Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

Predictions only

Length 1,324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Snord72-201ENSMUST00000104549 81 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
Ccdc171E9Q1U1 Gm25978-201ENSMUST00000158698 90 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
Ccdc171E9Q1U1 Gm37646-201ENSMUST00000191756 111 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
Ccdc171E9Q1U1 AC140930.2-201ENSMUST00000221803 109 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
Ccdc171E9Q1U1 Gm23811-201ENSMUST00000175155 84 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
Ccdc171E9Q1U1 Gm22672-201ENSMUST00000104414 134 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
Ccdc171E9Q1U1 Gm25316-201ENSMUST00000116826 118 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
Ccdc171E9Q1U1 Gm26156-201ENSMUST00000116999 123 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
Ccdc171E9Q1U1 AC151902.2-201ENSMUST00000226419 301 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
Ccdc171E9Q1U1 Mir5117-201ENSMUST00000083226 84 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
Ccdc171E9Q1U1 Gm23990-201ENSMUST00000117031 117 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.83
Ccdc171E9Q1U1 Gm22402-201ENSMUST00000174920 110 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.83
Ccdc171E9Q1U1 Mir669a-7-201ENSMUST00000180364 87 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.83
Ccdc171E9Q1U1 Mir669a-6-201ENSMUST00000196127 87 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.83
Ccdc171E9Q1U1 Mir669a-12-201ENSMUST00000197274 87 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.83
Ccdc171E9Q1U1 Mir669a-5-201ENSMUST00000197439 87 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.83
Ccdc171E9Q1U1 Mir669a-10-201ENSMUST00000197745 87 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.83
Ccdc171E9Q1U1 Mir669a-11-201ENSMUST00000197952 87 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.83
Ccdc171E9Q1U1 Mir669a-4-201ENSMUST00000198665 87 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.83
Ccdc171E9Q1U1 Mir669a-9-201ENSMUST00000200087 87 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.83
Ccdc171E9Q1U1 Mir669a-8-201ENSMUST00000200268 87 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.83
Ccdc171E9Q1U1 Gm45492-201ENSMUST00000211611 288 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.83
Ccdc171E9Q1U1 Gm23730-201ENSMUST00000083236 107 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.83
Ccdc171E9Q1U1 Mir181b-1-201ENSMUST00000083524 80 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.83
Ccdc171E9Q1U1 Gm26109-201ENSMUST00000083970 70 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.83
Ccdc171E9Q1U1 Gm44347-201ENSMUST00000199602 108 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
Ccdc171E9Q1U1 Snord64-201ENSMUST00000104003 67 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
Ccdc171E9Q1U1 Gm27686-201ENSMUST00000185123 91 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
Ccdc171E9Q1U1 Gm28925-201ENSMUST00000188586 168 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
Ccdc171E9Q1U1 Gm22681-201ENSMUST00000083853 106 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
Ccdc171E9Q1U1 Gm24185-201ENSMUST00000122578 105 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
Ccdc171E9Q1U1 Gm22313-201ENSMUST00000158008 129 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
Ccdc171E9Q1U1 Gm24946-201ENSMUST00000158332 106 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
Ccdc171E9Q1U1 Mir7670-201ENSMUST00000183689 69 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
Ccdc171E9Q1U1 Gm25609-201ENSMUST00000104019 104 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
Ccdc171E9Q1U1 Gm23590-201ENSMUST00000157661 104 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
Ccdc171E9Q1U1 Gm22384-201ENSMUST00000158187 104 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
Ccdc171E9Q1U1 AC166341.8-201ENSMUST00000221267 108 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
Ccdc171E9Q1U1 Gm22205-201ENSMUST00000122655 71 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.85
Ccdc171E9Q1U1 Gm22558-201ENSMUST00000157326 95 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.85
Ccdc171E9Q1U1 Gm25322-201ENSMUST00000122556 104 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
Ccdc171E9Q1U1 AC158537.2-201ENSMUST00000223575 150 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
Ccdc171E9Q1U1 Gm25854-201ENSMUST00000082792 72 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
Ccdc171E9Q1U1 Gm22573-201ENSMUST00000082982 102 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
Ccdc171E9Q1U1 Gm23707-201ENSMUST00000104366 125 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
Ccdc171E9Q1U1 Mir466f-2-201ENSMUST00000104805 94 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
Ccdc171E9Q1U1 Gm26466-201ENSMUST00000179615 79 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
Ccdc171E9Q1U1 Gm22004-201ENSMUST00000101884 107 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
Ccdc171E9Q1U1 Gm23977-201ENSMUST00000177871 74 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
Ccdc171E9Q1U1 Gm24097-201ENSMUST00000178720 107 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
Ccdc171E9Q1U1 Gm25023-201ENSMUST00000082977 107 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
Ccdc171E9Q1U1 Gm22842-201ENSMUST00000157709 118 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
Ccdc171E9Q1U1 Gm25905-201ENSMUST00000158490 101 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
Ccdc171E9Q1U1 Gm26337-201ENSMUST00000178000 79 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
Ccdc171E9Q1U1 Gm44932-201ENSMUST00000206799 121 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
Ccdc171E9Q1U1 Mir351-201ENSMUST00000083569 99 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
Ccdc171E9Q1U1 Gm26375-201ENSMUST00000101829 106 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
Ccdc171E9Q1U1 Gm25087-201ENSMUST00000101992 78 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
Ccdc171E9Q1U1 Gm25552-201ENSMUST00000158081 91 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
Ccdc171E9Q1U1 Gm25903-201ENSMUST00000158492 103 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
Ccdc171E9Q1U1 Gm25646-201ENSMUST00000178527 79 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
Ccdc171E9Q1U1 Gm25696-201ENSMUST00000082900 105 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
Ccdc171E9Q1U1 Gm26467-201ENSMUST00000097257 78 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
Ccdc171E9Q1U1 Gm22775-201ENSMUST00000177630 120 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
Ccdc171E9Q1U1 Gm23569-201ENSMUST00000180120 120 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
Ccdc171E9Q1U1 Gm24492-201ENSMUST00000083798 107 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
Ccdc171E9Q1U1 Gm25425-201ENSMUST00000157611 96 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
Ccdc171E9Q1U1 Gm25297-201ENSMUST00000175490 67 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
Ccdc171E9Q1U1 Gm25644-201ENSMUST00000083209 107 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
Ccdc171E9Q1U1 CT030170.1-201ENSMUST00000222183 148 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
Ccdc171E9Q1U1 Gm24162-201ENSMUST00000093665 102 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
Ccdc171E9Q1U1 Gm26491-201ENSMUST00000179268 121 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
Ccdc171E9Q1U1 Gm27995-201ENSMUST00000184402 100 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
Ccdc171E9Q1U1 Gm10351-201ENSMUST00000087694 125 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
Ccdc171E9Q1U1 Gm23573-201ENSMUST00000104408 107 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
Ccdc171E9Q1U1 Gm23988-201ENSMUST00000117034 122 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
Ccdc171E9Q1U1 Gm24646-201ENSMUST00000157109 99 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
Ccdc171E9Q1U1 Gm26231-201ENSMUST00000175218 67 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
Ccdc171E9Q1U1 Gm42844-201ENSMUST00000200355 112 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
Ccdc171E9Q1U1 Trgj1-201ENSMUST00000200495 60 ntAPPRIS P1 BASIC-2.84□□□□□ -2.86
Ccdc171E9Q1U1 Gm23378-201ENSMUST00000082942 107 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
Ccdc171E9Q1U1 Gm24016-201ENSMUST00000157726 68 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
Ccdc171E9Q1U1 Gm24106-201ENSMUST00000175498 127 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
Ccdc171E9Q1U1 Gm22232-201ENSMUST00000104654 94 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
Ccdc171E9Q1U1 Mir466q-201ENSMUST00000175249 76 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
Ccdc171E9Q1U1 Gm25326-201ENSMUST00000101903 107 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
Ccdc171E9Q1U1 Gm26472-201ENSMUST00000116760 83 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
Ccdc171E9Q1U1 Gm22605-201ENSMUST00000158289 108 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
Ccdc171E9Q1U1 Gm25098-201ENSMUST00000177580 79 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
Ccdc171E9Q1U1 Gm23356-201ENSMUST00000177610 79 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
Ccdc171E9Q1U1 Gm24027-201ENSMUST00000177611 79 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
Ccdc171E9Q1U1 Gm22511-201ENSMUST00000177628 79 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
Ccdc171E9Q1U1 Gm22630-201ENSMUST00000177781 79 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
Ccdc171E9Q1U1 Gm23560-201ENSMUST00000177782 79 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
Ccdc171E9Q1U1 Gm25462-201ENSMUST00000177833 79 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
Ccdc171E9Q1U1 Gm26059-201ENSMUST00000177865 79 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
Ccdc171E9Q1U1 Gm25146-201ENSMUST00000177976 79 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
Ccdc171E9Q1U1 Gm25523-201ENSMUST00000178044 79 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
Ccdc171E9Q1U1 Gm24585-201ENSMUST00000178104 79 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
Ccdc171E9Q1U1 Gm22627-201ENSMUST00000178127 79 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 160.2 ms