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Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1
Stx6, Syntaxin-6, mouse
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255 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (Experimental data)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
Stx6
Q9JKK1
Mir21c-201
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78 nt
BASIC
-0.83
□□□□□ -2.54
Stx6
Q9JKK1
Gm22542-201
ENSMUST00000158166
95 nt
BASIC
-0.84
□□□□□ -2.54
Stx6
Q9JKK1
Mir21b-201
ENSMUST00000184317
108 nt
BASIC
-0.84
□□□□□ -2.54
Stx6
Q9JKK1
4921527H02Rik-201
ENSMUST00000196028
246 nt
BASIC
-0.84
□□□□□ -2.54
Stx6
Q9JKK1
Snord80-202
ENSMUST00000199023
77 nt
BASIC
-0.84
□□□□□ -2.54
Stx6
Q9JKK1
Gm23483-201
ENSMUST00000104179
108 nt
BASIC
-0.86
□□□□□ -2.55
Stx6
Q9JKK1
Gm24374-201
ENSMUST00000104394
106 nt
BASIC
-0.86
□□□□□ -2.55
Stx6
Q9JKK1
Ighv15-1-201
ENSMUST00000194450
276 nt
BASIC
-0.86
□□□□□ -2.55
Stx6
Q9JKK1
Gm17020-201
ENSMUST00000172274
274 nt
BASIC
-0.87
□□□□□ -2.55
Stx6
Q9JKK1
Mir183-201
ENSMUST00000083685
70 nt
BASIC
-0.87
□□□□□ -2.55
Stx6
Q9JKK1
Gm6020-201
ENSMUST00000092094
66 nt
APPRIS P1
BASIC
-0.87
□□□□□ -2.55
Stx6
Q9JKK1
Gm12013-201
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155 nt
BASIC
-0.88
□□□□□ -2.55
Stx6
Q9JKK1
Gm25249-201
ENSMUST00000175471
78 nt
BASIC
-0.88
□□□□□ -2.55
Stx6
Q9JKK1
Gm23445-201
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107 nt
BASIC
-0.88
□□□□□ -2.55
Stx6
Q9JKK1
Snord67-201
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111 nt
BASIC
-0.89
□□□□□ -2.55
Stx6
Q9JKK1
Gm26081-201
ENSMUST00000104068
132 nt
BASIC
-0.89
□□□□□ -2.55
Stx6
Q9JKK1
Gm25993-201
ENSMUST00000175391
80 nt
BASIC
-0.89
□□□□□ -2.55
Stx6
Q9JKK1
Gm27465-201
ENSMUST00000184290
91 nt
BASIC
-0.89
□□□□□ -2.55
Stx6
Q9JKK1
Gm11116-201
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54 nt
APPRIS P1
TSL 5
BASIC
-0.9
□□□□□ -2.55
Stx6
Q9JKK1
Gm24648-201
ENSMUST00000157111
132 nt
BASIC
-0.9
□□□□□ -2.55
Stx6
Q9JKK1
Gm26133-201
ENSMUST00000157363
100 nt
BASIC
-0.9
□□□□□ -2.55
Stx6
Q9JKK1
Gm25055-201
ENSMUST00000157369
76 nt
BASIC
-0.9
□□□□□ -2.55
Stx6
Q9JKK1
Gm25899-201
ENSMUST00000082672
141 nt
BASIC
-0.9
□□□□□ -2.55
Stx6
Q9JKK1
Gm23690-201
ENSMUST00000083036
94 nt
BASIC
-0.9
□□□□□ -2.55
Stx6
Q9JKK1
Gm25337-201
ENSMUST00000083723
104 nt
BASIC
-0.9
□□□□□ -2.55
Stx6
Q9JKK1
Gm21940-201
ENSMUST00000204940
2278 nt
BASIC
-0.91
□□□□□ -2.55
Stx6
Q9JKK1
Gm23900-201
ENSMUST00000157569
108 nt
BASIC
-0.91
□□□□□ -2.56
Stx6
Q9JKK1
Gm25772-201
ENSMUST00000158574
56 nt
BASIC
-0.91
□□□□□ -2.56
Stx6
Q9JKK1
Snord49b-201
ENSMUST00000082503
72 nt
BASIC
-0.91
□□□□□ -2.56
Stx6
Q9JKK1
Gm25388-201
ENSMUST00000157339
151 nt
BASIC
-0.92
□□□□□ -2.56
Stx6
Q9JKK1
Gm23291-201
ENSMUST00000175611
78 nt
BASIC
-0.92
□□□□□ -2.56
Stx6
Q9JKK1
AC154390.1-201
ENSMUST00000225629
277 nt
BASIC
-0.92
□□□□□ -2.56
Stx6
Q9JKK1
mt-Tl1-201
ENSMUST00000082391
75 nt
BASIC
-0.93
□□□□□ -2.56
Stx6
Q9JKK1
Snora16a-201
ENSMUST00000083163
136 nt
BASIC
-0.93
□□□□□ -2.56
Stx6
Q9JKK1
Gm25656-201
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66 nt
BASIC
-0.94
□□□□□ -2.56
Stx6
Q9JKK1
Gm45002-201
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120 nt
BASIC
-0.94
□□□□□ -2.56
Stx6
Q9JKK1
Gm26204-201
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107 nt
BASIC
-0.94
□□□□□ -2.56
Stx6
Q9JKK1
Gm22169-201
ENSMUST00000083229
107 nt
BASIC
-0.94
□□□□□ -2.56
Stx6
Q9JKK1
Gm24246-201
ENSMUST00000157315
132 nt
BASIC
-0.95
□□□□□ -2.56
Stx6
Q9JKK1
Gm23260-201
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172 nt
BASIC
-0.95
□□□□□ -2.56
Stx6
Q9JKK1
Gm25522-201
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105 nt
BASIC
-0.95
□□□□□ -2.56
Stx6
Q9JKK1
Gm37624-201
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219 nt
BASIC
-0.95
□□□□□ -2.56
Stx6
Q9JKK1
Mir802-201
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BASIC
-0.96
□□□□□ -2.56
Stx6
Q9JKK1
Gm25680-201
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126 nt
BASIC
-0.96
□□□□□ -2.56
Stx6
Q9JKK1
Gm22635-201
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126 nt
BASIC
-0.96
□□□□□ -2.56
Stx6
Q9JKK1
Gm26097-201
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93 nt
BASIC
-0.96
□□□□□ -2.56
Stx6
Q9JKK1
Gm24508-201
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BASIC
-0.96
□□□□□ -2.56
Stx6
Q9JKK1
Gm37545-201
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148 nt
BASIC
-0.96
□□□□□ -2.56
Stx6
Q9JKK1
Gm23056-201
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111 nt
BASIC
-0.96
□□□□□ -2.56
Stx6
Q9JKK1
Gm26207-201
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104 nt
BASIC
-0.96
□□□□□ -2.56
Stx6
Q9JKK1
Gm26011-201
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104 nt
BASIC
-0.97
□□□□□ -2.56
Stx6
Q9JKK1
Gm23715-201
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106 nt
BASIC
-0.97
□□□□□ -2.56
Stx6
Q9JKK1
Mir344h-1-201
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BASIC
-0.97
□□□□□ -2.56
Stx6
Q9JKK1
Mir344h-2-201
ENSMUST00000175612
60 nt
BASIC
-0.97
□□□□□ -2.56
Stx6
Q9JKK1
Gm27735-201
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76 nt
BASIC
-0.97
□□□□□ -2.56
Stx6
Q9JKK1
Traj49-202
ENSMUST00000199452
62 nt
APPRIS P1
BASIC
-0.97
□□□□□ -2.56
Stx6
Q9JKK1
Gm45688-201
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101 nt
BASIC
-0.97
□□□□□ -2.56
Stx6
Q9JKK1
mt-Tw-201
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BASIC
-0.97
□□□□□ -2.56
Stx6
Q9JKK1
Gm26438-201
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107 nt
BASIC
-0.97
□□□□□ -2.56
Stx6
Q9JKK1
Gm25482-201
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107 nt
BASIC
-0.97
□□□□□ -2.56
Stx6
Q9JKK1
Mir103-1-201
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BASIC
-0.97
□□□□□ -2.56
Stx6
Q9JKK1
Gm23901-201
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107 nt
BASIC
-0.98
□□□□□ -2.57
Stx6
Q9JKK1
Gm22139-201
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105 nt
BASIC
-0.98
□□□□□ -2.57
Stx6
Q9JKK1
Gm27884-201
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BASIC
-0.98
□□□□□ -2.57
Stx6
Q9JKK1
Gm25296-201
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BASIC
-0.98
□□□□□ -2.57
Stx6
Q9JKK1
Gm24686-201
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BASIC
-0.99
□□□□□ -2.57
Stx6
Q9JKK1
Gm24399-201
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BASIC
-0.99
□□□□□ -2.57
Stx6
Q9JKK1
Gm22606-201
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BASIC
-0.99
□□□□□ -2.57
Stx6
Q9JKK1
Mir148a-201
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BASIC
-0.99
□□□□□ -2.57
Stx6
Q9JKK1
Gm24468-201
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104 nt
BASIC
-1
□□□□□ -2.57
Stx6
Q9JKK1
Gm22720-201
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BASIC
-1
□□□□□ -2.57
Stx6
Q9JKK1
Gm23258-201
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106 nt
BASIC
-1
□□□□□ -2.57
Stx6
Q9JKK1
Gm25014-201
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103 nt
BASIC
-1
□□□□□ -2.57
Stx6
Q9JKK1
Gm26426-201
ENSMUST00000177866
123 nt
BASIC
-1
□□□□□ -2.57
Stx6
Q9JKK1
Gm26060-201
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123 nt
BASIC
-1
□□□□□ -2.57
Stx6
Q9JKK1
Gm26062-201
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107 nt
BASIC
-1
□□□□□ -2.57
Stx6
Q9JKK1
Mup-ps5-201
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BASIC
-1.01
□□□□□ -2.57
Stx6
Q9JKK1
Gm26369-201
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100 nt
BASIC
-1.01
□□□□□ -2.57
Stx6
Q9JKK1
Gm45741-201
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152 nt
TSL 1 (best)
BASIC
-1.01
□□□□□ -2.57
Stx6
Q9JKK1
AC158982.2-201
ENSMUST00000226283
184 nt
BASIC
-1.01
□□□□□ -2.57
Stx6
Q9JKK1
Gm24522-201
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108 nt
BASIC
-1.01
□□□□□ -2.57
Stx6
Q9JKK1
Gm24718-201
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136 nt
BASIC
-1.02
□□□□□ -2.57
Stx6
Q9JKK1
Gm37889-201
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251 nt
BASIC
-1.02
□□□□□ -2.57
Stx6
Q9JKK1
Gm44338-201
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110 nt
BASIC
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□□□□□ -2.57
Stx6
Q9JKK1
AC129019.2-201
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202 nt
BASIC
-1.02
□□□□□ -2.57
Stx6
Q9JKK1
Gm24455-201
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131 nt
BASIC
-1.02
□□□□□ -2.57
Stx6
Q9JKK1
Gm23197-201
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112 nt
BASIC
-1.03
□□□□□ -2.57
Stx6
Q9JKK1
Gm23378-201
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107 nt
BASIC
-1.03
□□□□□ -2.57
Stx6
Q9JKK1
Gm22373-201
ENSMUST00000104584
89 nt
BASIC
-1.04
□□□□□ -2.58
Stx6
Q9JKK1
Gm24054-201
ENSMUST00000158619
105 nt
BASIC
-1.04
□□□□□ -2.58
Stx6
Q9JKK1
Gm26359-201
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101 nt
BASIC
-1.04
□□□□□ -2.58
Stx6
Q9JKK1
Snora26-201
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BASIC
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□□□□□ -2.58
Stx6
Q9JKK1
Mir466e-201
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BASIC
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□□□□□ -2.58
Stx6
Q9JKK1
Mir466c-1-201
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BASIC
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□□□□□ -2.58
Stx6
Q9JKK1
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BASIC
-1.04
□□□□□ -2.58
Stx6
Q9JKK1
Gm22455-201
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71 nt
BASIC
-1.04
□□□□□ -2.58
Stx6
Q9JKK1
Mirlet7d-201
ENSMUST00000083519
103 nt
BASIC
-1.04
□□□□□ -2.58
Stx6
Q9JKK1
Gm25186-201
ENSMUST00000083909
108 nt
BASIC
-1.04
□□□□□ -2.58
Stx6
Q9JKK1
Snord90-201
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111 nt
BASIC
-1.05
□□□□□ -2.58
Stx6
Q9JKK1
Gm44409-201
ENSMUST00000198810
166 nt
BASIC
-1.05
□□□□□ -2.58
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