Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm27975-201ENSMUST00000184400 101 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Sh3bp1P55194 Gm26441-201ENSMUST00000082590 104 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Sh3bp1P55194 Gm25703-201ENSMUST00000083123 151 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Sh3bp1P55194 Snord85-201ENSMUST00000083262 73 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Sh3bp1P55194 Gm22962-201ENSMUST00000157962 73 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Sh3bp1P55194 Gm45374-201ENSMUST00000211388 136 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Sh3bp1P55194 Gm22838-201ENSMUST00000158437 99 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Sh3bp1P55194 Mir6904-201ENSMUST00000183443 67 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Sh3bp1P55194 Gm22455-201ENSMUST00000082580 71 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Sh3bp1P55194 Gm25322-201ENSMUST00000122556 104 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Sh3bp1P55194 Gm24650-201ENSMUST00000157105 103 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Sh3bp1P55194 Gm22327-201ENSMUST00000158899 108 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Sh3bp1P55194 Gm23159-201ENSMUST00000175088 77 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Sh3bp1P55194 Gm27549-201ENSMUST00000183508 62 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Sh3bp1P55194 Mir6915-201ENSMUST00000198839 69 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Sh3bp1P55194 Gm26359-201ENSMUST00000158873 101 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Sh3bp1P55194 AC129019.2-201ENSMUST00000222063 202 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Sh3bp1P55194 Gm22354-201ENSMUST00000083919 70 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Sh3bp1P55194 Gm25619-201ENSMUST00000122621 104 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Sh3bp1P55194 Gm23468-201ENSMUST00000157125 108 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Sh3bp1P55194 Ranbp2-ps1-201ENSMUST00000184001 403 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Sh3bp1P55194 CT030166.3-201ENSMUST00000223203 193 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Sh3bp1P55194 n-R5s42-201ENSMUST00000082697 104 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Sh3bp1P55194 Gm24162-201ENSMUST00000093665 102 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Sh3bp1P55194 Mir191-201ENSMUST00000196210 74 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Sh3bp1P55194 Gm25275-201ENSMUST00000104297 129 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Sh3bp1P55194 Gm23715-201ENSMUST00000157354 106 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Sh3bp1P55194 Gm22729-201ENSMUST00000158088 129 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Sh3bp1P55194 Gm23442-201ENSMUST00000082919 134 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Sh3bp1P55194 Gm24134-201ENSMUST00000083361 71 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Sh3bp1P55194 Mir672-201ENSMUST00000102331 100 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Sh3bp1P55194 Mir344-2-201ENSMUST00000175446 80 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Sh3bp1P55194 Mir126a-201ENSMUST00000083606 73 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Sh3bp1P55194 Gm24256-201ENSMUST00000083696 84 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Sh3bp1P55194 Gm14947-201ENSMUST00000133704 303 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Sh3bp1P55194 Gm45655-201ENSMUST00000211625 160 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Sh3bp1P55194 Mir3071-201ENSMUST00000093621 80 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Sh3bp1P55194 Gm22087-201ENSMUST00000158339 88 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Sh3bp1P55194 Gm22942-201ENSMUST00000158563 124 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Sh3bp1P55194 Gm25964-201ENSMUST00000157171 97 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Sh3bp1P55194 Gm22429-201ENSMUST00000158553 130 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Sh3bp1P55194 Gm25772-201ENSMUST00000158574 56 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Sh3bp1P55194 Mir7673-201ENSMUST00000184567 64 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Sh3bp1P55194 Gm25186-201ENSMUST00000083909 108 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Sh3bp1P55194 n-R5s171-201ENSMUST00000104128 79 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Sh3bp1P55194 Gm24843-201ENSMUST00000158682 76 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Sh3bp1P55194 mt-Tl1-201ENSMUST00000082391 75 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Sh3bp1P55194 Gm25522-201ENSMUST00000158394 105 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Sh3bp1P55194 Gm27977-201ENSMUST00000185159 111 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Sh3bp1P55194 Mir327-201ENSMUST00000199328 69 