Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Gm26387-201ENSMUST00000104238 132 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Gm3250E9Q1M3 Gm23708-201ENSMUST00000104367 123 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Gm3250E9Q1M3 Gm22720-201ENSMUST00000122710 87 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Gm3250E9Q1M3 Gm25521-201ENSMUST00000158393 108 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Gm3250E9Q1M3 AC211878.4-201ENSMUST00000220970 262 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Gm3250E9Q1M3 Vmn1r75-203ENSMUST00000226855 6548 ntAPPRIS P2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Gm3250E9Q1M3 Vmn1r75-206ENSMUST00000228463 6508 ntAPPRIS P2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Gm3250E9Q1M3 Wnk3-201ENSMUST00000096285 8551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Gm3250E9Q1M3 Vmn1r185-206ENSMUST00000227479 6525 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Gm3250E9Q1M3 Gm12432-201ENSMUST00000119540 186 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Gm3250E9Q1M3 Gm23716-201ENSMUST00000157348 144 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Gm3250E9Q1M3 Gm25958-201ENSMUST00000175114 71 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Gm3250E9Q1M3 Mir3968-201ENSMUST00000175355 100 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Gm3250E9Q1M3 Gm43944-201ENSMUST00000205220 120 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Gm3250E9Q1M3 Gm25170-201ENSMUST00000104191 129 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Gm3250E9Q1M3 Gm22517-201ENSMUST00000158265 136 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Gm3250E9Q1M3 Gm22801-201ENSMUST00000175624 84 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Gm3250E9Q1M3 Gm25158-201ENSMUST00000177681 121 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Gm3250E9Q1M3 Gm26229-201ENSMUST00000179699 121 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Gm3250E9Q1M3 Gm27717-201ENSMUST00000183933 151 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Gm3250E9Q1M3 Gm44476-201ENSMUST00000196225 91 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Gm3250E9Q1M3 Gm26449-201ENSMUST00000082452 104 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Gm3250E9Q1M3 Vmn1r185-210ENSMUST00000228367 6982 ntAPPRIS P1 BASIC1.81□□□□□ -2.12
Gm3250E9Q1M3 Gm6272-201ENSMUST00000121256 171 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Gm3250E9Q1M3 Gm23600-201ENSMUST00000157260 71 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Gm3250E9Q1M3 Gm24212-201ENSMUST00000158258 132 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Gm3250E9Q1M3 Gm25715-201ENSMUST00000158627 125 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Gm3250E9Q1M3 Gm25993-201ENSMUST00000175391 80 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Gm3250E9Q1M3 Gm22802-201ENSMUST00000175621 89 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Gm3250E9Q1M3 Gm27718-201ENSMUST00000183721 86 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Gm3250E9Q1M3 Gm25296-201ENSMUST00000082566 67 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Gm3250E9Q1M3 Gm25650-201ENSMUST00000083784 162 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Gm3250E9Q1M3 Gm8251-201ENSMUST00000168641 5985 ntAPPRIS P1 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Gm3250E9Q1M3 Skint5-202ENSMUST00000169631 4497 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
Gm3250E9Q1M3 Gm24237-201ENSMUST00000157790 132 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Gm3250E9Q1M3 Gm25307-201ENSMUST00000158885 106 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Gm3250E9Q1M3 Gm27326-201ENSMUST00000183504 95 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Gm3250E9Q1M3 Gm24342-201ENSMUST00000103907 104 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Gm3250E9Q1M3 Gm25460-201ENSMUST00000157954 127 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Gm3250E9Q1M3 Gm24930-201ENSMUST00000158315 83 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Gm3250E9Q1M3 Gm23020-201ENSMUST00000158766 253 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Gm3250E9Q1M3 Olfr64-201ENSMUST00000081748 5001 ntAPPRIS P1 BASIC1.78□□□□□ -2.13
Gm3250E9Q1M3 Gm25368-201ENSMUST00000158847 131 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Gm3250E9Q1M3 Gm20477-201ENSMUST00000174028 280 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Gm3250E9Q1M3 Gm26082-201ENSMUST00000104070 127 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Gm3250E9Q1M3 Mir5104-201ENSMUST00000175319 94 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Gm3250E9Q1M3 Gm24366-201ENSMUST00000175383 86 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Gm3250E9Q1M3 Mir6342-201ENSMUST00000183870 125 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Gm3250E9Q1M3 Gm27980-201ENSMUST00000184094 169 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Gm3250E9Q1M3 AL603834.1-201ENSMUST00000198372 121 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Gm3250E9Q1M3 Gm44384-201ENSMUST00000200208 114 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Gm3250E9Q1M3 B3galt2-201ENSMUST00000038252 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
