Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Gm22030-201ENSMUST00000116942 63 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Apobec3Q99J72 Gm6272-201ENSMUST00000121256 171 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Apobec3Q99J72 Gm24290-201ENSMUST00000157634 96 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Apobec3Q99J72 Gm24801-201ENSMUST00000178503 105 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Apobec3Q99J72 Gm21954-201ENSMUST00000179544 51 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Apobec3Q99J72 Gm24527-201ENSMUST00000082920 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Apobec3Q99J72 Gm23790-201ENSMUST00000083013 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Apobec3Q99J72 Zfp654-201ENSMUST00000052588 4741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
Apobec3Q99J72 Gm24009-201ENSMUST00000157734 93 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Apobec3Q99J72 Gm22212-201ENSMUST00000158096 106 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Apobec3Q99J72 Gm23261-201ENSMUST00000158316 136 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Apobec3Q99J72 Gm26466-201ENSMUST00000179615 79 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Apobec3Q99J72 Gm27974-201ENSMUST00000183415 105 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Apobec3Q99J72 Mir6380-201ENSMUST00000184334 81 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Apobec3Q99J72 Gm22672-201ENSMUST00000104414 134 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Apobec3Q99J72 Olfr1100-202ENSMUST00000117211 2937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
Apobec3Q99J72 Gm25056-201ENSMUST00000157372 62 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Apobec3Q99J72 AC153930.1-201ENSMUST00000220016 358 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
Apobec3Q99J72 Gm22786-201ENSMUST00000104086 122 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Apobec3Q99J72 Gm25506-201ENSMUST00000104339 70 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Apobec3Q99J72 Gm10974-201ENSMUST00000107486 126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
Apobec3Q99J72 Gm27297-201ENSMUST00000183395 105 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Apobec3Q99J72 Mir7091-201ENSMUST00000184075 79 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Apobec3Q99J72 Mir7079-201ENSMUST00000184697 69 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Apobec3Q99J72 Gm27587-201ENSMUST00000185116 163 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Apobec3Q99J72 AC211878.4-201ENSMUST00000220970 262 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Apobec3Q99J72 Gm45265-201ENSMUST00000210852 2497 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Apobec3Q99J72 B230307C23Rik-201ENSMUST00000113729 192 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
Apobec3Q99J72 Gm23991-201ENSMUST00000117033 93 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Apobec3Q99J72 Gm24500-201ENSMUST00000158447 124 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Apobec3Q99J72 Mir100-201ENSMUST00000175270 80 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Apobec3Q99J72 Gm24686-201ENSMUST00000157755 93 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Apobec3Q99J72 Gm22541-201ENSMUST00000158165 127 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Apobec3Q99J72 Gm23853-201ENSMUST00000158375 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Apobec3Q99J72 Scarna3a-201ENSMUST00000158911 140 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Apobec3Q99J72 Gm25161-201ENSMUST00000158913 132 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Apobec3Q99J72 Mir15a-201ENSMUST00000175266 84 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Apobec3Q99J72 Mir5619-201ENSMUST00000176065 61 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Apobec3Q99J72 Gm27645-201ENSMUST00000183348 77 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Apobec3Q99J72 Mir377-201ENSMUST00000083504 68 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Apobec3Q99J72 Mir27b-201ENSMUST00000083541 73 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Apobec3Q99J72 Gm24777-201ENSMUST00000157644 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Apobec3Q99J72 Gm23893-201ENSMUST00000158106 134 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Apobec3Q99J72 Gm38295-201ENSMUST00000191951 151 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Apobec3Q99J72 Gm22251-201ENSMUST00000083216 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Apobec3Q99J72 Gm24648-201ENSMUST00000157111 132 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Apobec3Q99J72 Mir10b-201ENSMUST00000083566 68 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Apobec3Q99J72 Gm5581-201ENSMUST00000072940 2550 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Apobec3Q99J72 Mir216b-201ENSMUST00000102363 86 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Apobec3Q99J72 Gm23349-201ENSMUST00000158432 98 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Apobec3Q99J72 