Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45655-201ENSMUST00000211625 160 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25887-201ENSMUST00000157777 84 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22430-201ENSMUST00000158546 107 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC132833.2-201ENSMUST00000228699 157 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22459-201ENSMUST00000082577 108 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24203-201ENSMUST00000082949 114 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24612-201ENSMUST00000083267 107 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23316-201ENSMUST00000157997 114 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22699-201ENSMUST00000175376 105 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snord78-201ENSMUST00000104032 66 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24070-201ENSMUST00000104519 130 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25991-201ENSMUST00000102439 99 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26104-201ENSMUST00000157250 108 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27549-201ENSMUST00000183508 62 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37845-201ENSMUST00000194977 355 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23955-201ENSMUST00000157214 100 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43977-201ENSMUST00000203970 189 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23507-201ENSMUST00000083078 107 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27937-201ENSMUST00000183605 88 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir6237-201ENSMUST00000183808 91 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir471-201ENSMUST00000093596 67 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24947-201ENSMUST00000158334 110 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25601-201ENSMUST00000158356 105 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24131-201ENSMUST00000158539 107 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25626-201ENSMUST00000177631 107 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir7086-201ENSMUST00000183683 65 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir1948-201ENSMUST00000157325 85 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir466e-201ENSMUST00000198862 84 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir466c-1-201ENSMUST00000200654 84 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22429-201ENSMUST00000158553 130 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir466b-1-201ENSMUST00000177988 82 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24717-201ENSMUST00000157522 124 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22298-201ENSMUST00000082662 133 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25429-201ENSMUST00000157607 132 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25716-201ENSMUST00000158628 104 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26124-201ENSMUST00000083359 108 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27415-201ENSMUST00000183720 95 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir451b-201ENSMUST00000196157 72 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25482-201ENSMUST00000083225 107 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22709-201ENSMUST00000116893 111 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13339-201ENSMUST00000120651 510 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25493-201ENSMUST00000157375 103 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir669b-201ENSMUST00000102172 97 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23909-201ENSMUST00000104598 131 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27798-201ENSMUST00000184989 71 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25417-201ENSMUST00000104212 131 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25397-201ENSMUST00000176951 92 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25623-201ENSMUST00000157216 108 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27845-201ENSMUST00000184479 114 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24201-201ENSMUST00000082946 125 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23240-201ENSMUST00000083009 121 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24724-201ENSMUST00000158230 107 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43324-201ENSMUST00000197482 289 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24842-201ENSMUST00000158681 54 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26454-201ENSMUST00000082682 107 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23461-201ENSMUST00000083265 107 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22101-201ENSMUST00000157928 103 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27935-201ENSMUST00000183894 79 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22454-201ENSMUST00000082583 107 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23173-201ENSMUST00000157161 160 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25978-201ENSMUST00000158698 90 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24134-201ENSMUST00000083361 71 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir494-201ENSMUST00000093632 85 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23258-201ENSMUST00000158319 106 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23209-201ENSMUST00000158667 110 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22951-201ENSMUST00000179471 107 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24384-201ENSMUST00000122693 75 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25599-201ENSMUST00000157816 103 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC151902.2-201ENSMUST00000226419 301 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27905-201ENSMUST00000184005 207 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25229-201ENSMUST00000178587 79 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25135-201ENSMUST00000082648 143 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24775-201ENSMUST00000157377 99 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22140-201ENSMUST00000158745 120 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25141-201ENSMUST00000083177 107 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25158-201ENSMUST00000177681 121 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26229-201ENSMUST00000179699 121 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45492-201ENSMUST00000211611 288 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC140930.2-201ENSMUST00000221803 109 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snord72-201ENSMUST00000104549 81 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25440-201ENSMUST00000158279 154 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24047-201ENSMUST00000102405 104 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 9230110F11Rik-202ENSMUST00000212907 191 ntTSL 5 BASIC-3.17□□□□□ -2.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22805-201ENSMUST00000082739 107 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22259-201ENSMUST00000178926 107 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC122327.1-201ENSMUST00000220778 108 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir1969-201ENSMUST00000157623 94 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17522-202ENSMUST00000186631 174 ntTSL 1 (best) BASIC-3.19□□□□□ -2.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17412-202ENSMUST00000189566 174 ntTSL 1 (best) BASIC-3.19□□□□□ -2.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22828-201ENSMUST00000083768 107 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22681-201ENSMUST00000083853 106 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26109-201ENSMUST00000083970 70 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC165138.1-201ENSMUST00000226984 270 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24725-201ENSMUST00000158229 125 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6020-201ENSMUST00000092094 66 ntAPPRIS P1 BASIC-3.21□□□□□ -2.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir466m-201ENSMUST00000175052 84 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir466b-8-201ENSMUST00000103883 86 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23990-201ENSMUST00000117031 117 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25619-201ENSMUST00000122621 104 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snord64-201ENSMUST00000104003 67 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 223.3 ms