Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Gm24865-201ENSMUST00000103246 96 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ChfrQ810L3 Gm10945-201ENSMUST00000105596 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
ChfrQ810L3 n-R5s70-201ENSMUST00000122650 116 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ChfrQ810L3 Gm23328-201ENSMUST00000157418 132 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ChfrQ810L3 Gm24476-201ENSMUST00000157437 131 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ChfrQ810L3 Gm23339-201ENSMUST00000158962 139 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ChfrQ810L3 Mir7063-201ENSMUST00000184158 91 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ChfrQ810L3 Trgj1-201ENSMUST00000200495 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.27□□□□□ -2.21
ChfrQ810L3 Gm24134-201ENSMUST00000083361 71 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ChfrQ810L3 Gm25650-201ENSMUST00000083784 162 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ChfrQ810L3 Gm24494-201ENSMUST00000083804 81 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ChfrQ810L3 Snord71-201ENSMUST00000104361 85 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ChfrQ810L3 Gm22203-201ENSMUST00000158605 58 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ChfrQ810L3 Gm27656-201ENSMUST00000185055 80 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ChfrQ810L3 AC157278.1-201ENSMUST00000221621 148 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ChfrQ810L3 Gm22780-201ENSMUST00000104084 132 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ChfrQ810L3 Gm22074-201ENSMUST00000158595 113 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ChfrQ810L3 Gm23291-201ENSMUST00000175611 78 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ChfrQ810L3 Snord96a-201ENSMUST00000082791 81 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ChfrQ810L3 Snhg14-211ENSMUST00000189581 6861 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
ChfrQ810L3 Mir297-1-201ENSMUST00000103800 76 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ChfrQ810L3 Mir741-201ENSMUST00000103931 71 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ChfrQ810L3 Gm22785-201ENSMUST00000104087 132 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ChfrQ810L3 Gm24983-201ENSMUST00000104457 69 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ChfrQ810L3 Gm6985-201ENSMUST00000121255 271 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ChfrQ810L3 Gm25663-201ENSMUST00000157698 135 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ChfrQ810L3 Gm16399-201ENSMUST00000181423 219 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ChfrQ810L3 Mir6394-201ENSMUST00000184738 99 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ChfrQ810L3 Gm36956-201ENSMUST00000193830 214 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ChfrQ810L3 Gm44488-201ENSMUST00000199467 119 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ChfrQ810L3 AC156794.1-201ENSMUST00000214415 214 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
ChfrQ810L3 Gm24311-201ENSMUST00000082570 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ChfrQ810L3 Mir494-201ENSMUST00000093632 85 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ChfrQ810L3 Gm24342-201ENSMUST00000103907 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ChfrQ810L3 Gm25110-201ENSMUST00000116684 121 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ChfrQ810L3 Gm25775-201ENSMUST00000116716 121 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ChfrQ810L3 Gm24795-201ENSMUST00000116737 121 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ChfrQ810L3 Gm25171-201ENSMUST00000116926 121 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ChfrQ810L3 Gm23636-201ENSMUST00000175070 95 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ChfrQ810L3 Gm22801-201ENSMUST00000175624 84 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ChfrQ810L3 Gm27549-201ENSMUST00000183508 62 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ChfrQ810L3 Mir211-201ENSMUST00000083651 106 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ChfrQ810L3 Gm5581-201ENSMUST00000072940 2550 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ChfrQ810L3 Gm22788-201ENSMUST00000157876 61 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ChfrQ810L3 Gm26089-201ENSMUST00000157898 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ChfrQ810L3 Gm25366-201ENSMUST00000158845 124 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ChfrQ810L3 Gm43907-201ENSMUST00000203128 117 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ChfrQ810L3 Snord45b-201ENSMUST00000082797 71 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ChfrQ810L3 Mir344-201ENSMUST00000083634 95 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ChfrQ810L3 Gm25652-201ENSMUST00000083780 103 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ChfrQ810L3 Gm22786-201ENSMUST00000104086 122 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ChfrQ810L3 B230307C23Rik-201ENSMUST00000113729 192 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
