Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trappc8E9PWG2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trappc8E9PWG2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trappc8E9PWG2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trappc8E9PWG2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trappc8E9PWG2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trappc8E9PWG2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trappc8E9PWG2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trappc8E9PWG2 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Trappc8E9PWG2 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Trappc8E9PWG2 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Trappc8E9PWG2 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trappc8E9PWG2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trappc8E9PWG2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trappc8E9PWG2 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trappc8E9PWG2 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms