Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
9930111J21Rik1Q5SVP0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.9 ms