Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

Predictions only

Length 1,324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Gm24554-201ENSMUST00000158654 73 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
Ccdc171E9Q1U1 Gm43943-201ENSMUST00000204201 113 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
Ccdc171E9Q1U1 CT010505.1-201ENSMUST00000227026 396 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
Ccdc171E9Q1U1 Gm26168-201ENSMUST00000083787 112 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
Ccdc171E9Q1U1 Gm44489-201ENSMUST00000104619 97 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
Ccdc171E9Q1U1 AC122320.1-201ENSMUST00000227233 105 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
Ccdc171E9Q1U1 Traj30-201ENSMUST00000103711 59 ntAPPRIS P1 BASIC-1.53□□□□□ -2.65
Ccdc171E9Q1U1 Gm26478-201ENSMUST00000122611 133 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
Ccdc171E9Q1U1 Gm11250-201ENSMUST00000142137 306 ntTSL 5 BASIC-1.53□□□□□ -2.65
Ccdc171E9Q1U1 Snord57-201ENSMUST00000083338 72 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
Ccdc171E9Q1U1 Gm23345-201ENSMUST00000083817 150 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
Ccdc171E9Q1U1 Mir543-201ENSMUST00000102286 76 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
Ccdc171E9Q1U1 Mir669h-201ENSMUST00000116944 125 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
Ccdc171E9Q1U1 Gm23901-201ENSMUST00000157570 107 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
Ccdc171E9Q1U1 Gm22016-201ENSMUST00000158793 114 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
Ccdc171E9Q1U1 Gm44909-201ENSMUST00000208756 165 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
Ccdc171E9Q1U1 Mir369-201ENSMUST00000083627 79 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
Ccdc171E9Q1U1 Gm22491-201ENSMUST00000157190 102 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
Ccdc171E9Q1U1 Gm24877-201ENSMUST00000158779 116 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
Ccdc171E9Q1U1 Traj61-201ENSMUST00000165025 72 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
Ccdc171E9Q1U1 Gm17919-201ENSMUST00000173344 312 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
Ccdc171E9Q1U1 Gm23047-201ENSMUST00000177661 94 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
Ccdc171E9Q1U1 Mir21c-201ENSMUST00000184910 78 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
Ccdc171E9Q1U1 Gm27784-201ENSMUST00000184926 113 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
Ccdc171E9Q1U1 Mir7015-201ENSMUST00000199525 64 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
Ccdc171E9Q1U1 Gm22305-201ENSMUST00000082690 108 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
Ccdc171E9Q1U1 Gm24461-201ENSMUST00000082735 103 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
Ccdc171E9Q1U1 Gm25512-201ENSMUST00000083863 107 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
Ccdc171E9Q1U1 Gm24232-201ENSMUST00000104314 132 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
Ccdc171E9Q1U1 Gm22148-201ENSMUST00000104445 107 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
Ccdc171E9Q1U1 Gm23987-201ENSMUST00000117039 129 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
Ccdc171E9Q1U1 Gm23601-201ENSMUST00000157259 131 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
Ccdc171E9Q1U1 Gm22476-201ENSMUST00000158902 100 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
Ccdc171E9Q1U1 Gm24459-201ENSMUST00000082730 86 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
Ccdc171E9Q1U1 Gm24374-201ENSMUST00000104394 106 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
Ccdc171E9Q1U1 Gm23579-201ENSMUST00000158528 103 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
Ccdc171E9Q1U1 mt-Ts1-201ENSMUST00000082403 69 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
Ccdc171E9Q1U1 Mir181a-2-201ENSMUST00000083489 76 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
Ccdc171E9Q1U1 Gm24983-201ENSMUST00000104457 69 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
Ccdc171E9Q1U1 Gm24649-201ENSMUST00000157106 134 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
Ccdc171E9Q1U1 Gm25362-201ENSMUST00000158854 105 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
Ccdc171E9Q1U1 Mir136-201ENSMUST00000199494 62 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
Ccdc171E9Q1U1 mt-Ti-201ENSMUST00000082393 69 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
Ccdc171E9Q1U1 Snord16a-201ENSMUST00000083895 99 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
Ccdc171E9Q1U1 Gm37832-201ENSMUST00000118935 189 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
Ccdc171E9Q1U1 Gm24686-201ENSMUST00000157755 93 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
Ccdc171E9Q1U1 Gm24197-201ENSMUST00000175085 109 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
Ccdc171E9Q1U1 Gm44589-201ENSMUST00000207025 115 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
Ccdc171E9Q1U1 Gm29107-201ENSMUST00000190910 347 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
Ccdc171E9Q1U1 Gm43038-201ENSMUST00000202359 88 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
