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Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C5
Mtm1, Myotubularin, mouse
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603 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (Experimental data)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
Mtm1
Q9Z2C5
Gm23622-201
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107 nt
BASIC
0.57
□□□□□ -2.32
Mtm1
Q9Z2C5
Gm22302-201
ENSMUST00000082657
106 nt
BASIC
0.57
□□□□□ -2.32
Mtm1
Q9Z2C5
Gm22720-201
ENSMUST00000122710
87 nt
BASIC
0.56
□□□□□ -2.32
Mtm1
Q9Z2C5
Gm44803-201
ENSMUST00000204384
156 nt
BASIC
0.56
□□□□□ -2.32
Mtm1
Q9Z2C5
Traj9-201
ENSMUST00000103731
58 nt
APPRIS P1
BASIC
0.55
□□□□□ -2.32
Mtm1
Q9Z2C5
Gm11333-201
ENSMUST00000119479
148 nt
BASIC
0.55
□□□□□ -2.32
Mtm1
Q9Z2C5
Gm24946-201
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106 nt
BASIC
0.55
□□□□□ -2.32
Mtm1
Q9Z2C5
Mir216a-201
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72 nt
BASIC
0.55
□□□□□ -2.32
Mtm1
Q9Z2C5
Gm23020-201
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253 nt
BASIC
0.54
□□□□□ -2.32
Mtm1
Q9Z2C5
Gm25296-201
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BASIC
0.54
□□□□□ -2.32
Mtm1
Q9Z2C5
Gm23056-201
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BASIC
0.54
□□□□□ -2.32
Mtm1
Q9Z2C5
Mir34c-201
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77 nt
BASIC
0.54
□□□□□ -2.32
Mtm1
Q9Z2C5
Gm23347-201
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82 nt
BASIC
0.54
□□□□□ -2.32
Mtm1
Q9Z2C5
Gm43432-201
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BASIC
0.53
□□□□□ -2.32
Mtm1
Q9Z2C5
mt-Tw-201
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BASIC
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□□□□□ -2.32
Mtm1
Q9Z2C5
Gm27937-201
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88 nt
BASIC
0.52
□□□□□ -2.33
Mtm1
Q9Z2C5
AC129019.2-201
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202 nt
BASIC
0.52
□□□□□ -2.33
Mtm1
Q9Z2C5
Gm23293-201
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104 nt
BASIC
0.52
□□□□□ -2.33
Mtm1
Q9Z2C5
Gm23376-201
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160 nt
BASIC
0.52
□□□□□ -2.33
Mtm1
Q9Z2C5
Mir18-201
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96 nt
BASIC
0.52
□□□□□ -2.33
Mtm1
Q9Z2C5
Mir7673-201
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64 nt
BASIC
0.51
□□□□□ -2.33
Mtm1
Q9Z2C5
Traj42-201
ENSMUST00000103700
64 nt
APPRIS P1
BASIC
0.5
□□□□□ -2.33
Mtm1
Q9Z2C5
Gm23783-201
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102 nt
BASIC
0.5
□□□□□ -2.33
Mtm1
Q9Z2C5
Gm22983-201
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104 nt
BASIC
0.5
□□□□□ -2.33
Mtm1
Q9Z2C5
Gm22943-201
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76 nt
BASIC
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□□□□□ -2.33
Mtm1
Q9Z2C5
Gm22981-201
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BASIC
0.5
□□□□□ -2.33
Mtm1
Q9Z2C5
Gm25787-201
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92 nt
BASIC
0.49
□□□□□ -2.33
Mtm1
Q9Z2C5
Gm22431-201
ENSMUST00000158545
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BASIC
0.49
□□□□□ -2.33
Mtm1
Q9Z2C5
Mir7079-201
ENSMUST00000184697
69 nt
BASIC
0.49
□□□□□ -2.33
Mtm1
Q9Z2C5
Mir1197-201
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120 nt
BASIC
0.48
□□□□□ -2.33
Mtm1
Q9Z2C5
Gm25641-201
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108 nt
BASIC
0.48
□□□□□ -2.33
Mtm1
Q9Z2C5
Gm27554-201
ENSMUST00000185074
98 nt
BASIC
0.48
□□□□□ -2.33
Mtm1
Q9Z2C5
Mir3065-201
ENSMUST00000198674
87 nt
BASIC
0.48
□□□□□ -2.33
Mtm1
Q9Z2C5
Traj34-201
ENSMUST00000103707
58 nt
APPRIS P1
BASIC
0.47
□□□□□ -2.33
Mtm1
Q9Z2C5
Mir876-201
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BASIC
0.47
□□□□□ -2.33
Mtm1
Q9Z2C5
Gm22459-201
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108 nt
BASIC
0.47
□□□□□ -2.33
Mtm1
Q9Z2C5
Rab11fip4os2-202
