Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Mir200b-201ENSMUST00000083615 70 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Rnft1Q9DCN7 Gm26089-201ENSMUST00000157898 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Rnft1Q9DCN7 Gm23857-201ENSMUST00000158379 111 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Rnft1Q9DCN7 Gm23339-201ENSMUST00000158962 139 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Rnft1Q9DCN7 Gm26158-201ENSMUST00000158973 119 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Rnft1Q9DCN7 Gm23967-201ENSMUST00000175062 78 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Rnft1Q9DCN7 Mir324-201ENSMUST00000083600 89 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Rnft1Q9DCN7 Traj60-201ENSMUST00000167781 54 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Rnft1Q9DCN7 Gm44490-201ENSMUST00000198566 127 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Rnft1Q9DCN7 Snord96a-201ENSMUST00000082791 81 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Rnft1Q9DCN7 Gm26207-201ENSMUST00000082909 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Rnft1Q9DCN7 Olfr820-203ENSMUST00000215791 3956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Rnft1Q9DCN7 Gm24865-201ENSMUST00000103246 96 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Rnft1Q9DCN7 Gm25274-201ENSMUST00000104296 135 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Rnft1Q9DCN7 Mir6390-201ENSMUST00000184405 129 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Rnft1Q9DCN7 Gm38295-201ENSMUST00000191951 151 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Rnft1Q9DCN7 Gm23570-201ENSMUST00000083029 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r75-202ENSMUST00000226622 6638 ntAPPRIS P2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Rnft1Q9DCN7 Gm24271-201ENSMUST00000102327 111 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Rnft1Q9DCN7 Gm24202-201ENSMUST00000082948 103 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Rnft1Q9DCN7 Gm25110-201ENSMUST00000116684 121 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Rnft1Q9DCN7 Gm25775-201ENSMUST00000116716 121 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Rnft1Q9DCN7 Gm24795-201ENSMUST00000116737 121 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Rnft1Q9DCN7 Gm25171-201ENSMUST00000116926 121 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Rnft1Q9DCN7 Gm22030-201ENSMUST00000116942 63 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Rnft1Q9DCN7 Gm11333-201ENSMUST00000119479 148 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Rnft1Q9DCN7 Rab11fip4os2-202ENSMUST00000132921 355 ntTSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
Rnft1Q9DCN7 Gm23122-201ENSMUST00000157645 103 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Rnft1Q9DCN7 Mir1933-201ENSMUST00000158930 88 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Rnft1Q9DCN7 Gm22862-201ENSMUST00000178593 121 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Rnft1Q9DCN7 Gm27420-201ENSMUST00000183823 79 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Rnft1Q9DCN7 Gm22753-201ENSMUST00000083657 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Rnft1Q9DCN7 Tex15-201ENSMUST00000009772 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
Rnft1Q9DCN7 Mir216b-201ENSMUST00000102363 86 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Rnft1Q9DCN7 Gm25609-201ENSMUST00000104019 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Rnft1Q9DCN7 Gm25170-201ENSMUST00000104191 129 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Rnft1Q9DCN7 Gm25495-201ENSMUST00000104431 131 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Rnft1Q9DCN7 Gm24988-201ENSMUST00000104460 121 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Rnft1Q9DCN7 Gm16225-201ENSMUST00000146152 276 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Rnft1Q9DCN7 Gm22541-201ENSMUST00000158165 127 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Rnft1Q9DCN7 Gm23291-201ENSMUST00000175611 78 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Rnft1Q9DCN7 Gm23410-201ENSMUST00000179967 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Rnft1Q9DCN7 Gm26712-201ENSMUST00000180813 217 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Rnft1Q9DCN7 Gm16399-201ENSMUST00000181423 219 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Rnft1Q9DCN7 Gm44483-201ENSMUST00000197203 97 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Rnft1Q9DCN7 Gm22505-201ENSMUST00000082956 108 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Rnft1Q9DCN7 Gm22363-201ENSMUST00000083100 108 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Rnft1Q9DCN7 Gm23814-201ENSMUST00000083230 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Rnft1Q9DCN7 Gm23203-201ENSMUST00000104374 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Rnft1Q9DCN7 Gm11857-201ENSMUST00000119817 324 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Rnft1Q9DCN7 Gm22788-201ENSMUST00000157876 61 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Rnft1Q9DCN7 Gm24902-201ENSMUST00000158126 123 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Rnft1Q9DCN7 Gm38074-201ENSMUST00000193467 145 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
