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Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80
Snx1, Sorting nexin-1, mouse
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522 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (Experimental data)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
Snx1
Q9WV80
Gm22431-201
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BASIC
-0.13
□□□□□ -2.43
Snx1
Q9WV80
Gm24208-201
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135 nt
BASIC
-0.13
□□□□□ -2.43
Snx1
Q9WV80
Gm24449-201
ENSMUST00000083985
106 nt
BASIC
-0.13
□□□□□ -2.43
Snx1
Q9WV80
Gm26018-201
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128 nt
BASIC
-0.14
□□□□□ -2.43
Snx1
Q9WV80
Mir467g-201
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120 nt
BASIC
-0.14
□□□□□ -2.43
Snx1
Q9WV80
Mir1197-201
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120 nt
BASIC
-0.14
□□□□□ -2.43
Snx1
Q9WV80
Gm24399-201
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74 nt
BASIC
-0.14
□□□□□ -2.43
Snx1
Q9WV80
Gm26007-201
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120 nt
BASIC
-0.14
□□□□□ -2.43
Snx1
Q9WV80
Gm23159-201
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BASIC
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□□□□□ -2.43
Snx1
Q9WV80
Gm26712-201
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BASIC
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□□□□□ -2.43
Snx1
Q9WV80
Gm45374-201
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136 nt
BASIC
-0.14
□□□□□ -2.43
Snx1
Q9WV80
AC168880.2-201
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BASIC
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□□□□□ -2.43
Snx1
Q9WV80
n-R5s42-201
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BASIC
-0.14
□□□□□ -2.43
Snx1
Q9WV80
Mir410-201
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BASIC
-0.14
□□□□□ -2.43
Snx1
Q9WV80
n-R5s12-201
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BASIC
-0.14
□□□□□ -2.43
Snx1
Q9WV80
Gm24686-201
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93 nt
BASIC
-0.15
□□□□□ -2.43
Snx1
Q9WV80
Gm22966-201
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129 nt
BASIC
-0.15
□□□□□ -2.43
Snx1
Q9WV80
Mir6896-201
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73 nt
BASIC
-0.15
□□□□□ -2.43
Snx1
Q9WV80
Gm23126-201
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134 nt
BASIC
-0.16
□□□□□ -2.44
Snx1
Q9WV80
Gm22772-201
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BASIC
-0.16
□□□□□ -2.44
Snx1
Q9WV80
Gm23788-201
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106 nt
BASIC
-0.16
□□□□□ -2.44
Snx1
Q9WV80
Gm11749-201
ENSMUST00000127327
184 nt
TSL 2
BASIC
-0.16
□□□□□ -2.44
Snx1
Q9WV80
Gm24649-201
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134 nt
BASIC
-0.16
□□□□□ -2.44
Snx1
Q9WV80
Mir669j-201
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121 nt
BASIC
-0.16
□□□□□ -2.44
Snx1
Q9WV80
Mir327-201
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69 nt
BASIC
-0.16
□□□□□ -2.44
Snx1
Q9WV80
Traj49-202
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62 nt
APPRIS P1
BASIC
-0.16
□□□□□ -2.44
Snx1
Q9WV80
Gm24288-201
ENSMUST00000157630
144 nt
BASIC
-0.17
□□□□□ -2.44
Snx1
Q9WV80
Gm24842-201
ENSMUST00000158681
54 nt
BASIC
-0.17
□□□□□ -2.44
Snx1
Q9WV80
Gm25366-201
ENSMUST00000158845
124 nt
BASIC
-0.17
□□□□□ -2.44
Snx1
Q9WV80
Gm22813-201
ENSMUST00000199948
123 nt
BASIC
-0.17
□□□□□ -2.44
Snx1
Q9WV80
Gm43907-201
ENSMUST00000203128
117 nt
BASIC
-0.17
□□□□□ -2.44
Snx1
Q9WV80
Gm25416-201
ENSMUST00000104221
107 nt
BASIC
-0.18
□□□□□ -2.44
Snx1
Q9WV80
Gm25160-201
ENSMUST00000158914
102 nt
BASIC
-0.18
□□□□□ -2.44
Snx1
Q9WV80
Ighv15-1-201
ENSMUST00000194450
276 nt
BASIC
-0.18
□□□□□ -2.44
Snx1
Q9WV80
Gm44328-201
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75 nt
BASIC
-0.18
□□□□□ -2.44
Snx1
Q9WV80
Gm22349-201
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107 nt
BASIC
-0.19
□□□□□ -2.44
Snx1
Q9WV80
Gm24884-201
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BASIC
-0.19
□□□□□ -2.44
Snx1
Q9WV80
Gm25328-201
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107 nt
BASIC
-0.19
□□□□□ -2.44
Snx1
Q9WV80
Gm37750-201
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BASIC
-0.19
□□□□□ -2.44
Snx1
Q9WV80
Gm22720-201
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87 nt
BASIC
-0.2
□□□□□ -2.44
Snx1
Q9WV80
Gm24141-201
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BASIC
-0.2
□□□□□ -2.44
Snx1
Q9WV80
Gm22451-201
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BASIC
-0.2
□□□□□ -2.44
Snx1
Q9WV80
Gm24717-201
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124 nt
BASIC
-0.2
□□□□□ -2.44
Snx1
Q9WV80
Snord2-201
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BASIC
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□□□□□ -2.44
Snx1
Q9WV80
Gm22638-201
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BASIC
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□□□□□ -2.44
Snx1
Q9WV80
Mir7116-201
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BASIC
-0.2
□□□□□ -2.44
Snx1
Q9WV80
Gm22509-201
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BASIC
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□□□□□ -2.44
Snx1
Q9WV80
Gm23239-201
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BASIC
-0.2
□□□□□ -2.44
Snx1
Q9WV80
Mir344-201
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BASIC
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Snx1
Q9WV80
Gm24796-201
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BASIC
