Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm24823-201ENSMUST00000175092 91 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Grik3B1AS29 Gm25964-201ENSMUST00000157171 97 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
Grik3B1AS29 Gm24868-201ENSMUST00000157265 136 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
Grik3B1AS29 Gm22845-201ENSMUST00000157712 104 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
Grik3B1AS29 Gm24077-201ENSMUST00000158183 136 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
Grik3B1AS29 Gm23197-201ENSMUST00000158809 112 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Grik3B1AS29 Gm22413-201ENSMUST00000175465 85 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Grik3B1AS29 Gm24199-201ENSMUST00000157808 136 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
Grik3B1AS29 Gm25472-201ENSMUST00000175454 78 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
Grik3B1AS29 Gm45125-201ENSMUST00000206908 151 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
Grik3B1AS29 Gm39149-201ENSMUST00000210258 186 ntTSL 5 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
Grik3B1AS29 Gm22354-201ENSMUST00000083919 70 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
Grik3B1AS29 Gm22157-201ENSMUST00000158410 104 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
Grik3B1AS29 Gm25137-201ENSMUST00000083251 110 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
Grik3B1AS29 Gm25879-201ENSMUST00000104330 107 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
Grik3B1AS29 Gm22489-201ENSMUST00000116813 62 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
Grik3B1AS29 Gm22729-201ENSMUST00000158088 129 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
Grik3B1AS29 Gm25641-201ENSMUST00000175135 108 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
Grik3B1AS29 Snord42b-201ENSMUST00000083742 69 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
Grik3B1AS29 Mir96-201ENSMUST00000083652 106 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
Grik3B1AS29 Gm27263-201ENSMUST00000184760 76 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
Grik3B1AS29 Gm26499-201ENSMUST00000178544 79 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Grik3B1AS29 Gm26096-201ENSMUST00000179084 79 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Grik3B1AS29 Gm22251-201ENSMUST00000083216 107 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Grik3B1AS29 Gm25542-201ENSMUST00000116889 94 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Grik3B1AS29 Gm22165-201ENSMUST00000158414 103 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Grik3B1AS29 Gm27554-201ENSMUST00000185074 98 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Grik3B1AS29 Snora16a-201ENSMUST00000083163 136 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Grik3B1AS29 Gm25644-201ENSMUST00000083209 107 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Grik3B1AS29 Mir717-201ENSMUST00000102259 109 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
Grik3B1AS29 Gm23017-201ENSMUST00000177583 72 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
Grik3B1AS29 Gm22458-201ENSMUST00000082576 107 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
Grik3B1AS29 Gm25440-201ENSMUST00000158279 154 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Grik3B1AS29 Gm22429-201ENSMUST00000158553 130 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Grik3B1AS29 Gm22454-201ENSMUST00000082583 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Grik3B1AS29 Gm25854-201ENSMUST00000082792 72 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Grik3B1AS29 Gm24377-201ENSMUST00000104398 131 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Grik3B1AS29 Gm25061-201ENSMUST00000104665 107 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Grik3B1AS29 Gm25112-201ENSMUST00000122680 104 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Grik3B1AS29 AC167019.1-201ENSMUST00000227913 106 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Grik3B1AS29 Gm25740-201ENSMUST00000180247 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Grik3B1AS29 Snord45b-201ENSMUST00000082797 71 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Grik3B1AS29 Gm24296-201ENSMUST00000158297 106 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Grik3B1AS29 AC158537.2-201ENSMUST00000223575 150 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Grik3B1AS29 Gm22805-201ENSMUST00000082739 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Grik3B1AS29 Mir344h-1-201ENSMUST00000174922 60 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Grik3B1AS29 Mir344h-2-201ENSMUST00000175612 60 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Grik3B1AS29 Mir183-201ENSMUST00000083685 70 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Grik3B1AS29 Mir378c-201ENSMUST00000184478 99 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Grik3B1AS29 CT571266.1-201ENSMUST00000222859 153 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Grik3B1AS29 