Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gpc1Q9QZF2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms