 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
ApobE9Q414 Gm23779-201ENSMUST00000157938 64 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
ApobE9Q414 Gm26156-201ENSMUST00000116999 123 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
ApobE9Q414 Gm22925-201ENSMUST00000174956 102 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
ApobE9Q414 Mir1a-2-201ENSMUST00000198520 72 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
ApobE9Q414 Gm10222-201ENSMUST00000088336 294 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
ApobE9Q414 Gm6020-201ENSMUST00000092094 66 ntAPPRIS P1 BASIC-3.14□□□□□ -2.91
ApobE9Q414 Gm27975-201ENSMUST00000184400 101 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
ApobE9Q414 Gm23352-201ENSMUST00000158428 64 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
ApobE9Q414 Snord80-202ENSMUST00000199023 77 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
ApobE9Q414 Gm22672-201ENSMUST00000104414 134 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
ApobE9Q414 Gm22677-201ENSMUST00000116977 108 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.91
ApobE9Q414 Mir669j-201ENSMUST00000179023 121 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.91
ApobE9Q414 Gm26109-201ENSMUST00000083970 70 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
ApobE9Q414 Gm28489-201ENSMUST00000186655 316 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
ApobE9Q414 Gm43810-201ENSMUST00000201018 232 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
ApobE9Q414 AC158537.2-201ENSMUST00000223575 150 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
ApobE9Q414 Gm43624-201ENSMUST00000197368 180 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
ApobE9Q414 Gm25111-201ENSMUST00000116686 147 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
ApobE9Q414 Gm25131-201ENSMUST00000082653 151 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
ApobE9Q414 Gm24517-201ENSMUST00000122560 107 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
ApobE9Q414 Gm25039-201ENSMUST00000082933 107 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
ApobE9Q414 Gm27905-201ENSMUST00000184005 207 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
ApobE9Q414 AC154296.2-201ENSMUST00000214696 545 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
ApobE9Q414 Gm26091-201ENSMUST00000122704 82 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
ApobE9Q414 Gm24504-201ENSMUST00000157679 100 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
ApobE9Q414 Gm42844-201ENSMUST00000200355 112 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
ApobE9Q414 Gm24315-201ENSMUST00000177835 127 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
ApobE9Q414 Gm22841-201ENSMUST00000158443 62 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
ApobE9Q414 Gm42606-201ENSMUST00000114209 239 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
ApobE9Q414 Gm22365-201ENSMUST00000093750 117 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
ApobE9Q414 Gm25982-201ENSMUST00000157920 101 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
ApobE9Q414 Gm10780-201ENSMUST00000099459 285 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
ApobE9Q414 Gm25061-201ENSMUST00000104665 107 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
ApobE9Q414 Snord42a-201ENSMUST00000082606 65 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
ApobE9Q414 Gm21836-201ENSMUST00000178787 63 ntAPPRIS P1 BASIC-3.25□□□□□ -2.93
ApobE9Q414 Gm23025-201ENSMUST00000158769 111 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
ApobE9Q414 AC154245.1-201ENSMUST00000224615 601 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
ApobE9Q414 Gm28211-201ENSMUST00000190920 315 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
ApobE9Q414 Gm22448-201ENSMUST00000179254 107 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
ApobE9Q414 Gm23003-201ENSMUST00000179948 107 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
ApobE9Q414 Gm24996-201ENSMUST00000158390 99 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
ApobE9Q414 Gm22973-201ENSMUST00000083298 191 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
ApobE9Q414 Snord72-201ENSMUST00000104549 81 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
ApobE9Q414 Gm24637-201ENSMUST00000158674 85 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
ApobE9Q414 Gm14293-201ENSMUST00000118528 577 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
ApobE9Q414 Gm25773-201ENSMUST00000116718 127 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