Rnft1Q9DCN7 AC116319.1-201ENSMUST00000227765 222 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Rnft1Q9DCN7 mt-Tl2-201ENSMUST00000082417 71 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Rnft1Q9DCN7 Gm13231-201ENSMUST00000119218 2850 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Rnft1Q9DCN7 Mir1197-201ENSMUST00000117037 120 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Rnft1Q9DCN7 Gm22095-201ENSMUST00000158984 150 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Rnft1Q9DCN7 Gm26499-201ENSMUST00000178544 79 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Rnft1Q9DCN7 Gm26096-201ENSMUST00000179084 79 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Rnft1Q9DCN7 Mir7665-201ENSMUST00000184907 63 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Rnft1Q9DCN7 Mir6962-201ENSMUST00000199512 63 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Rnft1Q9DCN7 Gm43944-201ENSMUST00000205220 120 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Rnft1Q9DCN7 Gm23301-201ENSMUST00000082713 65 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Rnft1Q9DCN7 Gm25622-201ENSMUST00000157217 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Rnft1Q9DCN7 Gm22559-201ENSMUST00000157329 134 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Rnft1Q9DCN7 Gm23826-201ENSMUST00000157394 119 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Rnft1Q9DCN7 Gm25160-201ENSMUST00000158914 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Rnft1Q9DCN7 Mir3968-201ENSMUST00000175355 100 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Rnft1Q9DCN7 Gm27711-201ENSMUST00000183802 118 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Rnft1Q9DCN7 Gm44488-201ENSMUST00000199467 119 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Rnft1Q9DCN7 Snora75-201ENSMUST00000082903 133 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Rnft1Q9DCN7 Gm23376-201ENSMUST00000082938 160 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Rnft1Q9DCN7 Mir211-201ENSMUST00000083651 106 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Rnft1Q9DCN7 Sycp1-ps1-201ENSMUST00000207882 2768 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Rnft1Q9DCN7 Gm25416-201ENSMUST00000104221 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Rnft1Q9DCN7 Gm10945-201ENSMUST00000105596 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Rnft1Q9DCN7 Gm24290-201ENSMUST00000157634 96 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Rnft1Q9DCN7 Gm22100-201ENSMUST00000157926 63 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Rnft1Q9DCN7 Gm23761-201ENSMUST00000158347 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Rnft1Q9DCN7 Gm23114-201ENSMUST00000158478 117 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Rnft1Q9DCN7 Mir1954-201ENSMUST00000175595 86 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Rnft1Q9DCN7 Gm23245-201ENSMUST00000083370 135 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r75-204ENSMUST00000227611 4336 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Rnft1Q9DCN7 Snord69-201ENSMUST00000104024 80 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Rnft1Q9DCN7 Gm6985-201ENSMUST00000121255 271 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Rnft1Q9DCN7 Gm25056-201ENSMUST00000157372 62 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Rnft1Q9DCN7 Gm25693-201ENSMUST00000175443 85 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Rnft1Q9DCN7 Gm43907-201ENSMUST00000203128 117 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Rnft1Q9DCN7 Gm25128-201ENSMUST00000083339 76 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Rnft1Q9DCN7 Gm23329-201ENSMUST00000157415 108 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Rnft1Q9DCN7 Gm22663-201ENSMUST00000158721 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Rnft1Q9DCN7 Gm25831-201ENSMUST00000158924 163 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Rnft1Q9DCN7 Gm22466-201ENSMUST00000175278 69 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Rnft1Q9DCN7 Gm38323-201ENSMUST00000192450 210 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Rnft1Q9DCN7 Gm20305-201ENSMUST00000193226 177 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Rnft1Q9DCN7 Gm44396-201ENSMUST00000199843 114 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Rnft1Q9DCN7 Gm6293-201ENSMUST00000050339 195 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Rnft1Q9DCN7 Gm24311-201ENSMUST00000082570 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Rnft1Q9DCN7 Gm22980-201ENSMUST00000082608 70 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 143.5 ms