Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Mir669h-201ENSMUST00000116944 125 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Chmp3Q9CQ10 Gm24942-201ENSMUST00000158328 114 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Chmp3Q9CQ10 Gm24321-201ENSMUST00000175348 80 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Chmp3Q9CQ10 Mir6381-201ENSMUST00000183426 87 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Chmp3Q9CQ10 Gm25166-201ENSMUST00000158909 111 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Chmp3Q9CQ10 Gm45655-201ENSMUST00000211625 160 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Chmp3Q9CQ10 AC160550.1-201ENSMUST00000228659 181 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Chmp3Q9CQ10 Snord32a-201ENSMUST00000083285 83 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Chmp3Q9CQ10 Mir33-201ENSMUST00000083531 69 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Chmp3Q9CQ10 Gm10974-201ENSMUST00000107486 126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
Chmp3Q9CQ10 Gm23477-201ENSMUST00000158882 128 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Chmp3Q9CQ10 Gm26301-201ENSMUST00000104813 95 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Chmp3Q9CQ10 Vmn1r-ps69-201ENSMUST00000172759 201 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Chmp3Q9CQ10 Gm25950-201ENSMUST00000175331 100 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Chmp3Q9CQ10 Mir101a-201ENSMUST00000083517 83 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Chmp3Q9CQ10 DQ267101-201ENSMUST00000082562 73 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Chmp3Q9CQ10 Gm25055-201ENSMUST00000157369 76 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Chmp3Q9CQ10 Mir7663-201ENSMUST00000183950 61 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Chmp3Q9CQ10 Mir22-201ENSMUST00000083595 95 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Chmp3Q9CQ10 n-R5s12-201ENSMUST00000083785 119 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Chmp3Q9CQ10 Gm26338-201ENSMUST00000102372 110 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Chmp3Q9CQ10 Gm24379-201ENSMUST00000122695 86 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Chmp3Q9CQ10 Gm25715-201ENSMUST00000158627 125 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Chmp3Q9CQ10 Gm23766-201ENSMUST00000103894 80 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Chmp3Q9CQ10 Mir1904-201ENSMUST00000122702 80 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Chmp3Q9CQ10 Gm25656-201ENSMUST00000158466 66 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Chmp3Q9CQ10 Gm27656-201ENSMUST00000185055 80 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Chmp3Q9CQ10 Mir695-201ENSMUST00000102261 109 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Chmp3Q9CQ10 Gm24678-201ENSMUST00000158756 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Chmp3Q9CQ10 Gm26363-201ENSMUST00000158866 83 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Chmp3Q9CQ10 Mir7673-201ENSMUST00000184567 64 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Chmp3Q9CQ10 Gm44455-201ENSMUST00000200061 82 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Chmp3Q9CQ10 Trgj1-201ENSMUST00000200495 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.24□□□□□ -2.21
Chmp3Q9CQ10 Gm14533-201ENSMUST00000117088 93 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Chmp3Q9CQ10 Gm23856-201ENSMUST00000158380 99 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Chmp3Q9CQ10 Gm27980-201ENSMUST00000184094 169 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Chmp3Q9CQ10 Gm24331-201ENSMUST00000175099 67 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Chmp3Q9CQ10 Gm23801-201ENSMUST00000175561 67 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Chmp3Q9CQ10 Mir1954-201ENSMUST00000175595 86 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Chmp3Q9CQ10 Gm24485-201ENSMUST00000178283 67 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Chmp3Q9CQ10 Mir27b-201ENSMUST00000083541 73 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Chmp3Q9CQ10 Snord35a-201ENSMUST00000083884 90 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Chmp3Q9CQ10 Gm22673-201ENSMUST00000104415 131 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Chmp3Q9CQ10 Gm22048-201ENSMUST00000104721 89 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Chmp3Q9CQ10 Gm24288-201ENSMUST00000157630 144 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Chmp3Q9CQ10 Gm21954-201ENSMUST00000179544 51 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Chmp3Q9CQ10 Gm27943-201ENSMUST00000184844 116 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Chmp3Q9CQ10 Gm44327-201ENSMUST00000200068 117 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Chmp3Q9CQ10 Gm25506-201ENSMUST00000104339 70 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Chmp3Q9CQ10 Mir7091-201ENSMUST00000184075 79 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Chmp3Q9CQ10 