Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Mirlet7g-201ENSMUST00000083506 88 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Sh3bp1P55194 Gm25337-201ENSMUST00000083723 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Sh3bp1P55194 Gm24555-201ENSMUST00000104548 124 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Sh3bp1P55194 Gm26303-201ENSMUST00000116845 119 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Sh3bp1P55194 Gm22239-201ENSMUST00000175220 103 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Sh3bp1P55194 Mir3105-201ENSMUST00000175480 85 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Sh3bp1P55194 Mir6237-201ENSMUST00000183808 91 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Sh3bp1P55194 Gm44828-201ENSMUST00000203745 106 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Sh3bp1P55194 AC140930.2-201ENSMUST00000221803 109 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Sh3bp1P55194 mt-Tn-201ENSMUST00000082399 71 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Sh3bp1P55194 Gm11749-201ENSMUST00000127327 184 ntTSL 2 BASIC0.44□□□□□ -2.34
Sh3bp1P55194 Gm23291-201ENSMUST00000175611 78 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Sh3bp1P55194 AC166341.8-201ENSMUST00000221267 108 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Sh3bp1P55194 Gm22303-201ENSMUST00000082686 122 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Sh3bp1P55194 Gm25815-201ENSMUST00000082755 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Sh3bp1P55194 Gm26109-201ENSMUST00000083970 70 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Sh3bp1P55194 Mir670-201ENSMUST00000102380 100 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Sh3bp1P55194 Gm24234-201ENSMUST00000104316 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Sh3bp1P55194 Gm25247-201ENSMUST00000175475 90 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Sh3bp1P55194 Gm25633-201ENSMUST00000178565 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Sh3bp1P55194 Mir509-201ENSMUST00000196089 75 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Sh3bp1P55194 Gm25987-201ENSMUST00000083234 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Sh3bp1P55194 Gm24772-201ENSMUST00000158507 110 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Sh3bp1P55194 Sult1c2-ps2-201ENSMUST00000196414 276 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Sh3bp1P55194 AC157602.1-201ENSMUST00000197446 105 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Sh3bp1P55194 Mir29a-201ENSMUST00000083676 88 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Sh3bp1P55194 Gm22004-201ENSMUST00000101884 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Sh3bp1P55194 Gm25408-201ENSMUST00000104104 133 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Sh3bp1P55194 Snord2-201ENSMUST00000157899 69 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Sh3bp1P55194 Gm44327-201ENSMUST00000200068 117 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Sh3bp1P55194 Gm23969-201ENSMUST00000083324 74 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Sh3bp1P55194 Gm22983-201ENSMUST00000158308 104 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Sh3bp1P55194 AC156794.1-201ENSMUST00000214415 214 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
Sh3bp1P55194 Gm24877-201ENSMUST00000158779 116 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Sh3bp1P55194 Gm25366-201ENSMUST00000158845 124 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Sh3bp1P55194 Mir3473d-201ENSMUST00000175346 81 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Sh3bp1P55194 Gm26081-201ENSMUST00000104068 132 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Sh3bp1P55194 Gm23012-201ENSMUST00000104149 83 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Sh3bp1P55194 Gm26478-201ENSMUST00000122611 133 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Sh3bp1P55194 Gm25375-201ENSMUST00000158157 135 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Sh3bp1P55194 Gm24801-201ENSMUST00000178503 105 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Sh3bp1P55194 AC132833.2-201ENSMUST00000228699 157 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Sh3bp1P55194 Gm24410-201ENSMUST00000083433 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Sh3bp1P55194 Gm23644-201ENSMUST00000157856 77 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Sh3bp1P55194 Gm24697-201ENSMUST00000083881 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Sh3bp1P55194 Gm27475-201ENSMUST00000183420 61 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Sh3bp1P55194 Mir7065-201ENSMUST00000185110 61 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Sh3bp1P55194 Gm22672-201ENSMUST00000104414 134 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Sh3bp1P55194 Gm24983-201ENSMUST00000104457 69 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Sh3bp1P55194 Mir1197-201ENSMUST00000117037 120 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Sh3bp1P55194 Gm27607-201ENSMUST00000185162 122 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Sh3bp1P55194 Gm42845-201ENSMUST00000197766 105 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Sh3bp1P55194 AC153930.1-201ENSMUST00000220016 358 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