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355 nt
TSL 1 (best)
BASIC
0.46
□□□□□ -2.34
Mtm1
Q9Z2C5
Gm23672-201
ENSMUST00000157471
107 nt
BASIC
0.45
□□□□□ -2.34
Mtm1
Q9Z2C5
Mir3071-201
ENSMUST00000093621
80 nt
BASIC
0.45
□□□□□ -2.34
Mtm1
Q9Z2C5
Snord67-201
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BASIC
0.44
□□□□□ -2.34
Mtm1
Q9Z2C5
Gm27977-201
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111 nt
BASIC
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□□□□□ -2.34
Mtm1
Q9Z2C5
Gm25161-201
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132 nt
BASIC
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□□□□□ -2.34
Mtm1
Q9Z2C5
Mir3064-201
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67 nt
BASIC
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□□□□□ -2.34
Mtm1
Q9Z2C5
Gm11111-201
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APPRIS P1
TSL 5
BASIC
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□□□□□ -2.34
Mtm1
Q9Z2C5
Scarna8-201
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131 nt
BASIC
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□□□□□ -2.34
Mtm1
Q9Z2C5
Gm25010-201
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BASIC
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□□□□□ -2.34
Mtm1
Q9Z2C5
Gm44828-201
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BASIC
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□□□□□ -2.34
Mtm1
Q9Z2C5
Gm43885-201
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BASIC
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□□□□□ -2.34
Mtm1
Q9Z2C5
Gm22759-201
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BASIC
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□□□□□ -2.34
Mtm1
Q9Z2C5
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BASIC
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□□□□□ -2.34
Mtm1
Q9Z2C5
Gm21836-201
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63 nt
APPRIS P1
BASIC
0.41
□□□□□ -2.34
Mtm1
Q9Z2C5
Gm23726-201
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BASIC
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□□□□□ -2.34
Mtm1
Q9Z2C5
Gm27475-201
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61 nt
BASIC
0.41
□□□□□ -2.34
Mtm1
Q9Z2C5
Gm24070-201
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BASIC
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□□□□□ -2.35
Mtm1
Q9Z2C5
Gm23477-201
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BASIC
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□□□□□ -2.35
Mtm1
Q9Z2C5
Gm22455-201
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BASIC
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□□□□□ -2.35
Mtm1
Q9Z2C5
Gm23969-201
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BASIC
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□□□□□ -2.35
Mtm1
Q9Z2C5
Gm25275-201
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BASIC
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□□□□□ -2.35
Mtm1
Q9Z2C5
Gm24555-201
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BASIC
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Mtm1
Q9Z2C5
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BASIC
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□□□□□ -2.35
Mtm1
Q9Z2C5
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BASIC
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□□□□□ -2.35
Mtm1
Q9Z2C5
Gm28001-201
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BASIC
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□□□□□ -2.35
Mtm1
Q9Z2C5
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BASIC
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□□□□□ -2.35
Mtm1
Q9Z2C5
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BASIC
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□□□□□ -2.35
Mtm1
Q9Z2C5
Gm39149-201
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TSL 5
BASIC
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□□□□□ -2.35
Mtm1
Q9Z2C5
Gm25440-201
