Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Gm25296-201ENSMUST00000082566 67 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
Ttf1Q62187 Gm22455-201ENSMUST00000082580 71 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
Ttf1Q62187 Gm23461-201ENSMUST00000083265 107 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
Ttf1Q62187 Gm22451-201ENSMUST00000122803 151 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Ttf1Q62187 Gm22337-201ENSMUST00000157721 132 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Ttf1Q62187 Gm24131-201ENSMUST00000158539 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Ttf1Q62187 Gm23209-201ENSMUST00000158667 110 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Ttf1Q62187 Gm22699-201ENSMUST00000175376 105 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Ttf1Q62187 AC168880.2-201ENSMUST00000224488 201 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Ttf1Q62187 Gm26207-201ENSMUST00000082909 104 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Ttf1Q62187 Gm24649-201ENSMUST00000157106 134 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Ttf1Q62187 Gm22203-201ENSMUST00000158605 58 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Ttf1Q62187 Mir466b-1-201ENSMUST00000177988 82 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Ttf1Q62187 Mir378c-201ENSMUST00000184478 99 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Ttf1Q62187 Gm27735-201ENSMUST00000185085 76 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Ttf1Q62187 mt-Ts2-201ENSMUST00000082416 59 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Ttf1Q62187 Gm25635-201ENSMUST00000082675 131 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Ttf1Q62187 Gm26062-201ENSMUST00000083379 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Ttf1Q62187 Gm26168-201ENSMUST00000083787 112 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Ttf1Q62187 Gm24468-201ENSMUST00000104489 104 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Ttf1Q62187 Gm23197-201ENSMUST00000158809 112 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Ttf1Q62187 Snora26-201ENSMUST00000175614 121 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Ttf1Q62187 Mir669j-201ENSMUST00000179023 121 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Ttf1Q62187 AC129019.2-201ENSMUST00000222063 202 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Ttf1Q62187 AC126939.1-201ENSMUST00000224943 226 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Ttf1Q62187 Gm25091-201ENSMUST00000103997 71 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Ttf1Q62187 Gm24913-201ENSMUST00000157286 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Ttf1Q62187 Mir1966-201ENSMUST00000158807 108 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Ttf1Q62187 Gm26359-201ENSMUST00000158873 101 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Ttf1Q62187 Gm27884-201ENSMUST00000183865 76 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Ttf1Q62187 Gm24983-201ENSMUST00000104457 69 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Ttf1Q62187 Gm24894-201ENSMUST00000122744 118 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Ttf1Q62187 Gm25618-201ENSMUST00000179484 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Ttf1Q62187 Gm25186-201ENSMUST00000083909 108 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Ttf1Q62187 Gm24593-201ENSMUST00000122507 106 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
Ttf1Q62187 Gm25367-201ENSMUST00000158846 106 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
Ttf1Q62187 Gm27699-201ENSMUST00000183553 180 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
Ttf1Q62187 Gm25081-201ENSMUST00000082534 108 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
Ttf1Q62187 Mirlet7d-201ENSMUST00000083519 103 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
Ttf1Q62187 Gm25716-201ENSMUST00000158628 104 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
Ttf1Q62187 Gm25472-201ENSMUST00000175454 78 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
Ttf1Q62187 Mir96-201ENSMUST00000083652 106 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
Ttf1Q62187 Gm26156-201ENSMUST00000116999 123 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
Ttf1Q62187 Gm22336-201ENSMUST00000157719 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
Ttf1Q62187 Mir669m-1-201ENSMUST00000158945 98 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
Ttf1Q62187 Gm45688-201ENSMUST00000210002 101 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
Ttf1Q62187 Gm39149-201ENSMUST00000210258 186 ntTSL 5 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
Ttf1Q62187 Gm23344-201ENSMUST00000083818 68 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
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Ttf1Q62187 Gm23601-201ENSMUST00000157259 131 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
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Ttf1Q62187 Snora62-201ENSMUST00000082991 149 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
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Ttf1Q62187 Snord42b-201ENSMUST00000083742 69 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
Ttf1Q62187 Mir669l-201ENSMUST00000103771 98 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
Ttf1Q62187 Gm22258-201ENSMUST00000177645 94 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
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Ttf1Q62187 Gm25471-201ENSMUST00000180126 94 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
Ttf1Q62187 Mir6904-201ENSMUST00000183443 67 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
Ttf1Q62187 AC157602.1-201ENSMUST00000197446 105 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
Ttf1Q62187 Gm45741-201ENSMUST00000212661 152 ntTSL 1 (best) BASIC-0.94□□□□□ -2.56
Ttf1Q62187 AC151902.2-201ENSMUST00000226419 301 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
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