Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Ranbp2-201ENSMUST00000003310 9608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Prr29B1ARI9 Gm24387-201ENSMUST00000104625 90 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Prr29B1ARI9 Gm22486-201ENSMUST00000116815 137 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Prr29B1ARI9 Gm22947-201ENSMUST00000158559 91 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Prr29B1ARI9 Mir7017-201ENSMUST00000184894 62 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Prr29B1ARI9 AC129019.2-201ENSMUST00000222063 202 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Prr29B1ARI9 Mir377-201ENSMUST00000083504 68 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Prr29B1ARI9 Snora36b-201ENSMUST00000104383 132 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prr29B1ARI9 Gm23494-201ENSMUST00000116830 126 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prr29B1ARI9 AC211878.4-201ENSMUST00000220970 262 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prr29B1ARI9 Mir322-201ENSMUST00000083484 95 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prr29B1ARI9 Traj26-201ENSMUST00000103715 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Prr29B1ARI9 Gm45654-201ENSMUST00000210980 123 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Prr29B1ARI9 Gm23301-201ENSMUST00000082713 65 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Prr29B1ARI9 Olfr851-202ENSMUST00000214130 7123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Prr29B1ARI9 Skint5-202ENSMUST00000169631 4497 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Prr29B1ARI9 Gm16510-201ENSMUST00000153501 249 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Prr29B1ARI9 Mir7681-201ENSMUST00000184834 72 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Prr29B1ARI9 Mir3057-201ENSMUST00000175040 91 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Prr29B1ARI9 Mir6406-201ENSMUST00000183592 120 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Prr29B1ARI9 N4bp2l2-201ENSMUST00000118316 8982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Prr29B1ARI9 Gm25945-201ENSMUST00000122484 135 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Prr29B1ARI9 Zfp280c-202ENSMUST00000076635 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Prr29B1ARI9 Gm22083-201ENSMUST00000157586 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Prr29B1ARI9 Gm24098-201ENSMUST00000102075 109 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Prr29B1ARI9 Gm25381-201ENSMUST00000102078 109 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Prr29B1ARI9 Mir542-201ENSMUST00000102186 85 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Prr29B1ARI9 Gm24049-201ENSMUST00000102409 100 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Prr29B1ARI9 AC168062.3-201ENSMUST00000227025 165 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Prr29B1ARI9 Gm34276-201ENSMUST00000222558 439 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Prr29B1ARI9 Gm25796-201ENSMUST00000082645 163 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Prr29B1ARI9 Gm25788-201ENSMUST00000082721 131 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Prr29B1ARI9 Vmn1r78-202ENSMUST00000228244 7931 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Prr29B1ARI9 Gm23980-201ENSMUST00000157135 158 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Prr29B1ARI9 Gm23106-201ENSMUST00000157554 101 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Prr29B1ARI9 Mir497-201ENSMUST00000200557 84 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Prr29B1ARI9 Gm23240-201ENSMUST00000083009 121 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Prr29B1ARI9 Snord104-201ENSMUST00000083192 70 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Prr29B1ARI9 Gm25650-201ENSMUST00000083784 162 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Prr29B1ARI9 Mir222-201ENSMUST00000083537 79 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Prr29B1ARI9 Gm24278-201ENSMUST00000104239 127 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Prr29B1ARI9 Gm25307-201ENSMUST00000158885 106 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Prr29B1ARI9 Gm25993-201ENSMUST00000175391 80 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Prr29B1ARI9 Mir1949-202ENSMUST00000199259 70 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Prr29B1ARI9 Gm43944-201ENSMUST00000205220 120 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Prr29B1ARI9 AC127578.1-201ENSMUST00000227289 93 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Prr29B1ARI9 Gm22652-201ENSMUST00000083207 131 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Prr29B1ARI9 Gm24900-201ENSMUST00000158128 134 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Prr29B1ARI9 Gm27717-201ENSMUST00000183933 151 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Prr29B1ARI9 Gm43722-201ENSMUST00000196054 124 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Prr29B1ARI9 