Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Gm22446-201ENSMUST00000180108 104 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PtprbB2RU80 Gm23494-201ENSMUST00000116830 126 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PtprbB2RU80 Gm45492-201ENSMUST00000211611 288 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PtprbB2RU80 Gm45655-201ENSMUST00000211625 160 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PtprbB2RU80 Cyp2j7-ps1-201ENSMUST00000122430 173 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
PtprbB2RU80 Gm24717-201ENSMUST00000157522 124 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PtprbB2RU80 Mir302c-201ENSMUST00000083548 68 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PtprbB2RU80 Gm25879-201ENSMUST00000104330 107 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PtprbB2RU80 Gm25440-201ENSMUST00000158279 154 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PtprbB2RU80 Gm26291-201ENSMUST00000158889 137 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PtprbB2RU80 Mir136-201ENSMUST00000199494 62 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PtprbB2RU80 Gm23831-201ENSMUST00000158895 85 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PtprbB2RU80 Gm27415-201ENSMUST00000183720 95 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PtprbB2RU80 Gm25889-201ENSMUST00000157775 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PtprbB2RU80 Gm24842-201ENSMUST00000158681 54 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PtprbB2RU80 Gm45125-201ENSMUST00000206908 151 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PtprbB2RU80 Gm23335-201ENSMUST00000117021 90 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PtprbB2RU80 Gm37832-201ENSMUST00000118935 189 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PtprbB2RU80 Gm23461-201ENSMUST00000083265 107 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PtprbB2RU80 Gm25712-201ENSMUST00000158634 93 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PtprbB2RU80 Gm23977-201ENSMUST00000177871 74 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PtprbB2RU80 Gm43324-201ENSMUST00000197482 289 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PtprbB2RU80 Gm23209-201ENSMUST00000158667 110 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PtprbB2RU80 Gm23199-201ENSMUST00000158812 107 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PtprbB2RU80 Gm24714-201ENSMUST00000102382 101 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PtprbB2RU80 AC140930.2-201ENSMUST00000221803 109 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PtprbB2RU80 Mir7015-201ENSMUST00000199525 64 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PtprbB2RU80 mt-Tt-201ENSMUST00000082422 67 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PtprbB2RU80 Gm23378-201ENSMUST00000082942 107 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PtprbB2RU80 Gm24801-201ENSMUST00000178503 105 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PtprbB2RU80 Gm27935-201ENSMUST00000183894 79 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PtprbB2RU80 Gm44589-201ENSMUST00000207025 115 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PtprbB2RU80 Mir741-201ENSMUST00000103931 71 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PtprbB2RU80 Gm23990-201ENSMUST00000117031 117 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PtprbB2RU80 Gm24725-201ENSMUST00000158229 125 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PtprbB2RU80 Gm24106-201ENSMUST00000175498 127 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PtprbB2RU80 Snord47-201ENSMUST00000083034 77 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PtprbB2RU80 Gm45429-201ENSMUST00000209527 172 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PtprbB2RU80 Gm25609-201ENSMUST00000104019 104 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PtprbB2RU80 Mir466h-201ENSMUST00000104748 81 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PtprbB2RU80 Gm25622-201ENSMUST00000157217 104 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PtprbB2RU80 Gm24750-201ENSMUST00000157843 104 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PtprbB2RU80 Mir1839-201ENSMUST00000175366 127 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PtprbB2RU80 Sult1c2-ps2-201ENSMUST00000196414 276 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PtprbB2RU80 Gm24701-201ENSMUST00000101946 105 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PtprbB2RU80 Gm26262-201ENSMUST00000158024 127 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PtprbB2RU80 Gm27928-201ENSMUST00000183747 256 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PtprbB2RU80 Gm20108-201ENSMUST00000219977 153 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PtprbB2RU80 Gm27332-201ENSMUST00000184893 112 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
PtprbB2RU80 Gm25425-201ENSMUST00000157611 96 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
