Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epb41P48193 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epb41P48193 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Epb41P48193 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Epb41P48193 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Epb41P48193 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Epb41P48193 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Epb41P48193 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Epb41P48193 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Epb41P48193 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Epb41P48193 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Epb41P48193 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Epb41P48193 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Epb41P48193 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Epb41P48193 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Epb41P48193 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Epb41P48193 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Epb41P48193 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Epb41P48193 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epb41P48193 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epb41P48193 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epb41P48193 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epb41P48193 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epb41P48193 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Epb41P48193 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epb41P48193 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epb41P48193 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epb41P48193 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epb41P48193 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Epb41P48193 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epb41P48193 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epb41P48193 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epb41P48193 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epb41P48193 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epb41P48193 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epb41P48193 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epb41P48193 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epb41P48193 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epb41P48193 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epb41P48193 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epb41P48193 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epb41P48193 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epb41P48193 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epb41P48193 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms