Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Gm24612-201ENSMUST00000083267 107 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
Zfp558E9Q1J0 Mir7-1-201ENSMUST00000083500 108 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
Zfp558E9Q1J0 Gm23909-201ENSMUST00000104598 131 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
Zfp558E9Q1J0 Mir466h-201ENSMUST00000104748 81 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
Zfp558E9Q1J0 Gm26156-201ENSMUST00000116999 123 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
Zfp558E9Q1J0 Gm43749-201ENSMUST00000199345 352 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
Zfp558E9Q1J0 Gm43038-201ENSMUST00000202359 88 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
Zfp558E9Q1J0 AC166341.8-201ENSMUST00000221267 108 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
Zfp558E9Q1J0 Gm24459-201ENSMUST00000082730 86 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
Zfp558E9Q1J0 Mir5117-201ENSMUST00000083226 84 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
Zfp558E9Q1J0 Gm25641-201ENSMUST00000175135 108 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
Zfp558E9Q1J0 Gm38298-201ENSMUST00000193578 118 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
Zfp558E9Q1J0 Mir6375-201ENSMUST00000197176 95 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
Zfp558E9Q1J0 Snord47-201ENSMUST00000083034 77 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
Zfp558E9Q1J0 Snord57-201ENSMUST00000083338 72 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
Zfp558E9Q1J0 Gm25493-201ENSMUST00000157375 103 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
Zfp558E9Q1J0 Gm25429-201ENSMUST00000157607 132 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
Zfp558E9Q1J0 Gm23316-201ENSMUST00000157997 114 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
Zfp558E9Q1J0 Gm25158-201ENSMUST00000177681 121 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
Zfp558E9Q1J0 Gm26229-201ENSMUST00000179699 121 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
Zfp558E9Q1J0 Mir466b-3-201ENSMUST00000103806 81 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
Zfp558E9Q1J0 Gm24263-201ENSMUST00000104059 107 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
Zfp558E9Q1J0 Gm22430-201ENSMUST00000158546 107 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
Zfp558E9Q1J0 Gm42844-201ENSMUST00000200355 112 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
Zfp558E9Q1J0 Mir5619-201ENSMUST00000176065 61 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
Zfp558E9Q1J0 mt-Tt-201ENSMUST00000082422 67 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
Zfp558E9Q1J0 Gm24203-201ENSMUST00000082949 114 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
Zfp558E9Q1J0 Gm22828-201ENSMUST00000083768 107 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
Zfp558E9Q1J0 Gm22205-201ENSMUST00000122655 71 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
Zfp558E9Q1J0 Igkv13-78-1-201ENSMUST00000199298 200 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
Zfp558E9Q1J0 Gm25964-201ENSMUST00000157171 97 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
Zfp558E9Q1J0 Gm26104-201ENSMUST00000157250 108 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
Zfp558E9Q1J0 Gm24400-201ENSMUST00000157865 107 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
Zfp558E9Q1J0 Gm27554-201ENSMUST00000185074 98 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
Zfp558E9Q1J0 Gm25696-201ENSMUST00000082900 105 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
Zfp558E9Q1J0 Gm23651-201ENSMUST00000116755 120 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
Zfp558E9Q1J0 Gm14837-201ENSMUST00000119688 206 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
Zfp558E9Q1J0 Mir1969-201ENSMUST00000157623 94 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
Zfp558E9Q1J0 Gm25601-201ENSMUST00000158356 105 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
Zfp558E9Q1J0 Gm37746-201ENSMUST00000193249 198 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
Zfp558E9Q1J0 Gm24750-201ENSMUST00000157843 104 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
Zfp558E9Q1J0 Gm25626-201ENSMUST00000177631 107 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
Zfp558E9Q1J0 Gm27332-201ENSMUST00000184893 112 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
Zfp558E9Q1J0 Gm25609-201ENSMUST00000104019 104 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
Zfp558E9Q1J0 Gm22413-201ENSMUST00000175465 85 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
Zfp558E9Q1J0 Mir7086-201ENSMUST00000183683 65 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
Zfp558E9Q1J0 Gm22973-201ENSMUST00000083298 191 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
Zfp558E9Q1J0 Gm26124-201ENSMUST00000083359 108 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
Zfp558E9Q1J0 Mir494-201ENSMUST00000093632 85 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
Zfp558E9Q1J0 Gm25417-201ENSMUST00000104212 131 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