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BASIC
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Mtm1
Q9Z2C5
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BASIC
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□□□□□ -2.35
Mtm1
Q9Z2C5
Gm22095-201
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BASIC
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□□□□□ -2.35
Mtm1
Q9Z2C5
Gm26116-201
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□□□□□ -2.35
Mtm1
Q9Z2C5
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BASIC
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□□□□□ -2.35
Mtm1
Q9Z2C5
Gm24796-201
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BASIC
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□□□□□ -2.36
Mtm1
Q9Z2C5
Gm22087-201
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BASIC
0.34
□□□□□ -2.36
Mtm1
Q9Z2C5
Gm37750-201
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BASIC
0.34
□□□□□ -2.36
Mtm1
Q9Z2C5
Gm45125-201
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BASIC
0.34
□□□□□ -2.36
Mtm1
Q9Z2C5
Gm25309-201
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BASIC
0.33
□□□□□ -2.36
Mtm1
Q9Z2C5
Gm23761-201
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104 nt
BASIC
0.33
□□□□□ -2.36
Mtm1
Q9Z2C5
Trgj1-201
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APPRIS P1
BASIC
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□□□□□ -2.36
Mtm1
Q9Z2C5
Mir23a-201
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BASIC
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□□□□□ -2.36
Mtm1
Q9Z2C5
Gm25247-201
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90 nt
BASIC
0.32
□□□□□ -2.36
Mtm1
Q9Z2C5
Gm24833-201
ENSMUST00000116775
120 nt
BASIC
0.31
□□□□□ -2.36
Mtm1
Q9Z2C5
Gm22067-201
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107 nt
BASIC
0.31
□□□□□ -2.36
Mtm1
Q9Z2C5
Gm22340-201
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BASIC
0.31
□□□□□ -2.36
Mtm1
Q9Z2C5
Gm26485-201
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BASIC
0.31
□□□□□ -2.36
Mtm1
Q9Z2C5
Gm25522-201
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105 nt
BASIC
0.31
□□□□□ -2.36
Mtm1
Q9Z2C5
Mir7077-201
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BASIC
0.31
□□□□□ -2.36
Mtm1
Q9Z2C5
Gm45617-201
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BASIC
0.31
□□□□□ -2.36
Mtm1
Q9Z2C5
mt-Tl2-201
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71 nt
BASIC
0.31
□□□□□ -2.36
Mtm1
Q9Z2C5
n-R5s96-201
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124 nt
BASIC
0.31
□□□□□ -2.36
Mtm1
Q9Z2C5
Snord45b-201
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71 nt
BASIC
0.31
□□□□□ -2.36
Mtm1
Q9Z2C5
Gm24918-201
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BASIC
0.31
□□□□□ -2.36
Mtm1
Q9Z2C5
Mir297-1-201
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76 nt
BASIC
0.3
□□□□□ -2.36
Mtm1
Q9Z2C5
Gm26152-201
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BASIC
0.3
□□□□□ -2.36
Mtm1
Q9Z2C5
Mir15b-201
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BASIC
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□□□□□ -2.36
Mtm1
Q9Z2C5
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BASIC
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□□□□□ -2.36
Mtm1
Q9Z2C5
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BASIC
0.29
□□□□□ -2.36
Mtm1
Q9Z2C5
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BASIC
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□□□□□ -2.36
Mtm1
Q9Z2C5
Svbp-204
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150 nt
TSL 5
BASIC
0.29
□□□□□ -2.36
Mtm1
Q9Z2C5
Snora62-201
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149 nt
BASIC
0.29
□□□□□ -2.36
Mtm1
Q9Z2C5
Gm25186-201
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BASIC
0.28
□□□□□ -2.36
Mtm1
Q9Z2C5
Mir717-201
ENSMUST00000102259
109 nt
BASIC
0.27
□□□□□ -2.37
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