Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Gm22708-201ENSMUST00000158987 103 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
DffaO54786 Gm25626-201ENSMUST00000177631 107 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
DffaO54786 AC108945.1-201ENSMUST00000226477 94 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
DffaO54786 Gm22055-201ENSMUST00000083388 107 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
DffaO54786 Gm45125-201ENSMUST00000206908 151 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
DffaO54786 AL606472.1-201ENSMUST00000224628 275 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
DffaO54786 Gm27263-201ENSMUST00000184760 76 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
DffaO54786 Olfr880-ps1-201ENSMUST00000212344 229 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
DffaO54786 AC132833.2-201ENSMUST00000228699 157 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
DffaO54786 Gm23445-201ENSMUST00000082800 107 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
DffaO54786 Traj53-201ENSMUST00000103690 66 ntAPPRIS P1 BASIC-2.33□□□□□ -2.78
DffaO54786 Gm24003-201ENSMUST00000158455 100 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
DffaO54786 Gm23581-201ENSMUST00000158531 63 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
DffaO54786 Gm23047-201ENSMUST00000177661 94 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
DffaO54786 Gm24697-201ENSMUST00000083881 107 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
DffaO54786 mt-Ts2-201ENSMUST00000082416 59 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
DffaO54786 Mir29b-1-201ENSMUST00000083670 71 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
DffaO54786 Snord80-201ENSMUST00000083801 81 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
DffaO54786 Olfr1108-ps1-201ENSMUST00000216930 121 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
DffaO54786 Mir7673-201ENSMUST00000184567 64 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
DffaO54786 Mir7218-201ENSMUST00000200050 59 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
DffaO54786 Gm25512-201ENSMUST00000083863 107 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
DffaO54786 Mir702-201ENSMUST00000102285 109 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
DffaO54786 Gm22165-201ENSMUST00000158414 103 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
DffaO54786 Gm23017-201ENSMUST00000177583 72 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
DffaO54786 AC126939.1-201ENSMUST00000224943 226 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
DffaO54786 Gm24612-201ENSMUST00000083267 107 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
DffaO54786 Gm25684-201ENSMUST00000083941 107 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
DffaO54786 Mir1298-201ENSMUST00000116681 98 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
DffaO54786 Gm24246-201ENSMUST00000157315 132 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
DffaO54786 Gm25653-201ENSMUST00000158473 138 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
DffaO54786 Gm24051-201ENSMUST00000158622 75 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
DffaO54786 Gm22385-201ENSMUST00000158189 101 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
DffaO54786 Gm22985-201ENSMUST00000122754 116 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
DffaO54786 Gm25417-201ENSMUST00000104212 131 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
DffaO54786 Gm25915-201ENSMUST00000104265 126 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
DffaO54786 Gm18502-201ENSMUST00000218679 199 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
DffaO54786 Gm26401-201ENSMUST00000158502 76 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
DffaO54786 Gm17020-201ENSMUST00000172274 274 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
DffaO54786 Mir1a-2-201ENSMUST00000198520 72 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
DffaO54786 Olfr1483-ps1-201ENSMUST00000208241 334 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
DffaO54786 Gm22805-201ENSMUST00000082739 107 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
DffaO54786 Gm24718-201ENSMUST00000157521 136 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
DffaO54786 Gm26084-201ENSMUST00000157903 104 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
DffaO54786 Gm23607-201ENSMUST00000104550 126 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
DffaO54786 Gm27415-201ENSMUST00000183720 95 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
DffaO54786 Mir669p-2-201ENSMUST00000103868 87 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
DffaO54786 Mir669p-1-201ENSMUST00000103884 87 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
DffaO54786 Gm23955-201ENSMUST00000157214 100 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
DffaO54786 Gm24211-201ENSMUST00000158264 107 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
DffaO54786 Gm25985-201ENSMUST00000122677 107 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
DffaO54786 Gm26403-201ENSMUST00000158500 105 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
DffaO54786 Gm25362-201ENSMUST00000158854 105 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
DffaO54786 Gm23421-201ENSMUST00000158934 104 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
DffaO54786 Gm25091-201ENSMUST00000103997 71 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
DffaO54786 Gm24132-201ENSMUST00000104745 91 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
DffaO54786 Gm22216-201ENSMUST00000157557 114 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
DffaO54786 Gm22459-201ENSMUST00000082577 108 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
DffaO54786 Gm23345-201ENSMUST00000083817 150 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
DffaO54786 Gm23545-201ENSMUST00000158205 104 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
DffaO54786 Gm22348-201ENSMUST00000178674 79 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
DffaO54786 Gm22772-201ENSMUST00000104451 121 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
DffaO54786 Gm24070-201ENSMUST00000104519 130 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
DffaO54786 Gm23335-201ENSMUST00000117021 90 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
DffaO54786 Gm22479-201ENSMUST00000122566 81 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
DffaO54786 Mir1948-201ENSMUST00000157325 85 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
DffaO54786 mt-Ti-201ENSMUST00000082393 69 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
DffaO54786 Gm25493-201ENSMUST00000157375 103 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
DffaO54786 Mir21b-201ENSMUST00000184317 108 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
DffaO54786 Gm17522-202ENSMUST00000186631 174 ntTSL 1 (best) BASIC-2.5□□□□□ -2.81
DffaO54786 Gm17412-202ENSMUST00000189566 174 ntTSL 1 (best) BASIC-2.5□□□□□ -2.81
DffaO54786 Gm44853-201ENSMUST00000209070 250 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
DffaO54786 Gm45655-201ENSMUST00000211625 160 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
DffaO54786 Gm23947-201ENSMUST00000093636 107 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
DffaO54786 Gm26091-201ENSMUST00000122704 82 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
DffaO54786 Gm25654-201ENSMUST00000158467 88 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
DffaO54786 Gm25367-201ENSMUST00000158846 106 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
DffaO54786 Gm23504-201ENSMUST00000158988 95 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
DffaO54786 Gm27549-201ENSMUST00000183508 62 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
DffaO54786 Gm23384-201ENSMUST00000158593 103 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
DffaO54786 mt-Tn-201ENSMUST00000082399 71 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
DffaO54786 Gm26454-201ENSMUST00000082682 107 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
DffaO54786 Gm23909-201ENSMUST00000104598 131 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
DffaO54786 Gm22434-201ENSMUST00000158549 122 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
DffaO54786 Gm8034-201ENSMUST00000178853 132 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
DffaO54786 Mir6951-201ENSMUST00000183910 75 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
DffaO54786 Traj29-201ENSMUST00000103712 60 ntAPPRIS P1 BASIC-2.54□□□□□ -2.82
DffaO54786 Gm25370-201ENSMUST00000158159 94 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
DffaO54786 Gm23477-201ENSMUST00000158882 128 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
DffaO54786 Mir451b-201ENSMUST00000196157 72 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
DffaO54786 Snora15-201ENSMUST00000177461 131 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
DffaO54786 Gm27937-201ENSMUST00000183605 88 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
DffaO54786 Gm44922-201ENSMUST00000206690 90 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
DffaO54786 Traj33-201ENSMUST00000103708 57 ntAPPRIS P1 BASIC-2.56□□□□□ -2.82
DffaO54786 Gm23579-201ENSMUST00000158528 103 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
DffaO54786 Mir669j-201ENSMUST00000179023 121 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
DffaO54786 Gm27798-201ENSMUST00000184989 71 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
DffaO54786 Snord80-202ENSMUST00000199023 77 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
DffaO54786 Gm24717-201ENSMUST00000157522 124 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
DffaO54786 Gm37545-201ENSMUST00000186512 148 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
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