ApobE9Q414 Snord19-201ENSMUST00000104609 76 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
ApobE9Q414 Gm25720-201ENSMUST00000157503 105 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
ApobE9Q414 Gm22358-201ENSMUST00000082877 122 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
ApobE9Q414 Gm25188-201ENSMUST00000083913 122 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
ApobE9Q414 Mir6951-201ENSMUST00000183910 75 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
ApobE9Q414 Gm24259-201ENSMUST00000083740 107 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
ApobE9Q414 Gm25425-201ENSMUST00000157611 96 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
ApobE9Q414 Gm22879-201ENSMUST00000082895 74 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
ApobE9Q414 Gm22558-201ENSMUST00000157326 95 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
ApobE9Q414 Mir7227-201ENSMUST00000200408 59 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
ApobE9Q414 AC122320.1-201ENSMUST00000227233 105 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
ApobE9Q414 Mir297-1-201ENSMUST00000103800 76 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
ApobE9Q414 Gm22373-201ENSMUST00000104584 89 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
ApobE9Q414 Gm26306-201ENSMUST00000157773 119 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
ApobE9Q414 Gm26097-201ENSMUST00000179642 93 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
ApobE9Q414 Gm23793-201ENSMUST00000179396 117 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
ApobE9Q414 Gm27659-201ENSMUST00000183472 98 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
ApobE9Q414 Gm27957-201ENSMUST00000184054 127 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
ApobE9Q414 Gm22057-201ENSMUST00000083387 107 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
ApobE9Q414 Trgj1-201ENSMUST00000200495 60 ntAPPRIS P1 BASIC-3.34□□□□□ -2.94
ApobE9Q414 Olfr1139-ps1-201ENSMUST00000217634 168 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
ApobE9Q414 CT571266.1-201ENSMUST00000222859 153 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
ApobE9Q414 Gm17020-201ENSMUST00000172274 274 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
ApobE9Q414 Gm24099-201ENSMUST00000083384 107 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
ApobE9Q414 Gm25507-201ENSMUST00000116981 144 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
ApobE9Q414 Gm23819-201ENSMUST00000158744 109 ntBASIC-3.35□□□□□ -2.95
ApobE9Q414 Gm38298-201ENSMUST00000193578 118 ntBASIC-3.35□□□□□ -2.95
ApobE9Q414 Gm22101-201ENSMUST00000157928 103 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
ApobE9Q414 Gm25827-201ENSMUST00000157089 107 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
ApobE9Q414 Mir125b-1-201ENSMUST00000175613 77 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
ApobE9Q414 AL935138.1-201ENSMUST00000215309 196 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
ApobE9Q414 Gm44149-201ENSMUST00000204256 226 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
ApobE9Q414 Gm25623-201ENSMUST00000157216 108 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
ApobE9Q414 Gm23545-201ENSMUST00000158205 104 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
ApobE9Q414 Gm22605-201ENSMUST00000158289 108 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
ApobE9Q414 Gm23787-201ENSMUST00000122538 73 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
ApobE9Q414 Gm23145-201ENSMUST00000178912 79 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
ApobE9Q414 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
ApobE9Q414 Gm24810-201ENSMUST00000175317 70 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
ApobE9Q414 Gm24842-201ENSMUST00000158681 54 ntBASIC-3.39□□□□□ -2.95
ApobE9Q414 Gm45492-201ENSMUST00000211611 288 ntBASIC-3.39□□□□□ -2.95
ApobE9Q414 AL606472.1-201ENSMUST00000224628 275 ntBASIC-3.39□□□□□ -2.95
ApobE9Q414 Gm22985-201ENSMUST00000122754 116 ntBASIC-3.39□□□□□ -2.95
ApobE9Q414 Gm11333-201ENSMUST00000119479 148 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
ApobE9Q414 Gm22242-201ENSMUST00000175224 118 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
ApobE9Q414 Gm25648-201ENSMUST00000177844 79 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
ApobE9Q414 Gm22744-201ENSMUST00000083444 65 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
ApobE9Q414 Gm23212-201ENSMUST00000122718 60 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
ApobE9Q414 Gm24723-201ENSMUST00000158233 132 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
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