ChfrQ810L3 Gm22030-201ENSMUST00000116942 63 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ChfrQ810L3 Gm24290-201ENSMUST00000157634 96 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ChfrQ810L3 Gm25183-201ENSMUST00000157752 106 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ChfrQ810L3 Gm25693-201ENSMUST00000175443 85 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ChfrQ810L3 Snora75-201ENSMUST00000082903 133 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ChfrQ810L3 Olfr805-203ENSMUST00000216794 3199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
ChfrQ810L3 Fam46d-201ENSMUST00000101292 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
ChfrQ810L3 Gm22406-201ENSMUST00000174923 93 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ChfrQ810L3 Gm23649-201ENSMUST00000179007 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ChfrQ810L3 Gm38074-201ENSMUST00000193467 145 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
ChfrQ810L3 Gm24252-201ENSMUST00000083700 132 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ChfrQ810L3 Gm22485-201ENSMUST00000157990 109 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ChfrQ810L3 Gm23340-201ENSMUST00000158955 123 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ChfrQ810L3 Mir6985-201ENSMUST00000184641 61 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ChfrQ810L3 Mir1961-201ENSMUST00000158643 112 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ChfrQ810L3 Gm22565-201ENSMUST00000175540 69 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ChfrQ810L3 Mir196b-201ENSMUST00000083509 85 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ChfrQ810L3 Gm23347-201ENSMUST00000083823 82 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ChfrQ810L3 Olfr832-202ENSMUST00000218385 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ChfrQ810L3 Gm24073-201ENSMUST00000158177 106 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ChfrQ810L3 Gm25768-201ENSMUST00000158570 98 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ChfrQ810L3 Mir344d-3-201ENSMUST00000175458 80 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ChfrQ810L3 Gm27993-201ENSMUST00000184362 85 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ChfrQ810L3 Gm44396-201ENSMUST00000199843 114 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ChfrQ810L3 Gm24927-201ENSMUST00000083397 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ChfrQ810L3 Gm43885-201ENSMUST00000204928 2542 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ChfrQ810L3 Traj53-201ENSMUST00000103690 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.16□□□□□ -2.22
ChfrQ810L3 Gm24580-201ENSMUST00000103965 131 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ChfrQ810L3 Gm27450-201ENSMUST00000104632 90 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ChfrQ810L3 Gm25328-201ENSMUST00000175013 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ChfrQ810L3 AC160976.1-201ENSMUST00000215092 148 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ChfrQ810L3 AC116319.1-201ENSMUST00000227765 222 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ChfrQ810L3 CT025630.1-201ENSMUST00000227901 172 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ChfrQ810L3 Mir324-201ENSMUST00000083600 89 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ChfrQ810L3 Mir709-201ENSMUST00000102190 88 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ChfrQ810L3 Gm23991-201ENSMUST00000117033 93 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ChfrQ810L3 Gm26257-201ENSMUST00000122500 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ChfrQ810L3 Gm22078-201ENSMUST00000157593 103 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ChfrQ810L3 Gm24725-201ENSMUST00000158229 125 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ChfrQ810L3 Mir3108-201ENSMUST00000175500 79 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ChfrQ810L3 Gm21954-201ENSMUST00000179544 51 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
ChfrQ810L3 Gm27420-201ENSMUST00000183823 79 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ChfrQ810L3 Gm42506-201ENSMUST00000202009 150 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ChfrQ810L3 Gm22980-201ENSMUST00000082608 70 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ChfrQ810L3 Gm13723-201ENSMUST00000130722 5036 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
ChfrQ810L3 Gm22039-201ENSMUST00000157278 132 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ChfrQ810L3 Gm23672-201ENSMUST00000157471 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ChfrQ810L3 Snord2-201ENSMUST00000157899 69 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
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