Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm22088-201ENSMUST00000158341 117 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Ccl20O89093 Gm22757-201ENSMUST00000102279 96 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Ccl20O89093 Gm23483-201ENSMUST00000104179 108 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Ccl20O89093 Gm25522-201ENSMUST00000158394 105 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Ccl20O89093 Gm24877-201ENSMUST00000158779 116 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Ccl20O89093 Gm17528-201ENSMUST00000171026 239 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Ccl20O89093 Mir6481-201ENSMUST00000184617 110 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Ccl20O89093 AC129019.2-201ENSMUST00000222063 202 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Ccl20O89093 Gm25978-201ENSMUST00000158698 90 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Ccl20O89093 Gm17364-201ENSMUST00000163881 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
Ccl20O89093 Gm22911-201ENSMUST00000177920 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Ccl20O89093 Mir672-201ENSMUST00000102331 100 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Ccl20O89093 Gm24555-201ENSMUST00000104548 124 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Ccl20O89093 Gm23531-201ENSMUST00000104567 68 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Ccl20O89093 Gm22384-201ENSMUST00000158187 104 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Ccl20O89093 Mir3089-201ENSMUST00000175350 84 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Ccl20O89093 Snora26-201ENSMUST00000175614 121 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Ccl20O89093 Gm23056-201ENSMUST00000082803 111 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Ccl20O89093 Gm24580-201ENSMUST00000103965 131 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Ccl20O89093 Gm25275-201ENSMUST00000104297 129 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Ccl20O89093 Gm24887-201ENSMUST00000104386 108 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Ccl20O89093 Gm23528-201ENSMUST00000104571 132 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Ccl20O89093 Mir145a-201ENSMUST00000083658 70 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Ccl20O89093 Gm23434-201ENSMUST00000157179 100 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
Ccl20O89093 Gm24508-201ENSMUST00000180104 107 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
Ccl20O89093 Gm22297-201ENSMUST00000083312 106 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
Ccl20O89093 Gm25510-201ENSMUST00000116986 123 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Ccl20O89093 Gm24001-201ENSMUST00000158463 85 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Ccl20O89093 Gm25249-201ENSMUST00000175471 78 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Ccl20O89093 Gm24455-201ENSMUST00000083348 131 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Ccl20O89093 Gm23500-201ENSMUST00000157735 98 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
Ccl20O89093 Gm24916-201ENSMUST00000157287 79 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
Ccl20O89093 Gm23783-201ENSMUST00000157941 102 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
Ccl20O89093 Gm26359-201ENSMUST00000158873 101 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
Ccl20O89093 Gm37796-201ENSMUST00000195327 134 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
Ccl20O89093 Gm42677-201ENSMUST00000196363 127 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
Ccl20O89093 Gm11116-201ENSMUST00000113257 54 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
Ccl20O89093 Gm24593-201ENSMUST00000122507 106 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
Ccl20O89093 Gm22942-201ENSMUST00000158563 124 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
Ccl20O89093 Mir191-201ENSMUST00000196210 74 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
Ccl20O89093 Gm24894-201ENSMUST00000122744 118 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
Ccl20O89093 Rab11fip4os2-202ENSMUST00000132921 355 ntTSL 1 (best) BASIC-0.52□□□□□ -2.49
Ccl20O89093 Mir214-201ENSMUST00000083582 110 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
Ccl20O89093 Gm26109-201ENSMUST00000083970 70 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
Ccl20O89093 Gm25622-201ENSMUST00000157217 104 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
Ccl20O89093 Mir7079-201ENSMUST00000184697 69 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
Ccl20O89093 AC140930.2-201ENSMUST00000221803 109 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
Ccl20O89093 Gm23140-201ENSMUST00000082487 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
Ccl20O89093 Mir7-1-201ENSMUST00000083500 108 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
Ccl20O89093 Gm25375-201ENSMUST00000158157 135 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Ccl20O89093 Snora16a-201ENSMUST00000083163 136 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Ccl20O89093 Gm10813-201ENSMUST00000099936 90 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Ccl20O89093 Gm24384-201ENSMUST00000122693 75 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Ccl20O89093 Gm25472-201ENSMUST00000175454 78 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Ccl20O89093 Rnu6-ps2-201ENSMUST00000178059 107 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Ccl20O89093 Gm22140-201ENSMUST00000158745 120 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
Ccl20O89093 Gm24823-201ENSMUST00000175092 91 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
Ccl20O89093 Mir369-201ENSMUST00000083627 79 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
Ccl20O89093 Traj53-201ENSMUST00000103690 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
Ccl20O89093 Gm17490-201ENSMUST00000166779 63 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
Ccl20O89093 AC166341.8-201ENSMUST00000221267 108 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Ccl20O89093 Snord42b-201ENSMUST00000083742 69 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Ccl20O89093 Gm25915-201ENSMUST00000104265 126 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Ccl20O89093 Gm11250-201ENSMUST00000142137 306 ntTSL 5 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
Ccl20O89093 Gm24064-201ENSMUST00000157486 106 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Ccl20O89093 AC132833.2-201ENSMUST00000228699 157 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Ccl20O89093 Snora62-201ENSMUST00000082991 149 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Ccl20O89093 Gm22157-201ENSMUST00000158410 104 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Ccl20O89093 Gm27749-201ENSMUST00000183651 125 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Ccl20O89093 Gm22672-201ENSMUST00000104414 134 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Ccl20O89093 Gm22149-201ENSMUST00000104442 136 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Ccl20O89093 Gm24801-201ENSMUST00000178503 105 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Ccl20O89093 Gm44308-201ENSMUST00000197080 99 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Ccl20O89093 Gm22055-201ENSMUST00000083388 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Ccl20O89093 Mir96-201ENSMUST00000083652 106 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Ccl20O89093 Mir23a-201ENSMUST00000083677 75 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Ccl20O89093 Gm26421-201ENSMUST00000104279 132 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Ccl20O89093 Gm23044-201ENSMUST00000157891 100 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Ccl20O89093 Gm23994-201ENSMUST00000158059 88 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Ccl20O89093 Gm25646-201ENSMUST00000178527 79 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Ccl20O89093 Mir7673-201ENSMUST00000184567 64 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Ccl20O89093 Gm39149-201ENSMUST00000210258 186 ntTSL 5 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
Ccl20O89093 Mir3071-201ENSMUST00000093621 80 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Ccl20O89093 Gm25247-201ENSMUST00000175475 90 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Ccl20O89093 Gm27549-201ENSMUST00000183508 62 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Ccl20O89093 Mir6915-201ENSMUST00000198839 69 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Ccl20O89093 Gm23314-201ENSMUST00000157218 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Ccl20O89093 Gm23278-201ENSMUST00000157911 143 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Ccl20O89093 Gm22070-201ENSMUST00000178475 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Ccl20O89093 Gm2077-201ENSMUST00000195017 319 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Ccl20O89093 Gm25991-201ENSMUST00000102439 99 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Ccl20O89093 Gm23494-201ENSMUST00000116830 126 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Ccl20O89093 Gm25388-201ENSMUST00000157339 151 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Ccl20O89093 Gm22087-201ENSMUST00000158339 88 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Ccl20O89093 Gm23726-201ENSMUST00000178937 67 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Ccl20O89093 Gm22286-201ENSMUST00000179708 107 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Ccl20O89093 AC167019.1-201ENSMUST00000227913 106 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Ccl20O89093 mt-Tv-201ENSMUST00000082389 69 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Ccl20O89093 Gm24918-201ENSMUST00000083022 130 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Ccl20O89093 Gm25496-201ENSMUST00000104430 120 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
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