Protein–RNA interactions for Protein: Q78KK3

Slc22a18, Solute carrier family 22 member 18, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a18Q78KK3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc22a18Q78KK3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc22a18Q78KK3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc22a18Q78KK3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc22a18Q78KK3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc22a18Q78KK3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc22a18Q78KK3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc22a18Q78KK3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc22a18Q78KK3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc22a18Q78KK3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc22a18Q78KK3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc22a18Q78KK3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc22a18Q78KK3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc22a18Q78KK3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc22a18Q78KK3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc22a18Q78KK3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc22a18Q78KK3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc22a18Q78KK3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc22a18Q78KK3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc22a18Q78KK3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc22a18Q78KK3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc22a18Q78KK3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc22a18Q78KK3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc22a18Q78KK3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc22a18Q78KK3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc22a18Q78KK3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Slc22a18Q78KK3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc22a18Q78KK3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc22a18Q78KK3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc22a18Q78KK3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc22a18Q78KK3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc22a18Q78KK3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc22a18Q78KK3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc22a18Q78KK3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Slc22a18Q78KK3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Slc22a18Q78KK3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc22a18Q78KK3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc22a18Q78KK3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc22a18Q78KK3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc22a18Q78KK3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc22a18Q78KK3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc22a18Q78KK3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc22a18Q78KK3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc22a18Q78KK3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc22a18Q78KK3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc22a18Q78KK3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc22a18Q78KK3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc22a18Q78KK3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc22a18Q78KK3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc22a18Q78KK3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc22a18Q78KK3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc22a18Q78KK3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc22a18Q78KK3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc22a18Q78KK3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc22a18Q78KK3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc22a18Q78KK3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Slc22a18Q78KK3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc22a18Q78KK3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Slc22a18Q78KK3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc22a18Q78KK3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc22a18Q78KK3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc22a18Q78KK3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Slc22a18Q78KK3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Slc22a18Q78KK3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc22a18Q78KK3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc22a18Q78KK3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc22a18Q78KK3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc22a18Q78KK3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc22a18Q78KK3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Slc22a18Q78KK3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc22a18Q78KK3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Slc22a18Q78KK3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc22a18Q78KK3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc22a18Q78KK3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc22a18Q78KK3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc22a18Q78KK3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc22a18Q78KK3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc22a18Q78KK3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc22a18Q78KK3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Slc22a18Q78KK3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc22a18Q78KK3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Slc22a18Q78KK3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Slc22a18Q78KK3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc22a18Q78KK3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc22a18Q78KK3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc22a18Q78KK3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Slc22a18Q78KK3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc22a18Q78KK3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc22a18Q78KK3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slc22a18Q78KK3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slc22a18Q78KK3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Slc22a18Q78KK3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slc22a18Q78KK3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slc22a18Q78KK3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slc22a18Q78KK3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slc22a18Q78KK3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slc22a18Q78KK3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slc22a18Q78KK3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slc22a18Q78KK3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slc22a18Q78KK3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms