Protein–RNA interactions for Protein: Q99N92

Mrpl27, 39S ribosomal protein L27, mitochondrial, mousemouse

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Length 148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl27Q99N92 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl27Q99N92 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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