-0.21
□□□□□ -2.44
Snx1
Q9WV80
Gm23986-201
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63 nt
BASIC
-0.21
□□□□□ -2.44
Snx1
Q9WV80
Gm22336-201
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107 nt
BASIC
-0.21
□□□□□ -2.44
Snx1
Q9WV80
Gm24648-201
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BASIC
-0.22
□□□□□ -2.44
Snx1
Q9WV80
Gm22775-201
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BASIC
-0.22
□□□□□ -2.44
Snx1
Q9WV80
Gm23569-201
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120 nt
BASIC
-0.22
□□□□□ -2.44
Snx1
Q9WV80
Gm45492-201
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288 nt
BASIC
-0.22
□□□□□ -2.44
Snx1
Q9WV80
Gm23060-201
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BASIC
-0.23
□□□□□ -2.45
Snx1
Q9WV80
Gm22196-201
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BASIC
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□□□□□ -2.45
Snx1
Q9WV80
Gm25623-201
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BASIC
-0.23
□□□□□ -2.45
Snx1
Q9WV80
Gm23900-201
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BASIC
-0.23
□□□□□ -2.45
Snx1
Q9WV80
Gm22089-201
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BASIC
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□□□□□ -2.45
Snx1
Q9WV80
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BASIC
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□□□□□ -2.45
Snx1
Q9WV80
Gm22203-201
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58 nt
BASIC
-0.23
□□□□□ -2.45
Snx1
Q9WV80
Gm22503-201
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BASIC
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□□□□□ -2.45
Snx1
Q9WV80
Gm29432-201
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BASIC
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□□□□□ -2.45
Snx1
Q9WV80
Gm43324-201
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289 nt
BASIC
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□□□□□ -2.45
Snx1
Q9WV80
mt-Atp8-201
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204 nt
APPRIS P1
BASIC
-0.23
□□□□□ -2.45
Snx1
Q9WV80
Gm23442-201
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BASIC
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Snx1
Q9WV80
Mir196a-2-201
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BASIC
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□□□□□ -2.45
Snx1
Q9WV80
Gm25943-201
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BASIC
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□□□□□ -2.45
Snx1
Q9WV80
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BASIC
-0.24
□□□□□ -2.45
Snx1
Q9WV80
Mir466b-5-201
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88 nt
BASIC
-0.24
□□□□□ -2.45
Snx1
Q9WV80
Gm25756-201
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BASIC
-0.24
□□□□□ -2.45
Snx1
Q9WV80
Gm24379-201
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BASIC
-0.24
□□□□□ -2.45
Snx1
Q9WV80
Gm25055-201
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BASIC
-0.24
□□□□□ -2.45
Snx1
Q9WV80
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BASIC
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□□□□□ -2.45
Snx1
Q9WV80
Mir466b-4-201
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90 nt
BASIC
-0.24
□□□□□ -2.45
Snx1
Q9WV80
Gm25285-201
ENSMUST00000178951
90 nt
BASIC
-0.24
□□□□□ -2.45
Snx1
Q9WV80
Mir466b-6-201
ENSMUST00000180061
90 nt
BASIC
-0.24
□□□□□ -2.45
Snx1
Q9WV80
Mir466c-2-201
ENSMUST00000180211
90 nt
BASIC
-0.24
□□□□□ -2.45
Snx1
Q9WV80
Mir3065-201
ENSMUST00000198674
87 nt
BASIC
-0.24
□□□□□ -2.45
Snx1
Q9WV80
AC164561.1-201
ENSMUST00000220414
115 nt
BASIC
-0.24
□□□□□ -2.45
Snx1
Q9WV80
Gm26438-201
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107 nt
BASIC
-0.24
□□□□□ -2.45
Snx1
Q9WV80
Snord80-201
ENSMUST00000083801
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BASIC
-0.24
□□□□□ -2.45
Snx1
Q9WV80
Gm22681-201
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106 nt
BASIC
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□□□□□ -2.45
Snx1
Q9WV80
Traj9-201
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BASIC
-0.25
□□□□□ -2.45
Snx1
Q9WV80
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BASIC
-0.25
□□□□□ -2.45
Snx1
Q9WV80
Gm25014-201
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103 nt
BASIC
-0.25
□□□□□ -2.45
Snx1
Q9WV80
Gm23291-201
ENSMUST00000175611
78 nt
BASIC
-0.25
□□□□□ -2.45
Snx1
Q9WV80
Gm25633-201
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107 nt
BASIC
-0.25
□□□□□ -2.45
Snx1
Q9WV80
Gm27851-201
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63 nt
BASIC
-0.25
□□□□□ -2.45
Snx1
Q9WV80
Gm27980-201
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BASIC
-0.25
□□□□□ -2.45
Snx1
Q9WV80
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BASIC
-0.25
□□□□□ -2.45
Snx1
Q9WV80
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115 nt
BASIC
-0.25
□□□□□ -2.45
Snx1
Q9WV80
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100 nt
BASIC
-0.26
□□□□□ -2.45
Snx1
Q9WV80
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104 nt
BASIC
-0.26
□□□□□ -2.45
Snx1
Q9WV80
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132 nt
BASIC
-0.27
□□□□□ -2.45
Snx1
Q9WV80
n-R5s171-201
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BASIC
-0.27
□□□□□ -2.45
Snx1
Q9WV80
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BASIC
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Snx1
Q9WV80
Gm26210-201
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91 nt
BASIC
-0.27
□□□□□ -2.45
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