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Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80
Snx1, Sorting nexin-1, mouse
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RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (Experimental data)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
Snx1
Q9WV80
Mir7038-201
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□□□□□ -2.48
Snx1
Q9WV80
Igkv13-78-1-201
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200 nt
BASIC
-0.47
□□□□□ -2.48
Snx1
Q9WV80
Gm23056-201
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111 nt
BASIC
-0.47
□□□□□ -2.48
Snx1
Q9WV80
Gm23483-201
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108 nt
BASIC
-0.48
□□□□□ -2.49
Snx1
Q9WV80
Gm24593-201
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106 nt
BASIC
-0.48
□□□□□ -2.49
Snx1
Q9WV80
Gm25425-201
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96 nt
BASIC
-0.48
□□□□□ -2.49
Snx1
Q9WV80
Gm25375-201
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BASIC
-0.48
□□□□□ -2.49
Snx1
Q9WV80
Gm22942-201
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124 nt
BASIC
-0.48
□□□□□ -2.49
Snx1
Q9WV80
Mir7079-201
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BASIC
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□□□□□ -2.49
Snx1
Q9WV80
Mir191-201
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BASIC
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□□□□□ -2.49
Snx1
Q9WV80
Mirlet7a-1-201
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BASIC
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□□□□□ -2.49
Snx1
Q9WV80
Mir214-201
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BASIC
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□□□□□ -2.49
Snx1
Q9WV80
AC165138.1-201
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BASIC
-0.49
□□□□□ -2.49
Snx1
Q9WV80
Gm23651-201
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BASIC
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□□□□□ -2.49
Snx1
Q9WV80
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BASIC
-0.5
□□□□□ -2.49
Snx1
Q9WV80
Gm24455-201
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BASIC
-0.5
□□□□□ -2.49
Snx1
Q9WV80
Rab11fip4os2-202
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355 nt
TSL 1 (best)
BASIC
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□□□□□ -2.49
Snx1
Q9WV80
Gm17528-201
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BASIC
-0.51
□□□□□ -2.49
Snx1
Q9WV80
Gm24508-201
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107 nt
BASIC
-0.51
□□□□□ -2.49
Snx1
Q9WV80
Mir7651-201
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64 nt
BASIC
-0.51
□□□□□ -2.49
Snx1
Q9WV80
mt-Tt-201
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67 nt
BASIC
-0.51
□□□□□ -2.49
Snx1
Q9WV80
Gm25275-201
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129 nt
BASIC
-0.52
□□□□□ -2.49
Snx1
Q9WV80
Gm23988-201
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BASIC
-0.52
□□□□□ -2.49
Snx1
Q9WV80
Gm25522-201
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105 nt
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□□□□□ -2.49
Snx1
Q9WV80
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BASIC
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Snx1
Q9WV80
Gm24683-201
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BASIC
-0.53
□□□□□ -2.49
Snx1
Q9WV80
Gm24580-201
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BASIC
-0.54
□□□□□ -2.5
Snx1
Q9WV80
Gm23528-201
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132 nt
BASIC
-0.54
□□□□□ -2.5
Snx1
Q9WV80
Gm26359-201
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101 nt
BASIC
-0.54
□□□□□ -2.5
Snx1
Q9WV80
Gm37796-201
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134 nt
BASIC
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□□□□□ -2.5
Snx1
Q9WV80
Gm10351-201
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125 nt
BASIC
-0.54
□□□□□ -2.5
Snx1
Q9WV80
Gm22149-201
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136 nt
BASIC
-0.55
□□□□□ -2.5
Snx1
Q9WV80
Gm23434-201
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BASIC
-0.55
□□□□□ -2.5
Snx1
Q9WV80
Snora26-201
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BASIC
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□□□□□ -2.5
Snx1
Q9WV80
Mir145a-201
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BASIC
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□□□□□ -2.5
Snx1
Q9WV80
Gm24916-201
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BASIC
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□□□□□ -2.5
Snx1
Q9WV80
Gm24823-201
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BASIC
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□□□□□ -2.5
Snx1
Q9WV80
Gm22087-201
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BASIC
-0.57
□□□□□ -2.5
Snx1
Q9WV80
Gm17364-201
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TSL 5
BASIC
-0.57
□□□□□ -2.5
Snx1
Q9WV80
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78 nt
BASIC
-0.57
□□□□□ -2.5
Snx1
Q9WV80
Gm25249-201
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78 nt
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□□□□□ -2.5
Snx1
Q9WV80
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□□□□□ -2.5
Snx1
Q9WV80
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BASIC
-0.58
□□□□□ -2.5
Snx1
Q9WV80
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□□□□□ -2.5
Snx1
Q9WV80
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BASIC
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□□□□□ -2.5
Snx1
Q9WV80
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BASIC
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□□□□□ -2.5
Snx1
Q9WV80
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Q9WV80
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BASIC
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□□□□□ -2.51
Snx1
Q9WV80
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Snx1
Q9WV80
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Snx1
Q9WV80
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-0.6
□□□□□ -2.51
Snx1
Q9WV80
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BASIC
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Snx1
Q9WV80
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BASIC
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□□□□□ -2.51
Snx1
Q9WV80
Snord42b-201
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BASIC
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Snx1
Q9WV80
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□□□□□ -2.51
Snx1
Q9WV80
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BASIC
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□□□□□ -2.51
Snx1
Q9WV80
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TSL 5
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Snx1
Q9WV80
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Snx1
Q9WV80
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Q9WV80
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Q9WV80
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Q9WV80
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Q9WV80
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Snx1
Q9WV80
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Snx1
Q9WV80
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BASIC
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Snx1
Q9WV80
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BASIC
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□□□□□ -2.51
Snx1
Q9WV80
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Snx1
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□□□□□ -2.52
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Q9WV80
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Snx1
Q9WV80
Gm23180-201
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BASIC
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□□□□□ -2.52
Snx1
Q9WV80
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BASIC
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□□□□□ -2.52
Snx1
Q9WV80
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APPRIS P1
BASIC
-0.67
□□□□□ -2.52
Snx1
Q9WV80
Gm22070-201
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BASIC
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Snx1
Q9WV80
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BASIC
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□□□□□ -2.52
Snx1
Q9WV80
AC132833.2-201
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BASIC
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Snx1
Q9WV80
Mir7-1-201
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BASIC
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□□□□□ -2.52
Snx1
Q9WV80
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BASIC
-0.69
□□□□□ -2.52
Snx1
Q9WV80
Gm24064-201
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BASIC
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□□□□□ -2.52
Snx1
Q9WV80
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BASIC
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Snx1
Q9WV80
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BASIC
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□□□□□ -2.52
Snx1
Q9WV80
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BASIC
-0.7
□□□□□ -2.52
Snx1
Q9WV80
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BASIC
-0.7
□□□□□ -2.52
Snx1
Q9WV80
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BASIC
-0.7
□□□□□ -2.52
Snx1
Q9WV80
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BASIC
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□□□□□ -2.52
Snx1
Q9WV80
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BASIC
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□□□□□ -2.52
Snx1
Q9WV80
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TSL 5
BASIC
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□□□□□ -2.52
Snx1
Q9WV80
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BASIC
-0.7
□□□□□ -2.52
Snx1
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67 nt
BASIC
-0.71
□□□□□ -2.52
Snx1
Q9WV80
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BASIC
-0.71
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BASIC
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328 nt
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-0.72
□□□□□ -2.52
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