Gm22539-201ENSMUST00000158167 117 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Grik3B1AS29 Gm6293-201ENSMUST00000050339 195 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Grik3B1AS29 Gm23038-201ENSMUST00000083873 104 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Grik3B1AS29 Mir876-201ENSMUST00000104659 81 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Grik3B1AS29 Gm25388-201ENSMUST00000157339 151 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Grik3B1AS29 Gm24201-201ENSMUST00000082946 125 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Grik3B1AS29 Gm22827-201ENSMUST00000083766 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Grik3B1AS29 Gm25417-201ENSMUST00000104212 131 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Grik3B1AS29 Mir574-201ENSMUST00000103854 78 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
Grik3B1AS29 Gm27415-201ENSMUST00000183720 95 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
Grik3B1AS29 Gm25022-201ENSMUST00000102205 83 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Grik3B1AS29 Gm24336-201ENSMUST00000104203 146 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Grik3B1AS29 Mir467a-6-201ENSMUST00000177790 83 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Grik3B1AS29 Mir467a-3-201ENSMUST00000178082 83 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Grik3B1AS29 Mir467a-7-201ENSMUST00000178635 83 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Grik3B1AS29 Gm23306-201ENSMUST00000179058 105 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Grik3B1AS29 Mir467a-10-201ENSMUST00000179320 83 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Grik3B1AS29 Mir467a-5-201ENSMUST00000179352 83 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Grik3B1AS29 Mir467a-2-201ENSMUST00000179447 83 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Grik3B1AS29 Mir467a-9-201ENSMUST00000179752 83 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Grik3B1AS29 Mir467a-4-201ENSMUST00000179923 83 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Grik3B1AS29 Mir467a-8-201ENSMUST00000180070 83 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Grik3B1AS29 Gm27884-201ENSMUST00000183865 76 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Grik3B1AS29 Mir148a-201ENSMUST00000083571 99 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Grik3B1AS29 Gm23652-201ENSMUST00000116752 107 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
Grik3B1AS29 n-R5s8-201ENSMUST00000104121 118 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
Grik3B1AS29 Gm24372-201ENSMUST00000104400 110 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
Grik3B1AS29 Gm24988-201ENSMUST00000104460 121 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
Grik3B1AS29 Gm24400-201ENSMUST00000157865 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
Grik3B1AS29 Gm27987-201ENSMUST00000184023 93 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
Grik3B1AS29 Gm22298-201ENSMUST00000082662 133 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
Grik3B1AS29 Mir103-1-201ENSMUST00000083619 86 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
Grik3B1AS29 Mir18b-201ENSMUST00000103923 83 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
Grik3B1AS29 Gm22595-201ENSMUST00000104250 130 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
Grik3B1AS29 Gm22950-201ENSMUST00000082776 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
Grik3B1AS29 Snord50a-201ENSMUST00000178154 72 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
Grik3B1AS29 Gm24463-201ENSMUST00000178417 72 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
Grik3B1AS29 Gm27610-201ENSMUST00000184026 74 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
Grik3B1AS29 Gm11333-201ENSMUST00000119479 148 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
Grik3B1AS29 Cyp2j7-ps1-201ENSMUST00000122430 173 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
Grik3B1AS29 Gm23590-201ENSMUST00000157661 104 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
Grik3B1AS29 Gm24971-201ENSMUST00000175581 110 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
Grik3B1AS29 Gm11084-201ENSMUST00000112062 69 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
Grik3B1AS29 Gm37832-201ENSMUST00000118935 189 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Grik3B1AS29 Gm26104-201ENSMUST00000157250 108 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Grik3B1AS29 Gm23570-201ENSMUST00000083029 104 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Grik3B1AS29 Mir1950-201ENSMUST00000158526 74 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Grik3B1AS29 Gm27784-201ENSMUST00000184926 113 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Grik3B1AS29 Gm44932-201ENSMUST00000206799 121 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Grik3B1AS29 Gm24946-201ENSMUST00000158332 106 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.3 ms