Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Gm25296-201ENSMUST00000082566 67 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
Ttf1Q62187 Gm22455-201ENSMUST00000082580 71 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
Ttf1Q62187 Gm23461-201ENSMUST00000083265 107 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
Ttf1Q62187 Gm22451-201ENSMUST00000122803 151 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Ttf1Q62187 Gm22337-201ENSMUST00000157721 132 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Ttf1Q62187 Gm24131-201ENSMUST00000158539 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Ttf1Q62187 Gm23209-201ENSMUST00000158667 110 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Ttf1Q62187 Gm22699-201ENSMUST00000175376 105 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Ttf1Q62187 AC168880.2-201ENSMUST00000224488 201 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Ttf1Q62187 Gm26207-201ENSMUST00000082909 104 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Ttf1Q62187 Gm24649-201ENSMUST00000157106 134 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Ttf1Q62187 Gm22203-201ENSMUST00000158605 58 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Ttf1Q62187 Mir466b-1-201ENSMUST00000177988 82 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Ttf1Q62187 Mir378c-201ENSMUST00000184478 99 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Ttf1Q62187 Gm27735-201ENSMUST00000185085 76 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Ttf1Q62187 mt-Ts2-201ENSMUST00000082416 59 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Ttf1Q62187 Gm25635-201ENSMUST00000082675 131 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Ttf1Q62187 Gm26062-201ENSMUST00000083379 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Ttf1Q62187 Gm26168-201ENSMUST00000083787 112 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Ttf1Q62187 Gm24468-201ENSMUST00000104489 104 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Ttf1Q62187 Gm23197-201ENSMUST00000158809 112 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Ttf1Q62187 Snora26-201ENSMUST00000175614 121 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Ttf1Q62187 Mir669j-201ENSMUST00000179023 121 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Ttf1Q62187 AC129019.2-201ENSMUST00000222063 202 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Ttf1Q62187 AC126939.1-201ENSMUST00000224943 226 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Ttf1Q62187 Gm25091-201ENSMUST00000103997 71 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Ttf1Q62187 Gm24913-201ENSMUST00000157286 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Ttf1Q62187 Mir1966-201ENSMUST00000158807 108 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Ttf1Q62187 Gm26359-201ENSMUST00000158873 101 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Ttf1Q62187 Gm27884-201ENSMUST00000183865 76 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Ttf1Q62187 Gm24983-201ENSMUST00000104457 69 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Ttf1Q62187 Gm24894-201ENSMUST00000122744 118 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Ttf1Q62187 Gm25618-201ENSMUST00000179484 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Ttf1Q62187 Gm25186-201ENSMUST00000083909 108 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Ttf1Q62187 Gm24593-201ENSMUST00000122507 106 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
Ttf1Q62187 Gm25367-201ENSMUST00000158846 106 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
Ttf1Q62187 Gm27699-201ENSMUST00000183553 180 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
Ttf1Q62187 Gm25081-201ENSMUST00000082534 108 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
Ttf1Q62187 Mirlet7d-201ENSMUST00000083519 103 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
Ttf1Q62187 Gm25716-201ENSMUST00000158628 104 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
Ttf1Q62187 Gm25472-201ENSMUST00000175454 78 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
Ttf1Q62187 Mir96-201ENSMUST00000083652 106 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
Ttf1Q62187 Gm26156-201ENSMUST00000116999 123 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
Ttf1Q62187 Gm22336-201ENSMUST00000157719 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
Ttf1Q62187 Mir669m-1-201ENSMUST00000158945 98 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
Ttf1Q62187 Gm45688-201ENSMUST00000210002 101 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
Ttf1Q62187 Gm39149-201ENSMUST00000210258 186 ntTSL 5 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
Ttf1Q62187 Gm23344-201ENSMUST00000083818 68 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
Ttf1Q62187 Gm25510-201ENSMUST00000116986 123 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
Ttf1Q62187 Gm14533-201ENSMUST00000117088 93 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