Gm27554-201ENSMUST00000185074 98 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Chmp3Q9CQ10 Gm42677-201ENSMUST00000196363 127 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Chmp3Q9CQ10 Svbp-204ENSMUST00000210595 150 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Chmp3Q9CQ10 Gm27937-201ENSMUST00000183605 88 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Chmp3Q9CQ10 Mir494-201ENSMUST00000093632 85 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Chmp3Q9CQ10 Gm22720-201ENSMUST00000122710 87 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Chmp3Q9CQ10 Gm24777-201ENSMUST00000157644 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Chmp3Q9CQ10 Gm23340-201ENSMUST00000158955 123 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Chmp3Q9CQ10 Mir8116-201ENSMUST00000184134 97 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Chmp3Q9CQ10 Mir297-1-201ENSMUST00000103800 76 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Chmp3Q9CQ10 Snord71-201ENSMUST00000104361 85 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Chmp3Q9CQ10 Gm22459-201ENSMUST00000082577 108 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Chmp3Q9CQ10 Snord45b-201ENSMUST00000082797 71 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Chmp3Q9CQ10 Gm27977-201ENSMUST00000185159 111 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Chmp3Q9CQ10 Gm43885-201ENSMUST00000204928 2542 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Chmp3Q9CQ10 Gm42845-201ENSMUST00000197766 105 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Chmp3Q9CQ10 Mir200a-201ENSMUST00000083466 90 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Chmp3Q9CQ10 Mir448-201ENSMUST00000083516 112 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Chmp3Q9CQ10 Mir876-201ENSMUST00000104659 81 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Chmp3Q9CQ10 Gm25641-201ENSMUST00000175135 108 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Chmp3Q9CQ10 Olfr1099-202ENSMUST00000213456 4867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
Chmp3Q9CQ10 Gm25993-201ENSMUST00000175391 80 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Chmp3Q9CQ10 Gm27289-201ENSMUST00000183341 82 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Chmp3Q9CQ10 Gm22303-201ENSMUST00000082686 122 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Chmp3Q9CQ10 Mir3071-201ENSMUST00000093621 80 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Chmp3Q9CQ10 Gm25170-201ENSMUST00000104191 129 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Chmp3Q9CQ10 Gm25274-201ENSMUST00000104296 135 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Chmp3Q9CQ10 Gm25552-201ENSMUST00000158081 91 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Chmp3Q9CQ10 Gm23893-201ENSMUST00000158106 134 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Chmp3Q9CQ10 Gm22087-201ENSMUST00000158339 88 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Chmp3Q9CQ10 Mir8119-201ENSMUST00000183371 129 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Chmp3Q9CQ10 Mir6364-201ENSMUST00000183396 86 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Chmp3Q9CQ10 Mirlet7g-201ENSMUST00000083506 88 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Chmp3Q9CQ10 Snord33-201ENSMUST00000083694 84 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Chmp3Q9CQ10 Gm25307-201ENSMUST00000158885 106 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Chmp3Q9CQ10 Mir7229-201ENSMUST00000197062 53 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Chmp3Q9CQ10 Gm24431-201ENSMUST00000104073 66 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Chmp3Q9CQ10 Gm26007-201ENSMUST00000158798 120 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Chmp3Q9CQ10 Gm27587-201ENSMUST00000185116 163 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Chmp3Q9CQ10 Mir15b-201ENSMUST00000083646 64 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Chmp3Q9CQ10 Mir3105-201ENSMUST00000175480 85 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Chmp3Q9CQ10 Gm23410-201ENSMUST00000179967 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Chmp3Q9CQ10 Gm22505-201ENSMUST00000082956 108 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Chmp3Q9CQ10 Gm22363-201ENSMUST00000083100 108 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Chmp3Q9CQ10 Gm23814-201ENSMUST00000083230 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Chmp3Q9CQ10 Gm22469-201ENSMUST00000104118 133 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Chmp3Q9CQ10 Gm24020-201ENSMUST00000180156 108 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Chmp3Q9CQ10 Gm25683-201ENSMUST00000083940 131 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Chmp3Q9CQ10 Gm25378-201ENSMUST00000104333 129 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Chmp3Q9CQ10 Gm22565-201ENSMUST00000175540 69 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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