Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37832-201ENSMUST00000118935 189 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44589-201ENSMUST00000207025 115 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26168-201ENSMUST00000083787 112 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snord80-201ENSMUST00000083801 81 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12086-201ENSMUST00000120863 228 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23630-201ENSMUST00000175292 104 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT010505.1-201ENSMUST00000227026 396 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22836-201ENSMUST00000158441 61 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir6957-201ENSMUST00000183708 64 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23947-201ENSMUST00000093636 107 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25091-201ENSMUST00000103997 71 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24141-201ENSMUST00000122776 115 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25870-201ENSMUST00000179845 79 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37545-201ENSMUST00000186512 148 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snord16a-201ENSMUST00000083895 99 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21940-201ENSMUST00000204940 2278 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26091-201ENSMUST00000122704 82 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir717-201ENSMUST00000102259 109 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn2r-ps116-201ENSMUST00000175997 126 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43943-201ENSMUST00000204201 113 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 mt-Ts1-201ENSMUST00000082403 69 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25367-201ENSMUST00000158846 106 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir669j-201ENSMUST00000179023 121 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir6951-201ENSMUST00000183910 75 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14838-201ENSMUST00000118913 248 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24697-201ENSMUST00000083881 107 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir543-201ENSMUST00000102286 76 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snord90-201ENSMUST00000104568 111 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23337-201ENSMUST00000158959 118 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 AL603630.1-201ENSMUST00000214781 147 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir3071-201ENSMUST00000093621 80 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22335-201ENSMUST00000157724 99 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25010-201ENSMUST00000158403 65 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir1839-201ENSMUST00000175366 127 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22595-201ENSMUST00000104250 130 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22772-201ENSMUST00000104451 121 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24554-201ENSMUST00000158654 73 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22708-201ENSMUST00000158987 103 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mirlet7a-2-201ENSMUST00000175029 96 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23974-201ENSMUST00000083321 131 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22055-201ENSMUST00000083388 107 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8034-201ENSMUST00000178853 132 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26097-201ENSMUST00000179642 93 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24701-201ENSMUST00000101946 105 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22373-201ENSMUST00000104584 89 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24054-201ENSMUST00000158619 105 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24197-201ENSMUST00000175085 109 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Traj53-201ENSMUST00000103690 66 ntAPPRIS P1 BASIC-2.62□□□□□ -2.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22139-201ENSMUST00000158747 105 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26084-201ENSMUST00000157903 104 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23384-201ENSMUST00000158593 103 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45002-201ENSMUST00000208045 120 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44853-201ENSMUST00000209070 250 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25652-201ENSMUST00000083780 103 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24091-201ENSMUST00000082550 83 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25410-201ENSMUST00000083758 137 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23711-201ENSMUST00000083856 83 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11250-201ENSMUST00000142137 306 ntTSL 5 BASIC-2.65□□□□□ -2.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22016-201ENSMUST00000158793 114 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC122335.1-201ENSMUST00000217587 175 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26262-201ENSMUST00000158024 127 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25370-201ENSMUST00000158159 94 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22539-201ENSMUST00000158167 117 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23261-201ENSMUST00000158316 136 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24225-201ENSMUST00000158825 98 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27465-201ENSMUST00000184290 91 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 mt-Tr-201ENSMUST00000082412 68 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26204-201ENSMUST00000082906 107 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27851-201ENSMUST00000183529 63 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir7015-201ENSMUST00000199525 64 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp813-ps-201ENSMUST00000186652 2506 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snord123-201ENSMUST00000158692 71 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27263-201ENSMUST00000184760 76 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24459-201ENSMUST00000082730 86 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snord57-201ENSMUST00000083338 72 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23017-201ENSMUST00000177583 72 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45125-201ENSMUST00000206908 151 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26498-201ENSMUST00000177799 79 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26230-201ENSMUST00000180141 79 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir7673-201ENSMUST00000184567 64 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 mt-Tn-201ENSMUST00000082399 71 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22989-201ENSMUST00000158313 86 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23607-201ENSMUST00000104550 126 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22165-201ENSMUST00000158414 103 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22606-201ENSMUST00000158290 103 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26426-201ENSMUST00000177866 123 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26060-201ENSMUST00000180094 123 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23003-201ENSMUST00000179948 107 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir702-201ENSMUST00000102285 109 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43038-201ENSMUST00000202359 88 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC109214.2-201ENSMUST00000220089 358 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24051-201ENSMUST00000158622 75 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18502-201ENSMUST00000218679 199 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25889-201ENSMUST00000157775 107 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25653-201ENSMUST00000158473 138 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir29b-1-201ENSMUST00000083670 71 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25684-201ENSMUST00000083941 107 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24003-201ENSMUST00000158455 100 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22196-201ENSMUST00000116865 109 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 198.5 ms