Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm16265-201ENSMUST00000134558 108 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Trim71Q1PSW8 Gm23857-201ENSMUST00000158379 111 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Trim71Q1PSW8 Gm26398-201ENSMUST00000179015 127 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Trim71Q1PSW8 Gm38113-201ENSMUST00000193704 201 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Trim71Q1PSW8 AC166341.8-201ENSMUST00000221267 108 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Trim71Q1PSW8 Gm22827-201ENSMUST00000083766 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Trim71Q1PSW8 Gm23126-201ENSMUST00000104260 134 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Trim71Q1PSW8 Gm26158-201ENSMUST00000158973 119 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Trim71Q1PSW8 Gm23244-201ENSMUST00000083375 92 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Trim71Q1PSW8 Gm24468-201ENSMUST00000104489 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Trim71Q1PSW8 Gm12013-201ENSMUST00000121971 155 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Trim71Q1PSW8 n-R5s39-201ENSMUST00000122613 108 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Trim71Q1PSW8 Gm22983-201ENSMUST00000158308 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Trim71Q1PSW8 Gm24947-201ENSMUST00000158334 110 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Trim71Q1PSW8 Gm23351-201ENSMUST00000158427 125 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Trim71Q1PSW8 Gm22431-201ENSMUST00000158545 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Trim71Q1PSW8 Gm22943-201ENSMUST00000158564 76 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Trim71Q1PSW8 Gm20386-201ENSMUST00000174010 132 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Trim71Q1PSW8 Gm22638-201ENSMUST00000179674 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Trim71Q1PSW8 Gm44469-201ENSMUST00000198558 79 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Trim71Q1PSW8 AC211878.4-201ENSMUST00000220970 262 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Trim71Q1PSW8 Gm23790-201ENSMUST00000083013 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Trim71Q1PSW8 Gm22354-201ENSMUST00000083919 70 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Trim71Q1PSW8 Gm23989-201ENSMUST00000117030 66 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Trim71Q1PSW8 Gm22319-201ENSMUST00000157147 122 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Trim71Q1PSW8 Gm23605-201ENSMUST00000157255 127 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Trim71Q1PSW8 Gm24290-201ENSMUST00000157634 96 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Trim71Q1PSW8 Mir3070a-201ENSMUST00000175468 89 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Trim71Q1PSW8 Gm26498-201ENSMUST00000177799 79 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Trim71Q1PSW8 Gm26230-201ENSMUST00000180141 79 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Trim71Q1PSW8 Gm37330-201ENSMUST00000192606 153 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Trim71Q1PSW8 Defb38-201ENSMUST00000066416 286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.66□□□□□ -2.3
Trim71Q1PSW8 Gm24258-201ENSMUST00000083739 133 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Trim71Q1PSW8 Gm25787-201ENSMUST00000104709 92 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Trim71Q1PSW8 Gm22033-201ENSMUST00000116947 90 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Trim71Q1PSW8 Gm26425-201ENSMUST00000122529 82 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Trim71Q1PSW8 Gm22729-201ENSMUST00000158088 129 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Trim71Q1PSW8 Gm22089-201ENSMUST00000158336 102 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Trim71Q1PSW8 Gm10548-202ENSMUST00000165672 272 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Trim71Q1PSW8 BC050972-201ENSMUST00000168475 526 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
Trim71Q1PSW8 Mir21c-201ENSMUST00000184910 78 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Trim71Q1PSW8 AC122327.1-201ENSMUST00000220778 108 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Trim71Q1PSW8 Gm22454-201ENSMUST00000082583 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Trim71Q1PSW8 Mir802-201ENSMUST00000103258 97 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Trim71Q1PSW8 Gm23783-201ENSMUST00000157941 102 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Trim71Q1PSW8 Gm23384-201ENSMUST00000158593 103 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Trim71Q1PSW8 Gm22503-201ENSMUST00000158983 115 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Trim71Q1PSW8 Gm23917-201ENSMUST00000175256 98 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Trim71Q1PSW8 Gm27289-201ENSMUST00000183341 82 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Trim71Q1PSW8 Mir6342-201ENSMUST00000183870 125 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Trim71Q1PSW8 