Zfp558E9Q1J0 Gm22429-201ENSMUST00000158553 130 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
Zfp558E9Q1J0 Gm44470-201ENSMUST00000203913 142 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
Zfp558E9Q1J0 Traj43-201ENSMUST00000103699 57 ntAPPRIS P1 BASIC-1.58□□□□□ -2.66
Zfp558E9Q1J0 Gm21961-201ENSMUST00000110100 114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-1.58□□□□□ -2.66
Zfp558E9Q1J0 Gm24775-201ENSMUST00000157377 99 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
Zfp558E9Q1J0 Gm22258-201ENSMUST00000177645 94 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
Zfp558E9Q1J0 Gm26337-201ENSMUST00000178000 79 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
Zfp558E9Q1J0 Gm26032-201ENSMUST00000178535 94 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
Zfp558E9Q1J0 Gm25210-201ENSMUST00000178813 94 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
Zfp558E9Q1J0 Gm25157-201ENSMUST00000178914 94 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
Zfp558E9Q1J0 Gm22046-201ENSMUST00000179027 94 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
Zfp558E9Q1J0 Gm22941-201ENSMUST00000179630 94 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
Zfp558E9Q1J0 Gm25471-201ENSMUST00000180126 94 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
Zfp558E9Q1J0 Gm11084-201ENSMUST00000112062 69 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-1.59□□□□□ -2.66
Zfp558E9Q1J0 Gm25316-201ENSMUST00000116826 118 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
Zfp558E9Q1J0 Gm25322-201ENSMUST00000122556 104 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
Zfp558E9Q1J0 Gm25862-201ENSMUST00000158250 129 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
Zfp558E9Q1J0 Gm23864-201ENSMUST00000177607 107 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
Zfp558E9Q1J0 Gm22454-201ENSMUST00000082583 107 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
Zfp558E9Q1J0 Gm22677-201ENSMUST00000116977 108 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
Zfp558E9Q1J0 Gm25565-201ENSMUST00000104605 105 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
Zfp558E9Q1J0 Gm22197-201ENSMUST00000116866 58 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
Zfp558E9Q1J0 Gm23434-201ENSMUST00000157179 100 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
Zfp558E9Q1J0 Gm23306-201ENSMUST00000179058 105 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
Zfp558E9Q1J0 Gm25449-201ENSMUST00000179389 79 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
Zfp558E9Q1J0 Mir451b-201ENSMUST00000196157 72 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
Zfp558E9Q1J0 Gm22605-201ENSMUST00000158289 108 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
Zfp558E9Q1J0 Gm22770-201ENSMUST00000158368 67 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
Zfp558E9Q1J0 Gm25678-201ENSMUST00000174984 73 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
Zfp558E9Q1J0 Gm23922-201ENSMUST00000178792 79 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
Zfp558E9Q1J0 Gm24657-201ENSMUST00000180085 79 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
Zfp558E9Q1J0 Gm22996-201ENSMUST00000180236 79 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
Zfp558E9Q1J0 Gm17522-202ENSMUST00000186631 174 ntTSL 1 (best) BASIC-1.64□□□□□ -2.67
Zfp558E9Q1J0 Gm17412-202ENSMUST00000189566 174 ntTSL 1 (best) BASIC-1.64□□□□□ -2.67
Zfp558E9Q1J0 Gm10351-201ENSMUST00000087694 125 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
Zfp558E9Q1J0 Gm23590-201ENSMUST00000157661 104 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
Zfp558E9Q1J0 Gm24162-201ENSMUST00000093665 102 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
Zfp558E9Q1J0 Gm27935-201ENSMUST00000183894 79 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
Zfp558E9Q1J0 Gm27975-201ENSMUST00000184400 101 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
Zfp558E9Q1J0 Gm23970-201ENSMUST00000083319 107 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
Zfp558E9Q1J0 Gm24988-201ENSMUST00000104460 121 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
Zfp558E9Q1J0 Gm24637-201ENSMUST00000158674 85 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
Zfp558E9Q1J0 Olfr1041-ps1-201ENSMUST00000215884 271 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
Zfp558E9Q1J0 Gm26454-201ENSMUST00000082682 107 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
Zfp558E9Q1J0 AC122210.2-201ENSMUST00000220216 115 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
Zfp558E9Q1J0 AC122327.1-201ENSMUST00000220778 108 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
Zfp558E9Q1J0 Gm26225-201ENSMUST00000082508 135 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
Zfp558E9Q1J0 Gm23988-201ENSMUST00000117034 122 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
Zfp558E9Q1J0 Gm26425-201ENSMUST00000122529 82 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
Zfp558E9Q1J0 Gm24916-201ENSMUST00000157287 79 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 221.1 ms