Gm25166-201ENSMUST00000158909 111 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Apobec3Q99J72 Gm23416-201ENSMUST00000175520 95 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Apobec3Q99J72 Gm24020-201ENSMUST00000180156 108 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Apobec3Q99J72 Gm44932-201ENSMUST00000206799 121 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Apobec3Q99J72 Gm25138-201ENSMUST00000083248 136 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Apobec3Q99J72 Gm23989-201ENSMUST00000117030 66 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Apobec3Q99J72 Gm22729-201ENSMUST00000158088 129 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Apobec3Q99J72 Gm25449-201ENSMUST00000179389 79 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Apobec3Q99J72 Mir6342-201ENSMUST00000183870 125 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Apobec3Q99J72 Gm44211-201ENSMUST00000204867 145 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Apobec3Q99J72 Gm23038-201ENSMUST00000083873 104 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Apobec3Q99J72 Gm24579-201ENSMUST00000103964 144 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Apobec3Q99J72 Mup-ps5-201ENSMUST00000118667 99 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Apobec3Q99J72 AC122327.1-201ENSMUST00000220778 108 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Apobec3Q99J72 Gm22788-201ENSMUST00000157876 61 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Apobec3Q99J72 Gm29535-201ENSMUST00000185723 109 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Apobec3Q99J72 Gm28143-201ENSMUST00000191082 109 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Apobec3Q99J72 Mir33-201ENSMUST00000083531 69 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Apobec3Q99J72 Mir29a-201ENSMUST00000083676 88 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Apobec3Q99J72 Gm24445-201ENSMUST00000083981 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Apobec3Q99J72 Traj13-201ENSMUST00000103728 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.92□□□□□ -2.26
Apobec3Q99J72 Gm23652-201ENSMUST00000116752 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Apobec3Q99J72 Gm26425-201ENSMUST00000122529 82 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Apobec3Q99J72 Rab11fip4os2-202ENSMUST00000132921 355 ntTSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
Apobec3Q99J72 Gm24208-201ENSMUST00000082783 135 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Apobec3Q99J72 Snord32a-201ENSMUST00000083285 83 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Apobec3Q99J72 Snord35a-201ENSMUST00000083884 90 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Apobec3Q99J72 Gm25022-201ENSMUST00000102205 83 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Apobec3Q99J72 Gm26478-201ENSMUST00000122611 133 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Apobec3Q99J72 Gm22140-201ENSMUST00000158745 120 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Apobec3Q99J72 Mir467a-6-201ENSMUST00000177790 83 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Apobec3Q99J72 Mir467a-3-201ENSMUST00000178082 83 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Apobec3Q99J72 Mir467a-7-201ENSMUST00000178635 83 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Apobec3Q99J72 Mir467a-10-201ENSMUST00000179320 83 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Apobec3Q99J72 Mir467a-5-201ENSMUST00000179352 83 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Apobec3Q99J72 Mir467a-2-201ENSMUST00000179447 83 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Apobec3Q99J72 Mir467a-9-201ENSMUST00000179752 83 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Apobec3Q99J72 Mir467a-4-201ENSMUST00000179923 83 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Apobec3Q99J72 Mir467a-8-201ENSMUST00000180070 83 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Apobec3Q99J72 Gm26712-201ENSMUST00000180813 217 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Apobec3Q99J72 AC157602.1-201ENSMUST00000197446 105 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Apobec3Q99J72 Gm22950-201ENSMUST00000082776 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Apobec3Q99J72 Snora75-201ENSMUST00000082903 133 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Apobec3Q99J72 Gm22354-201ENSMUST00000083919 70 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Apobec3Q99J72 Olfr867-203ENSMUST00000216538 4617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
Apobec3Q99J72 Gm382-201ENSMUST00000096332 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
Apobec3Q99J72 Gm25040-201ENSMUST00000103877 66 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Apobec3Q99J72 Gm25683-201ENSMUST00000083940 131 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Apobec3Q99J72 Gm13723-201ENSMUST00000130722 5036 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
Apobec3Q99J72 Gm22340-201ENSMUST00000157717 114 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 208.5 ms