Gm43977-201ENSMUST00000203970 189 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Trim71Q1PSW8 AC124196.2-201ENSMUST00000224835 145 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Trim71Q1PSW8 Mir369-201ENSMUST00000083627 79 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Trim71Q1PSW8 Gm23468-201ENSMUST00000157125 108 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Trim71Q1PSW8 Gm23261-201ENSMUST00000158316 136 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Trim71Q1PSW8 Mir6237-201ENSMUST00000183808 91 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Trim71Q1PSW8 AC113441.1-201ENSMUST00000223464 134 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Trim71Q1PSW8 Gm25635-201ENSMUST00000082675 131 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Trim71Q1PSW8 Olfr1099-202ENSMUST00000213456 4867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
Trim71Q1PSW8 Gm26051-201ENSMUST00000104642 93 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Trim71Q1PSW8 Gm23654-201ENSMUST00000116758 126 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Trim71Q1PSW8 Gm25753-201ENSMUST00000116792 121 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Trim71Q1PSW8 Gm6985-201ENSMUST00000121255 271 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Trim71Q1PSW8 Gm24649-201ENSMUST00000157106 134 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Trim71Q1PSW8 Gm23986-201ENSMUST00000157144 63 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Trim71Q1PSW8 Gm23715-201ENSMUST00000157354 106 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Trim71Q1PSW8 Gm25056-201ENSMUST00000157372 62 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Trim71Q1PSW8 Snord50a-201ENSMUST00000178154 72 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Trim71Q1PSW8 Gm24463-201ENSMUST00000178417 72 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Trim71Q1PSW8 Gm43206-201ENSMUST00000197990 114 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Trim71Q1PSW8 Gm45429-201ENSMUST00000209527 172 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Trim71Q1PSW8 AC124687.1-201ENSMUST00000221868 189 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Trim71Q1PSW8 Gm24099-201ENSMUST00000083384 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Trim71Q1PSW8 Gm22672-201ENSMUST00000104414 134 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Trim71Q1PSW8 Gm23528-201ENSMUST00000104571 132 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Trim71Q1PSW8 Rab11fip4os2-202ENSMUST00000132921 355 ntTSL 1 (best) BASIC0.61□□□□□ -2.31
Trim71Q1PSW8 Mir7010-201ENSMUST00000183464 63 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Trim71Q1PSW8 Snord80-201ENSMUST00000083801 81 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Trim71Q1PSW8 Gm23038-201ENSMUST00000083873 104 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Trim71Q1PSW8 Gm14884-201ENSMUST00000120456 196 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Trim71Q1PSW8 Gm25289-201ENSMUST00000122799 119 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Trim71Q1PSW8 Gm25887-201ENSMUST00000157777 84 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Trim71Q1PSW8 Gm25600-201ENSMUST00000158357 106 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Trim71Q1PSW8 Gm26285-201ENSMUST00000177923 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Trim71Q1PSW8 Ranbp2-ps1-201ENSMUST00000184001 403 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Trim71Q1PSW8 Gm44602-201ENSMUST00000205948 132 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Trim71Q1PSW8 CT571266.1-201ENSMUST00000222859 153 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Trim71Q1PSW8 Gm23622-201ENSMUST00000082460 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Trim71Q1PSW8 Gm24524-201ENSMUST00000082925 170 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Trim71Q1PSW8 Gm26369-201ENSMUST00000157825 100 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Trim71Q1PSW8 Gm24637-201ENSMUST00000158674 85 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Trim71Q1PSW8 Gm25300-201ENSMUST00000175284 84 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Trim71Q1PSW8 Gm26236-201ENSMUST00000175536 137 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Trim71Q1PSW8 Mir7-1-201ENSMUST00000083500 108 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Trim71Q1PSW8 Gm25022-201ENSMUST00000102205 83 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Trim71Q1PSW8 Gm22030-201ENSMUST00000116942 63 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Trim71Q1PSW8 Gm25382-201ENSMUST00000157811 97 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Trim71Q1PSW8 Gm22522-201ENSMUST00000158271 151 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Trim71Q1PSW8 Mir3083-201ENSMUST00000175377 64 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Trim71Q1PSW8 Mir467a-6-201ENSMUST00000177790 83 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
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