Ccdc171E9Q1U1 AC122335.1-201ENSMUST00000217587 175 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
Ccdc171E9Q1U1 Cyp2j7-ps1-201ENSMUST00000122430 173 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
Ccdc171E9Q1U1 Mir3970-201ENSMUST00000199287 90 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
Ccdc171E9Q1U1 Gm24091-201ENSMUST00000082550 83 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
Ccdc171E9Q1U1 Gm23711-201ENSMUST00000083856 83 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
Ccdc171E9Q1U1 Gm23974-201ENSMUST00000083321 131 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
Ccdc171E9Q1U1 Gm25652-201ENSMUST00000083780 103 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
Ccdc171E9Q1U1 Mir488-201ENSMUST00000093595 109 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
Ccdc171E9Q1U1 Snord123-201ENSMUST00000158692 71 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
Ccdc171E9Q1U1 Mir7086-201ENSMUST00000183683 65 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
Ccdc171E9Q1U1 Mir23a-201ENSMUST00000083677 75 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
Ccdc171E9Q1U1 Gm12013-201ENSMUST00000121971 155 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
Ccdc171E9Q1U1 Gm22335-201ENSMUST00000157724 99 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
Ccdc171E9Q1U1 Gm22434-201ENSMUST00000158549 122 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
Ccdc171E9Q1U1 Gm27803-201ENSMUST00000183763 119 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
Ccdc171E9Q1U1 Gm24913-201ENSMUST00000157286 107 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
Ccdc171E9Q1U1 Mir1966-201ENSMUST00000158807 108 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
Ccdc171E9Q1U1 Gm24701-201ENSMUST00000101946 105 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
Ccdc171E9Q1U1 Gm24399-201ENSMUST00000157869 74 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
Ccdc171E9Q1U1 Gm44373-201ENSMUST00000196112 169 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
Ccdc171E9Q1U1 AL606472.1-201ENSMUST00000224628 275 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
Ccdc171E9Q1U1 Gm26104-201ENSMUST00000157250 108 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
Ccdc171E9Q1U1 Gm25429-201ENSMUST00000157607 132 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
Ccdc171E9Q1U1 Gm25014-201ENSMUST00000158401 103 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
Ccdc171E9Q1U1 Gm22836-201ENSMUST00000158441 61 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
Ccdc171E9Q1U1 Gm25870-201ENSMUST00000179845 79 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
Ccdc171E9Q1U1 Traj49-202ENSMUST00000199452 62 ntAPPRIS P1 BASIC-1.66□□□□□ -2.68
Ccdc171E9Q1U1 Mir1298-201ENSMUST00000116681 98 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
Ccdc171E9Q1U1 Gm23494-201ENSMUST00000116830 126 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
Ccdc171E9Q1U1 Gm22406-201ENSMUST00000174923 93 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
Ccdc171E9Q1U1 Mir1839-201ENSMUST00000175366 127 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
Ccdc171E9Q1U1 Gm26262-201ENSMUST00000158024 127 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
Ccdc171E9Q1U1 Gm25601-201ENSMUST00000158356 105 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
Ccdc171E9Q1U1 Gm24051-201ENSMUST00000158622 75 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
Ccdc171E9Q1U1 Gm23303-201ENSMUST00000082714 152 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
Ccdc171E9Q1U1 Gm24918-201ENSMUST00000083022 130 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
Ccdc171E9Q1U1 Gm25410-201ENSMUST00000083758 137 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
Ccdc171E9Q1U1 Gm23545-201ENSMUST00000158205 104 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
Ccdc171E9Q1U1 Gm25654-201ENSMUST00000158467 88 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
Ccdc171E9Q1U1 Gm22430-201ENSMUST00000158546 107 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
Ccdc171E9Q1U1 Gm25626-201ENSMUST00000177631 107 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
Ccdc171E9Q1U1 Gm42677-201ENSMUST00000196363 127 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
Ccdc171E9Q1U1 Mir1a-2-201ENSMUST00000198520 72 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
Ccdc171E9Q1U1 AC154390.1-201ENSMUST00000225629 277 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
Ccdc171E9Q1U1 Gm24203-201ENSMUST00000082949 114 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
Ccdc171E9Q1U1 Gm23316-201ENSMUST00000157997 114 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.69
Ccdc171E9Q1U1 Gm22212-201ENSMUST00000158096 106 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.69
Ccdc171E9Q1U1 Mir466m-201ENSMUST00000175052 84 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.69
Ccdc171E9Q1U1 Olfr1483-ps1-201ENSMUST00000208241 334 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.69
Ccdc171E9Q1U1 Mir451b-201ENSMUST00000196157 72 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 262.1 ms