Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm25465-201ENSMUST00000157716 105 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PtpreP49446 Gm23339-201ENSMUST00000158962 139 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PtpreP49446 Mir6950-201ENSMUST00000184438 73 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PtpreP49446 Gm24151-201ENSMUST00000082758 141 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PtpreP49446 Gm22087-201ENSMUST00000158339 88 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PtpreP49446 Gm22164-201ENSMUST00000158413 106 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PtpreP49446 Gm23730-201ENSMUST00000083236 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PtpreP49446 Knl1-203ENSMUST00000099542 6525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PtpreP49446 Gm25040-201ENSMUST00000103877 66 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PtpreP49446 Gm23630-201ENSMUST00000175292 104 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PtpreP49446 Mir344d-3-201ENSMUST00000175458 80 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PtpreP49446 Gm27511-201ENSMUST00000183502 127 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PtpreP49446 Mir376b-201ENSMUST00000195930 82 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PtpreP49446 Gm24612-201ENSMUST00000083267 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PtpreP49446 Gm23130-201ENSMUST00000104252 74 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PtpreP49446 U6.1-201ENSMUST00000157443 101 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PtpreP49446 Gm24549-201ENSMUST00000158647 139 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PtpreP49446 Mir6342-201ENSMUST00000183870 125 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PtpreP49446 Mir7673-201ENSMUST00000184567 64 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PtpreP49446 Mir377-201ENSMUST00000083504 68 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PtpreP49446 Olfr1013-202ENSMUST00000216397 4925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PtpreP49446 Gm25279-201ENSMUST00000122608 133 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PtpreP49446 Gm24783-201ENSMUST00000157639 100 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PtpreP49446 Gm24902-201ENSMUST00000158126 123 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PtpreP49446 Gm22401-201ENSMUST00000174927 117 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PtpreP49446 Gm27937-201ENSMUST00000183605 88 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PtpreP49446 Mir30a-201ENSMUST00000083471 71 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PtpreP49446 Gm26274-201ENSMUST00000157103 321 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PtpreP49446 Mir100-201ENSMUST00000175270 80 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PtpreP49446 Gm27326-201ENSMUST00000183504 95 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PtpreP49446 Mir6995-201ENSMUST00000183658 71 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PtpreP49446 Vmn1r75-203ENSMUST00000226855 6548 ntAPPRIS P2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
PtpreP49446 Snord69-201ENSMUST00000104024 80 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PtpreP49446 Scarna3a-201ENSMUST00000158911 140 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PtpreP49446 Mir3098-201ENSMUST00000175416 87 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PtpreP49446 AC238676.2-201ENSMUST00000220910 94 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PtpreP49446 Mir3096-201ENSMUST00000116685 71 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PtpreP49446 Gm27265-201ENSMUST00000183559 77 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PtpreP49446 Gm44384-201ENSMUST00000200208 114 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PtpreP49446 Olfr1431-202ENSMUST00000213759 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
PtpreP49446 Gm23012-201ENSMUST00000104149 83 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PtpreP49446 Gm22149-201ENSMUST00000104442 136 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PtpreP49446 Mir669h-201ENSMUST00000116944 125 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PtpreP49446 Gm25831-201ENSMUST00000158924 163 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PtpreP49446 Gm23060-201ENSMUST00000102345 109 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PtpreP49446 Gm22663-201ENSMUST00000158721 102 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PtpreP49446 Gm22459-201ENSMUST00000082577 108 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PtpreP49446 Gm22717-201ENSMUST00000122703 171 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PtpreP49446 Gm43911-201ENSMUST00000203097 76 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PtpreP49446 Snord96a-201ENSMUST00000082791 81 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PtpreP49446 Snord95-201ENSMUST00000082846 68 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PtpreP49446 Gm28383-201ENSMUST00000187563 139 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PtpreP49446 n-R5s12-201ENSMUST00000083785 119 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PtpreP49446 Gm27420-201ENSMUST00000183823 79 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PtpreP49446 Gm27717-201ENSMUST00000183933 151 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PtpreP49446 Mir1949-202ENSMUST00000199259 70 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PtpreP49446 Gm29344-201ENSMUST00000068143 210 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PtpreP49446 Gm22652-201ENSMUST00000083207 131 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PtpreP49446 Vmn1r75-204ENSMUST00000227611 4336 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PtpreP49446 Gm13065-201ENSMUST00000119178 141 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PtpreP49446 Mir7665-201ENSMUST00000184907 63 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PtpreP49446 AL772271.1-201ENSMUST00000196848 65 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PtpreP49446 Gm26438-201ENSMUST00000082593 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PtpreP49446 Mir320-201ENSMUST00000083594 82 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PtpreP49446 Olfr1218-204ENSMUST00000215054 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PtpreP49446 Gm43960-201ENSMUST00000204249 5020 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PtpreP49446 Gm25968-201ENSMUST00000157167 100 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PtpreP49446 Mir92-2-201ENSMUST00000083679 91 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PtpreP49446 Snhg14-211ENSMUST00000189581 6861 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
PtpreP49446 Gm23708-201ENSMUST00000104367 123 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PtpreP49446 Gm26181-201ENSMUST00000157687 106 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PtpreP49446 Gm25936-201ENSMUST00000179952 114 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PtpreP49446 Gm27894-201ENSMUST00000184177 92 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PtpreP49446 Vmn1r78-203ENSMUST00000228664 8100 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PtpreP49446 Gm26082-201ENSMUST00000104070 127 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PtpreP49446 Gm15115-201ENSMUST00000121145 264 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PtpreP49446 Gm6272-201ENSMUST00000121256 171 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PtpreP49446 Gm25440-201ENSMUST00000158279 154 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PtpreP49446 Gm26224-201ENSMUST00000082506 80 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PtpreP49446 Mir500-201ENSMUST00000093600 92 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PtpreP49446 Gm382-201ENSMUST00000096332 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
PtpreP49446 Mir873a-201ENSMUST00000104863 77 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PtpreP49446 Gm25010-201ENSMUST00000158403 65 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PtpreP49446 Gm42677-201ENSMUST00000196363 127 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PtpreP49446 Gm45754-201ENSMUST00000212380 279 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PtpreP49446 Gm22386-201ENSMUST00000158192 129 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PtpreP49446 Gm38323-201ENSMUST00000192450 210 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PtpreP49446 Mir3071-201ENSMUST00000093621 80 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PtpreP49446 Gm24233-201ENSMUST00000104317 122 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PtpreP49446 Mir3968-201ENSMUST00000175355 100 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PtpreP49446 Gm38074-201ENSMUST00000193467 145 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PtpreP49446 AC147560.1-201ENSMUST00000197528 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PtpreP49446 Gm26375-201ENSMUST00000101829 106 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PtpreP49446 Gm14533-201ENSMUST00000117088 93 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PtpreP49446 Scarna3b-201ENSMUST00000157533 139 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PtpreP49446 Gm24500-201ENSMUST00000158447 124 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PtpreP49446 Mir8119-201ENSMUST00000183371 129 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PtpreP49446 Arhgap5-204ENSMUST00000219443 9323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PtpreP49446 Gm24288-201ENSMUST00000157630 144 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PtpreP49446 Gm24222-201ENSMUST00000158834 93 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
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