Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Gm23020-201ENSMUST00000158766 253 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Hoxd11P23813 Gm18486-201ENSMUST00000184040 298 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Hoxd11P23813 AC129219.3-201ENSMUST00000223790 196 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxd11P23813 Gm25296-201ENSMUST00000082566 67 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxd11P23813 Snora31-201ENSMUST00000083213 130 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxd11P23813 Gm22866-201ENSMUST00000083947 177 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxd11P23813 F8-201ENSMUST00000033539 9784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxd11P23813 Vmn1r18-202ENSMUST00000228574 14315 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd11P23813 Gm26423-201ENSMUST00000104277 128 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd11P23813 Gm25307-201ENSMUST00000158885 106 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd11P23813 Gm23339-201ENSMUST00000158962 139 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd11P23813 Gm22925-201ENSMUST00000174956 102 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd11P23813 Gm23267-201ENSMUST00000178490 132 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd11P23813 Rictor-201ENSMUST00000061656 9312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd11P23813 Mir93-201ENSMUST00000083593 88 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd11P23813 Gm6444-201ENSMUST00000119611 458 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd11P23813 Prlr-202ENSMUST00000124470 9900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxd11P23813 Snora62-201ENSMUST00000082991 149 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd11P23813 Vmn1r75-203ENSMUST00000226855 6548 ntAPPRIS P2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd11P23813 Gm23671-201ENSMUST00000157472 103 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd11P23813 Gm24638-201ENSMUST00000179807 132 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd11P23813 Vmn1r73-202ENSMUST00000226516 6155 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd11P23813 Scai-201ENSMUST00000038874 10709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Hoxd11P23813 Gm22542-201ENSMUST00000158166 95 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd11P23813 Mir669m-2-201ENSMUST00000158355 98 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd11P23813 Gm25836-201ENSMUST00000158918 123 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd11P23813 Gm42845-201ENSMUST00000197766 105 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd11P23813 Gm44396-201ENSMUST00000199843 114 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd11P23813 AC158631.1-201ENSMUST00000219202 138 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd11P23813 Neb-203ENSMUST00000075301 21456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Hoxd11P23813 Gm27587-201ENSMUST00000185116 163 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Hoxd11P23813 Zmym2-201ENSMUST00000022511 6974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Hoxd11P23813 Gm23100-201ENSMUST00000083455 141 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Hoxd11P23813 Pak3-203ENSMUST00000112864 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Hoxd11P23813 Mir758-201ENSMUST00000103260 81 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Hoxd11P23813 Gm22469-201ENSMUST00000104118 133 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Hoxd11P23813 Gm44555-201ENSMUST00000209008 148 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Hoxd11P23813 AC161271.1-201ENSMUST00000226914 150 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Hoxd11P23813 Strbp-201ENSMUST00000028279 16348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Hoxd11P23813 DQ267100-201ENSMUST00000122600 72 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Hoxd11P23813 Gm28002-201ENSMUST00000184832 100 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Hoxd11P23813 Vmn1r80-209ENSMUST00000228578 11005 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Hoxd11P23813 Olfr1309-203ENSMUST00000214935 5448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Hoxd11P23813 Vmn1r185-206ENSMUST00000227479 6525 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Hoxd11P23813 Gm6272-201ENSMUST00000121256 171 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Hoxd11P23813 Gm22988-201ENSMUST00000122759 144 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Hoxd11P23813 Gm23173-201ENSMUST00000157161 160 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Hoxd11P23813 Gm24291-201ENSMUST00000157633 162 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Hoxd11P23813 Gm23257-201ENSMUST00000158322 132 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Hoxd11P23813 Mir448-201ENSMUST00000083516 112 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Hoxd11P23813 Usp9y-201ENSMUST00000091188 8094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