Gm3250E9Q1M3 Traj7-201ENSMUST00000103733 59 ntAPPRIS P1 BASIC1.75□□□□□ -2.13
Gm3250E9Q1M3 Gm13065-201ENSMUST00000119178 141 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Gm3250E9Q1M3 Gm26277-201ENSMUST00000157097 152 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Gm3250E9Q1M3 Mir6394-201ENSMUST00000184738 99 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Gm3250E9Q1M3 Mir7215-201ENSMUST00000200383 51 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Gm3250E9Q1M3 Olfr592-202ENSMUST00000106893 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
Gm3250E9Q1M3 Mir3106-201ENSMUST00000175401 82 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Gm3250E9Q1M3 Gm44347-201ENSMUST00000199602 108 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Gm3250E9Q1M3 Pak3-205ENSMUST00000112868 8163 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
Gm3250E9Q1M3 Gm25402-201ENSMUST00000082966 131 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Gm3250E9Q1M3 Mir377-201ENSMUST00000083504 68 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Gm3250E9Q1M3 Olfr728-202ENSMUST00000213685 7087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Gm3250E9Q1M3 Ppp1r3a-201ENSMUST00000045096 6965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
Gm3250E9Q1M3 Mir709-201ENSMUST00000102190 88 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Gm3250E9Q1M3 Gm22542-201ENSMUST00000158166 95 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Gm3250E9Q1M3 Gm24736-201ENSMUST00000158862 130 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Gm3250E9Q1M3 Vmn1r-ps69-201ENSMUST00000172759 201 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Gm3250E9Q1M3 Gm22403-201ENSMUST00000174919 84 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Gm3250E9Q1M3 Mir6418-201ENSMUST00000185075 115 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Gm3250E9Q1M3 Mir1949-202ENSMUST00000199259 70 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Gm3250E9Q1M3 Snhg14-211ENSMUST00000189581 6861 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
Gm3250E9Q1M3 Thoc2-201ENSMUST00000047037 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Gm3250E9Q1M3 Vmn1r78-202ENSMUST00000228244 7931 ntAPPRIS P1 BASIC1.71□□□□□ -2.14
Gm3250E9Q1M3 Atp11c-205ENSMUST00000154051 6039 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
Gm3250E9Q1M3 Gm25254-201ENSMUST00000157239 104 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Gm3250E9Q1M3 Gm24690-201ENSMUST00000157759 97 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Gm3250E9Q1M3 Gm25862-201ENSMUST00000158250 129 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Gm3250E9Q1M3 Mir6352-201ENSMUST00000184495 116 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Gm3250E9Q1M3 Gm24233-201ENSMUST00000104317 122 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Gm3250E9Q1M3 Gm23208-201ENSMUST00000158666 127 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Gm3250E9Q1M3 Mir7679-201ENSMUST00000183379 63 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Gm3250E9Q1M3 Gm27443-201ENSMUST00000184660 98 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Gm3250E9Q1M3 Mir7665-201ENSMUST00000184907 63 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Gm3250E9Q1M3 Gm27587-201ENSMUST00000185116 163 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Gm3250E9Q1M3 Gm43911-201ENSMUST00000203097 76 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Gm3250E9Q1M3 Gm45617-201ENSMUST00000211132 209 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Gm3250E9Q1M3 AC118006.1-201ENSMUST00000224211 501 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Gm3250E9Q1M3 H2al1n-201ENSMUST00000105137 514 ntAPPRIS P1 BASIC1.69□□□□□ -2.14
Gm3250E9Q1M3 Gm22416-201ENSMUST00000158590 88 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Gm3250E9Q1M3 Gm25119-201ENSMUST00000158815 88 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Gm3250E9Q1M3 Mir100-201ENSMUST00000175270 80 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Gm3250E9Q1M3 Gm27527-201ENSMUST00000183903 99 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Gm3250E9Q1M3 Gm27894-201ENSMUST00000184177 92 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Gm3250E9Q1M3 Gm28794-201ENSMUST00000185276 136 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Gm3250E9Q1M3 Gm25275-201ENSMUST00000104297 129 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Gm3250E9Q1M3 Gm22466-201ENSMUST00000175278 69 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Gm3250E9Q1M3 Mir6985-201ENSMUST00000184641 61 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Gm3250E9Q1M3 mt-Tw-201ENSMUST00000082397 67 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 201 ms