PtprbB2RU80 Gm25010-201ENSMUST00000158403 65 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
PtprbB2RU80 Mir6237-201ENSMUST00000183808 91 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
PtprbB2RU80 Gm37746-201ENSMUST00000193249 198 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
PtprbB2RU80 Gm38298-201ENSMUST00000193578 118 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
PtprbB2RU80 Mir669l-201ENSMUST00000103771 98 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PtprbB2RU80 Gm22140-201ENSMUST00000158745 120 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PtprbB2RU80 Gm25429-201ENSMUST00000157607 132 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
PtprbB2RU80 Gm43749-201ENSMUST00000199345 352 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
PtprbB2RU80 Snord78-201ENSMUST00000104032 66 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PtprbB2RU80 Gm24554-201ENSMUST00000158654 73 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PtprbB2RU80 Gm25978-201ENSMUST00000158698 90 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PtprbB2RU80 Gm27549-201ENSMUST00000183508 62 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PtprbB2RU80 Gm23216-201ENSMUST00000179545 107 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PtprbB2RU80 mt-Ts1-201ENSMUST00000082403 69 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PtprbB2RU80 Mir5117-201ENSMUST00000083226 84 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PtprbB2RU80 Gm14837-201ENSMUST00000119688 206 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PtprbB2RU80 Mir6957-201ENSMUST00000183708 64 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PtprbB2RU80 Gm22305-201ENSMUST00000082690 108 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PtprbB2RU80 Gm24263-201ENSMUST00000104059 107 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
PtprbB2RU80 Gm25847-201ENSMUST00000116793 96 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
PtprbB2RU80 mt-Tv-201ENSMUST00000082389 69 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
PtprbB2RU80 Gm24457-201ENSMUST00000083196 105 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
PtprbB2RU80 Mir466b-3-201ENSMUST00000103806 81 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
PtprbB2RU80 Gm24947-201ENSMUST00000158334 110 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
PtprbB2RU80 AC122335.1-201ENSMUST00000217587 175 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
PtprbB2RU80 Gm23974-201ENSMUST00000083321 131 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
PtprbB2RU80 Gm24070-201ENSMUST00000104519 130 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
PtprbB2RU80 Mir6375-201ENSMUST00000197176 95 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
PtprbB2RU80 Gm22298-201ENSMUST00000082662 133 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
PtprbB2RU80 Gm22349-201ENSMUST00000157864 107 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
PtprbB2RU80 Gm23166-201ENSMUST00000157164 101 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
PtprbB2RU80 Gm25964-201ENSMUST00000157171 97 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
PtprbB2RU80 Gm25653-201ENSMUST00000158473 138 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
PtprbB2RU80 Gm17522-202ENSMUST00000186631 174 ntTSL 1 (best) BASIC-1.41□□□□□ -2.64
PtprbB2RU80 Gm17412-202ENSMUST00000189566 174 ntTSL 1 (best) BASIC-1.41□□□□□ -2.64
PtprbB2RU80 Gm25322-201ENSMUST00000122556 104 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PtprbB2RU80 Gm27694-201ENSMUST00000184740 86 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PtprbB2RU80 Gm23955-201ENSMUST00000157214 100 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PtprbB2RU80 Mir1948-201ENSMUST00000157325 85 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PtprbB2RU80 Gm26124-201ENSMUST00000083359 108 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PtprbB2RU80 Mir7-1-201ENSMUST00000083500 108 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PtprbB2RU80 Gm22430-201ENSMUST00000158546 107 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PtprbB2RU80 Mir7086-201ENSMUST00000183683 65 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PtprbB2RU80 Gm42844-201ENSMUST00000200355 112 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PtprbB2RU80 Gm22205-201ENSMUST00000122655 71 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PtprbB2RU80 Gm22335-201ENSMUST00000157724 99 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PtprbB2RU80 Gm23630-201ENSMUST00000175292 104 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
PtprbB2RU80 Gm24134-201ENSMUST00000083361 71 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
PtprbB2RU80 Gm23017-201ENSMUST00000177583 72 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
PtprbB2RU80 Gm43943-201ENSMUST00000204201 113 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 154.3 ms