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Sh3bp1P55194 Gm26210-201ENSMUST00000158680 91 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Sh3bp1P55194 Mir3470a-201ENSMUST00000175223 77 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Sh3bp1P55194 Mir7651-201ENSMUST00000184154 64 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Sh3bp1P55194 Gm45688-201ENSMUST00000210002 101 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Sh3bp1P55194 Mir214-201ENSMUST00000083582 110 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Sh3bp1P55194 Gm22757-201ENSMUST00000102279 96 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Sh3bp1P55194 Gm44375-201ENSMUST00000196657 150 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Sh3bp1P55194 Gm22454-201ENSMUST00000082583 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Sh3bp1P55194 Gm24064-201ENSMUST00000157486 106 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Sh3bp1P55194 Gm27937-201ENSMUST00000183605 88 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Sh3bp1P55194 Gm22813-201ENSMUST00000199948 123 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Sh3bp1P55194 Gm22459-201ENSMUST00000082577 108 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Sh3bp1P55194 Mir741-201ENSMUST00000103931 71 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Sh3bp1P55194 Gm25609-201ENSMUST00000104019 104 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Sh3bp1P55194 Gm25108-201ENSMUST00000122473 78 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Sh3bp1P55194 Gm24868-201ENSMUST00000157265 136 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Sh3bp1P55194 Gm24199-201ENSMUST00000157808 136 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Sh3bp1P55194 Gm24077-201ENSMUST00000158183 136 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Sh3bp1P55194 Gm25798-201ENSMUST00000082641 107 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Sh3bp1P55194 Mir142b-201ENSMUST00000083486 115 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Sh3bp1P55194 Traj38-201ENSMUST00000103704 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
Sh3bp1P55194 Gm23652-201ENSMUST00000116752 107 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Sh3bp1P55194 Gm22413-201ENSMUST00000175465 85 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Sh3bp1P55194 Snora26-201ENSMUST00000175614 121 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Sh3bp1P55194 Gm22458-201ENSMUST00000082576 107 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Sh3bp1P55194 Gm22251-201ENSMUST00000083216 107 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Sh3bp1P55194 Mirlet7d-201ENSMUST00000083519 103 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Sh3bp1P55194 Snord91a-201ENSMUST00000104305 93 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Sh3bp1P55194 Gm6607-201ENSMUST00000215035 328 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Sh3bp1P55194 Mir23a-201ENSMUST00000083677 75 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Sh3bp1P55194 Gm24587-201ENSMUST00000116697 89 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Sh3bp1P55194 Gm25596-201ENSMUST00000178368 107 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Sh3bp1P55194 Snord49b-201ENSMUST00000082503 72 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Sh3bp1P55194 Gm25802-201ENSMUST00000082639 77 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Sh3bp1P55194 Mir487b-201ENSMUST00000102265 82 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Sh3bp1P55194 Gm25542-201ENSMUST00000116889 94 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Sh3bp1P55194 CT571266.1-201ENSMUST00000222859 153 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Sh3bp1P55194 Gm22950-201ENSMUST00000082776 107 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Sh3bp1P55194 Gm25149-201ENSMUST00000157119 82 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Sh3bp1P55194 Gm22607-201ENSMUST00000158291 105 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Sh3bp1P55194 Gm26499-201ENSMUST00000178544 79 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Sh3bp1P55194 Gm26096-201ENSMUST00000179084 79 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Sh3bp1P55194 Gm25740-201ENSMUST00000180247 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Sh3bp1P55194 AL845349.1-201ENSMUST00000213794 78 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Sh3bp1P55194 Gm22805-201ENSMUST00000082739 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Sh3bp1P55194 Snora62-201ENSMUST00000082991 149 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Sh3bp1P55194 Gm25644-201ENSMUST00000083209 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Sh3bp1P55194 Gm23038-201ENSMUST00000083873 104 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Sh3bp1P55194 Gm25112-201ENSMUST00000122680 104 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Sh3bp1P55194 Gm27735-201ENSMUST00000185085 76 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 154.9 ms