Hoxd11P23813 Olfr1116-202ENSMUST00000216364 9655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
Hoxd11P23813 Gm23130-201ENSMUST00000104252 74 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Hoxd11P23813 Gm23967-201ENSMUST00000175062 78 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Hoxd11P23813 Mir6925-201ENSMUST00000197857 70 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Hoxd11P23813 Gm22723-201ENSMUST00000083820 129 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Hoxd11P23813 Vmn1r28-201ENSMUST00000226813 10877 ntAPPRIS P1 BASIC3.18□□□□□ -1.9
Hoxd11P23813 Vmn1r28-202ENSMUST00000227805 10892 ntAPPRIS P1 BASIC3.18□□□□□ -1.9
Hoxd11P23813 n-R5s159-201ENSMUST00000122681 120 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Hoxd11P23813 Gm25161-201ENSMUST00000158913 132 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Hoxd11P23813 Mir7675-201ENSMUST00000184262 58 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Hoxd11P23813 Gm7209-201ENSMUST00000122339 333 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Hoxd11P23813 Gm3848-202ENSMUST00000151564 301 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
Hoxd11P23813 Mir7242-201ENSMUST00000183710 79 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Hoxd11P23813 Mir6394-201ENSMUST00000184738 99 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Hoxd11P23813 Gm45159-201ENSMUST00000208630 25241 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
Hoxd11P23813 Gm24278-201ENSMUST00000104239 127 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Hoxd11P23813 Gm21961-201ENSMUST00000110100 114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
Hoxd11P23813 Snord92-201ENSMUST00000175548 85 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Hoxd11P23813 Macf1-203ENSMUST00000097897 23495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
Hoxd11P23813 Mir301b-201ENSMUST00000102333 97 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Hoxd11P23813 Gm25787-201ENSMUST00000104709 92 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Hoxd11P23813 Gm24942-201ENSMUST00000158328 114 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Hoxd11P23813 Ighv1-23-201ENSMUST00000194625 351 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Hoxd11P23813 Vmn1r77-204ENSMUST00000228213 8094 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Hoxd11P23813 Gm24394-201ENSMUST00000158141 123 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Hoxd11P23813 Mir669n-201ENSMUST00000158636 54 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Hoxd11P23813 Gm21905-201ENSMUST00000177616 87 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
Hoxd11P23813 Mir297b-201ENSMUST00000102268 109 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Hoxd11P23813 Gm25094-201ENSMUST00000103992 131 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Hoxd11P23813 Mir344-201ENSMUST00000083634 95 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Hoxd11P23813 Ppp1r3a-201ENSMUST00000045096 6965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
Hoxd11P23813 Gm22785-201ENSMUST00000104087 132 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Hoxd11P23813 Mir222-201ENSMUST00000083537 79 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Hoxd11P23813 Snhg14-211ENSMUST00000189581 6861 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
Hoxd11P23813 Pak3-205ENSMUST00000112868 8163 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
Hoxd11P23813 Tug1-201ENSMUST00000132077 6719 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
Hoxd11P23813 Mir3968-201ENSMUST00000175355 100 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Hoxd11P23813 AC125190.3-201ENSMUST00000223224 121 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Hoxd11P23813 mt-Tw-201ENSMUST00000082397 67 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Hoxd11P23813 Gm25945-201ENSMUST00000122484 135 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Hoxd11P23813 Gm25035-201ENSMUST00000175414 77 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Hoxd11P23813 Mir344d-3-201ENSMUST00000175458 80 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Hoxd11P23813 Knl1-202ENSMUST00000028802 7800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
Hoxd11P23813 Olfr25-203ENSMUST00000214155 6479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
Hoxd11P23813 Gm26082-201ENSMUST00000104070 127 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Hoxd11P23813 Gm22520-201ENSMUST00000158269 129 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Hoxd11P23813 Mir8096-201ENSMUST00000184526 127 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Hoxd11P23813 Mir6985-201ENSMUST00000184641 61 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Hoxd11P23813 Gm23136-201ENSMUST00000083425 99 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
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