Ttf1Q62187 Gm23601-201ENSMUST00000157259 131 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
Ttf1Q62187 Gm26084-201ENSMUST00000157903 104 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
Ttf1Q62187 Gm22212-201ENSMUST00000158096 106 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
Ttf1Q62187 Gm23065-201ENSMUST00000158236 130 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
Ttf1Q62187 Gm8034-201ENSMUST00000178853 132 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
Ttf1Q62187 Gm27332-201ENSMUST00000184893 112 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
Ttf1Q62187 Mir669h-201ENSMUST00000116944 125 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
Ttf1Q62187 Gm23986-201ENSMUST00000157144 63 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
Ttf1Q62187 Mir6375-201ENSMUST00000197176 95 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
Ttf1Q62187 Mir29a-201ENSMUST00000083676 88 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
Ttf1Q62187 Gm22406-201ENSMUST00000174923 93 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
Ttf1Q62187 Mir3101-201ENSMUST00000175607 88 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
Ttf1Q62187 Mir509-201ENSMUST00000196089 75 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
Ttf1Q62187 Gm18502-201ENSMUST00000218679 199 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
Ttf1Q62187 Gm25275-201ENSMUST00000104297 129 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
Ttf1Q62187 Gm22772-201ENSMUST00000104451 121 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
Ttf1Q62187 Gm24202-201ENSMUST00000082948 103 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
Ttf1Q62187 Gm23239-201ENSMUST00000083006 181 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
Ttf1Q62187 Gm23970-201ENSMUST00000083319 107 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
Ttf1Q62187 Snord80-201ENSMUST00000083801 81 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
Ttf1Q62187 n-R5s8-201ENSMUST00000104121 118 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
Ttf1Q62187 Gm25599-201ENSMUST00000157816 103 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
Ttf1Q62187 Gm22503-201ENSMUST00000158983 115 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
Ttf1Q62187 Gm22708-201ENSMUST00000158987 103 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
Ttf1Q62187 Gm22827-201ENSMUST00000083766 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
Ttf1Q62187 Mir669o-201ENSMUST00000103898 96 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
Ttf1Q62187 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
Ttf1Q62187 Gm26478-201ENSMUST00000122611 133 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
Ttf1Q62187 Gm44909-201ENSMUST00000208756 165 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
Ttf1Q62187 Snora62-201ENSMUST00000082991 149 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
Ttf1Q62187 Gm25137-201ENSMUST00000083251 110 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
Ttf1Q62187 Mir18b-201ENSMUST00000103923 83 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
Ttf1Q62187 Gm23990-201ENSMUST00000117031 117 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
Ttf1Q62187 Mir669b-201ENSMUST00000102172 97 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
Ttf1Q62187 Gm22157-201ENSMUST00000158410 104 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
Ttf1Q62187 Gm37796-201ENSMUST00000195327 134 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
Ttf1Q62187 Snord42b-201ENSMUST00000083742 69 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
Ttf1Q62187 Mir669l-201ENSMUST00000103771 98 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
Ttf1Q62187 Gm22258-201ENSMUST00000177645 94 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
Ttf1Q62187 Gm26032-201ENSMUST00000178535 94 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
Ttf1Q62187 Gm25210-201ENSMUST00000178813 94 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
Ttf1Q62187 Gm25157-201ENSMUST00000178914 94 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
Ttf1Q62187 Gm22046-201ENSMUST00000179027 94 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
Ttf1Q62187 Gm22941-201ENSMUST00000179630 94 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
Ttf1Q62187 Gm22638-201ENSMUST00000179674 107 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
Ttf1Q62187 Gm25471-201ENSMUST00000180126 94 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
Ttf1Q62187 Mir6904-201ENSMUST00000183443 67 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
Ttf1Q62187 AC157602.1-201ENSMUST00000197446 105 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
Ttf1Q62187 Gm45741-201ENSMUST00000212661 152 ntTSL 1 (best) BASIC-0.94□□□□□ -2.56
Ttf1Q62187 AC151902.2-201ENSMUST00000226419 301 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 220.5 ms