Gm23289-201ENSMUST00000175615 108 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Prr29B1ARI9 Gm27979-201ENSMUST00000185126 56 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Prr29B1ARI9 Mir6896-201ENSMUST00000198033 73 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Prr29B1ARI9 Gm25368-201ENSMUST00000158847 131 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Prr29B1ARI9 Gm24177-201ENSMUST00000158927 131 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Prr29B1ARI9 Gm42845-201ENSMUST00000197766 105 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Prr29B1ARI9 Gm44408-201ENSMUST00000200205 66 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Prr29B1ARI9 Gm24233-201ENSMUST00000104317 122 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Prr29B1ARI9 Mir1933-201ENSMUST00000158930 88 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Prr29B1ARI9 Gm22093-201ENSMUST00000158980 111 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Prr29B1ARI9 Gm25296-201ENSMUST00000082566 67 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Prr29B1ARI9 Olfr1013-202ENSMUST00000216397 4925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Prr29B1ARI9 Mir709-201ENSMUST00000102190 88 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Prr29B1ARI9 Gm13065-201ENSMUST00000119178 141 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Prr29B1ARI9 Gm25715-201ENSMUST00000158627 125 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Prr29B1ARI9 Mir100-201ENSMUST00000175270 80 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Prr29B1ARI9 Gm25158-201ENSMUST00000177681 121 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Prr29B1ARI9 Gm26229-201ENSMUST00000179699 121 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Prr29B1ARI9 Mir7683-201ENSMUST00000183842 61 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Prr29B1ARI9 Snora62-201ENSMUST00000082991 149 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Prr29B1ARI9 Gm25903-201ENSMUST00000158492 103 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Prr29B1ARI9 Mir1961-201ENSMUST00000158643 112 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Prr29B1ARI9 Gm7173-205ENSMUST00000197180 9412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Prr29B1ARI9 n-R5s159-201ENSMUST00000122681 120 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Prr29B1ARI9 Mir423-201ENSMUST00000083584 109 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Prr29B1ARI9 Snord69-201ENSMUST00000104024 80 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Prr29B1ARI9 Gm23033-201ENSMUST00000157996 134 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Prr29B1ARI9 Vmn1r-ps69-201ENSMUST00000172759 201 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Prr29B1ARI9 Vmn1r75-204ENSMUST00000227611 4336 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Prr29B1ARI9 Gpr174-207ENSMUST00000178838 4955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Prr29B1ARI9 Gm27980-201ENSMUST00000184094 169 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Prr29B1ARI9 Mir7026-201ENSMUST00000184384 67 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Prr29B1ARI9 AC122428.1-201ENSMUST00000213709 217 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Prr29B1ARI9 Gm24661-201ENSMUST00000083205 104 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Prr29B1ARI9 Gm22239-201ENSMUST00000175220 103 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Prr29B1ARI9 Gm22466-201ENSMUST00000175278 69 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Prr29B1ARI9 Snord87-201ENSMUST00000175437 87 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Prr29B1ARI9 Mir758-201ENSMUST00000103260 81 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Prr29B1ARI9 Mir295-201ENSMUST00000104694 69 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Prr29B1ARI9 Gm6444-201ENSMUST00000119611 458 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Prr29B1ARI9 Mir3086-201ENSMUST00000175072 87 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Prr29B1ARI9 Gm44555-201ENSMUST00000209008 148 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Prr29B1ARI9 Mir7232-201ENSMUST00000197929 74 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Prr29B1ARI9 Gm26922-201ENSMUST00000082687 72 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Prr29B1ARI9 Traj39-201ENSMUST00000103703 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Prr29B1ARI9 Gm23010-201ENSMUST00000104151 126 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Prr29B1ARI9 Gm24500-201ENSMUST00000158447 124 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Prr29B1ARI9 Gm23339-201ENSMUST00000158962 139 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Prr29B1ARI9 Gm27798-201ENSMUST00000184989 71 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Prr29B1ARI9 Gm44490-201ENSMUST00000198566 127 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132 ms