Sh3bp1P55194 Gm24202-201ENSMUST00000082948 103 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Sh3bp1P55194 Gm26152-201ENSMUST00000157427 101 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Sh3bp1P55194 Gm22203-201ENSMUST00000158605 58 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Sh3bp1P55194 Mir710-201ENSMUST00000102088 110 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Sh3bp1P55194 Gm22770-201ENSMUST00000158368 67 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Sh3bp1P55194 Snord95-201ENSMUST00000082846 68 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Sh3bp1P55194 Gm24099-201ENSMUST00000083384 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Sh3bp1P55194 Mirlet7a-1-201ENSMUST00000083487 94 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Sh3bp1P55194 Mir224-201ENSMUST00000083608 82 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Sh3bp1P55194 Zfp813-ps-201ENSMUST00000186652 2506 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Sh3bp1P55194 Gm22213-201ENSMUST00000157564 119 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Sh3bp1P55194 Gm24482-201ENSMUST00000117005 93 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Sh3bp1P55194 Gm23180-201ENSMUST00000158686 125 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Sh3bp1P55194 Gm25380-201ENSMUST00000175463 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Sh3bp1P55194 Gm24641-201ENSMUST00000178055 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Sh3bp1P55194 Gm25484-201ENSMUST00000178217 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Sh3bp1P55194 Gm26138-201ENSMUST00000179236 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Sh3bp1P55194 Gm22821-201ENSMUST00000179288 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Sh3bp1P55194 Mir7077-201ENSMUST00000183991 57 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Sh3bp1P55194 Gm27980-201ENSMUST00000184094 169 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Sh3bp1P55194 Gm44345-201ENSMUST00000199560 135 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Sh3bp1P55194 Gm45741-201ENSMUST00000212661 152 ntTSL 1 (best) BASIC0.3□□□□□ -2.36
Sh3bp1P55194 CT009723.2-201ENSMUST00000215702 124 ntTSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
Sh3bp1P55194 Gm23298-201ENSMUST00000083181 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Sh3bp1P55194 Gm24614-201ENSMUST00000083269 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Sh3bp1P55194 Gm22057-201ENSMUST00000083387 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Sh3bp1P55194 Gm25516-201ENSMUST00000083857 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Sh3bp1P55194 Gm23531-201ENSMUST00000104567 68 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Sh3bp1P55194 Gm26253-201ENSMUST00000122493 103 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Sh3bp1P55194 Gm22100-201ENSMUST00000157926 63 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Sh3bp1P55194 Gm23261-201ENSMUST00000158316 136 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Sh3bp1P55194 Mir196a-2-201ENSMUST00000083554 85 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Sh3bp1P55194 Scarna8-201ENSMUST00000158333 131 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Sh3bp1P55194 Gm26007-201ENSMUST00000158798 120 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Sh3bp1P55194 Gm25160-201ENSMUST00000158914 102 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Sh3bp1P55194 Mir5124a-201ENSMUST00000175528 72 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Sh3bp1P55194 Gm44803-201ENSMUST00000204384 156 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Sh3bp1P55194 Gm22981-201ENSMUST00000082611 75 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Sh3bp1P55194 Mir669f-201ENSMUST00000103850 121 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Sh3bp1P55194 Gm25497-201ENSMUST00000104425 132 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Sh3bp1P55194 Gm23994-201ENSMUST00000158059 88 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Sh3bp1P55194 Gm22140-201ENSMUST00000158745 120 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Sh3bp1P55194 Mir5619-201ENSMUST00000176065 61 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Sh3bp1P55194 Mir6365-201ENSMUST00000183990 101 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Sh3bp1P55194 AC160962.3-201ENSMUST00000225914 112 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Sh3bp1P55194 Gm22088-201ENSMUST00000158341 117 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Sh3bp1P55194 Gm23821-201ENSMUST00000158738 106 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 242.9 ms