Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Scarna3a-201ENSMUST00000158911 140 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RpainQ9CWY9 Gm24271-201ENSMUST00000102327 111 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RpainQ9CWY9 Gm29432-201ENSMUST00000185397 139 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RpainQ9CWY9 Snord45b-201ENSMUST00000082797 71 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RpainQ9CWY9 Mir494-201ENSMUST00000093632 85 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RpainQ9CWY9 Mir297-1-201ENSMUST00000103800 76 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RpainQ9CWY9 Mir6394-201ENSMUST00000184738 99 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RpainQ9CWY9 Gm45655-201ENSMUST00000211625 160 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RpainQ9CWY9 Gm13065-201ENSMUST00000119178 141 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RpainQ9CWY9 Gm23340-201ENSMUST00000158955 123 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RpainQ9CWY9 Mir3079-201ENSMUST00000175428 90 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RpainQ9CWY9 Gm24342-201ENSMUST00000103907 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Gm23012-201ENSMUST00000104149 83 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Gm23708-201ENSMUST00000104367 123 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Gm23989-201ENSMUST00000117030 66 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Gm22233-201ENSMUST00000157464 114 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Gm25868-201ENSMUST00000158253 114 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Gm24020-201ENSMUST00000180156 108 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Gm25705-201ENSMUST00000083119 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Gm22652-201ENSMUST00000083207 131 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Mir196b-201ENSMUST00000083509 85 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Gm25496-201ENSMUST00000104430 120 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Gm10974-201ENSMUST00000107486 126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Gm24226-201ENSMUST00000158826 97 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Gm25300-201ENSMUST00000175284 84 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Gm27717-201ENSMUST00000183933 151 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Gm5581-201ENSMUST00000072940 2550 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Gm24233-201ENSMUST00000104317 122 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Gm23853-201ENSMUST00000158375 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Gm25768-201ENSMUST00000158570 98 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Mir344-201ENSMUST00000083634 95 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Gm43885-201ENSMUST00000204928 2542 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Mir669h-201ENSMUST00000116944 125 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Mir6985-201ENSMUST00000184641 61 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Gm26438-201ENSMUST00000082593 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Snord95-201ENSMUST00000082846 68 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Gm22520-201ENSMUST00000158269 129 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Gm22565-201ENSMUST00000175540 69 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Mir6380-201ENSMUST00000184334 81 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Gm27554-201ENSMUST00000185074 98 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 AC157278.1-201ENSMUST00000221621 148 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Mir219a-2-201ENSMUST00000083551 97 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 n-R5s157-201ENSMUST00000122543 121 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Gm24942-201ENSMUST00000158328 114 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Vmn1r-ps69-201ENSMUST00000172759 201 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Gm38274-201ENSMUST00000195689 148 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Gm42506-201ENSMUST00000202009 150 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Gm44211-201ENSMUST00000204867 145 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Gm25683-201ENSMUST00000083940 131 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Gm23416-201ENSMUST00000175520 95 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Gm27937-201ENSMUST00000183605 88 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Mir7663-201ENSMUST00000183950 61 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Mir7673-201ENSMUST00000184567 64 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Gm27977-201ENSMUST00000185159 111 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Mir876-201ENSMUST00000104659 81 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RpainQ9CWY9 Gm25715-201ENSMUST00000158627 125 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RpainQ9CWY9 Mir15b-201ENSMUST00000083646 64 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RpainQ9CWY9 n-R5s12-201ENSMUST00000083785 119 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RpainQ9CWY9 Gm25183-201ENSMUST00000157752 106 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RpainQ9CWY9 Gm25641-201ENSMUST00000175135 108 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RpainQ9CWY9 Gm23649-201ENSMUST00000179007 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RpainQ9CWY9 Mir6381-201ENSMUST00000183426 87 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RpainQ9CWY9 Gm42533-201ENSMUST00000196247 157 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RpainQ9CWY9 Gm44458-201ENSMUST00000196594 143 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RpainQ9CWY9 Gm25138-201ENSMUST00000083248 136 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RpainQ9CWY9 Gm25128-201ENSMUST00000083339 76 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RpainQ9CWY9 Gm26257-201ENSMUST00000122500 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RpainQ9CWY9 Gm25055-201ENSMUST00000157369 76 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RpainQ9CWY9 Gm22087-201ENSMUST00000158339 88 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RpainQ9CWY9 Mir3070a-201ENSMUST00000175468 89 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RpainQ9CWY9 Gm21954-201ENSMUST00000179544 51 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
RpainQ9CWY9 Gm22459-201ENSMUST00000082577 108 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RpainQ9CWY9 Zfp654-201ENSMUST00000052588 4741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
RpainQ9CWY9 Vmn1r75-202ENSMUST00000226622 6638 ntAPPRIS P2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
RpainQ9CWY9 Gm382-201ENSMUST00000096332 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
RpainQ9CWY9 Gm27450-201ENSMUST00000104632 90 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RpainQ9CWY9 Gm23893-201ENSMUST00000158106 134 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RpainQ9CWY9 Mir15a-201ENSMUST00000175266 84 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RpainQ9CWY9 Mir7010-201ENSMUST00000183464 63 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RpainQ9CWY9 Gm42677-201ENSMUST00000196363 127 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RpainQ9CWY9 Mir22-201ENSMUST00000083595 95 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RpainQ9CWY9 Gm24431-201ENSMUST00000104073 66 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RpainQ9CWY9 Gm27974-201ENSMUST00000183415 105 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RpainQ9CWY9 Gm23347-201ENSMUST00000083823 82 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RpainQ9CWY9 Mir3071-201ENSMUST00000093621 80 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RpainQ9CWY9 Gm14533-201ENSMUST00000117088 93 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RpainQ9CWY9 n-R5s6-201ENSMUST00000122663 88 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RpainQ9CWY9 Gm23072-201ENSMUST00000158243 123 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RpainQ9CWY9 Gm25656-201ENSMUST00000158466 66 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RpainQ9CWY9 Gm24927-201ENSMUST00000083397 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RpainQ9CWY9 Gm25894-201ENSMUST00000083458 75 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RpainQ9CWY9 Gm25652-201ENSMUST00000083780 103 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RpainQ9CWY9 Gm24701-201ENSMUST00000101946 105 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RpainQ9CWY9 Gm24288-201ENSMUST00000157630 144 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RpainQ9CWY9 Gm25506-201ENSMUST00000104339 70 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RpainQ9CWY9 Gm44301-201ENSMUST00000200362 143 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RpainQ9CWY9 Gm22078-201ENSMUST00000157593 103 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RpainQ9CWY9 CT030170.1-201ENSMUST00000222183 148 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RpainQ9CWY9 Gm26338-201ENSMUST00000102372 110 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RpainQ9CWY9 Gm22039-201ENSMUST00000157278 132 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
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