Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gm23761-201ENSMUST00000158347 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RpainQ9CWY9 Gm23267-201ENSMUST00000178490 132 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RpainQ9CWY9 Snord60-201ENSMUST00000082834 78 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RpainQ9CWY9 Gm24406-201ENSMUST00000083026 128 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RpainQ9CWY9 Gm25541-201ENSMUST00000116888 126 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RpainQ9CWY9 n-R5s63-201ENSMUST00000122756 103 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RpainQ9CWY9 Gm23106-201ENSMUST00000157554 101 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RpainQ9CWY9 Gm24401-201ENSMUST00000157868 91 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RpainQ9CWY9 Gm28383-201ENSMUST00000187563 139 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RpainQ9CWY9 AC157602.1-201ENSMUST00000197446 105 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RpainQ9CWY9 Gm12469-201ENSMUST00000117623 207 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RpainQ9CWY9 Gm24868-201ENSMUST00000157265 136 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RpainQ9CWY9 Snord13-201ENSMUST00000157627 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RpainQ9CWY9 Gm24077-201ENSMUST00000158183 136 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RpainQ9CWY9 Gm25831-201ENSMUST00000158924 163 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RpainQ9CWY9 Gm22862-201ENSMUST00000178593 121 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RpainQ9CWY9 Gm23714-201ENSMUST00000179259 105 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RpainQ9CWY9 Gm22809-201ENSMUST00000082743 156 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RpainQ9CWY9 Gm25650-201ENSMUST00000083784 162 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RpainQ9CWY9 Gm24988-201ENSMUST00000104460 121 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RpainQ9CWY9 Scarna3b-201ENSMUST00000157533 139 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RpainQ9CWY9 Gm24495-201ENSMUST00000178575 79 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RpainQ9CWY9 Gm22253-201ENSMUST00000179870 79 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RpainQ9CWY9 Gm26712-201ENSMUST00000180813 217 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RpainQ9CWY9 Gm28862-201ENSMUST00000188246 163 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RpainQ9CWY9 mt-Tl2-201ENSMUST00000082417 71 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RpainQ9CWY9 Gm25629-201ENSMUST00000084001 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RpainQ9CWY9 Zfp960-201ENSMUST00000127027 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
RpainQ9CWY9 Gm24588-201ENSMUST00000116696 83 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RpainQ9CWY9 Gm24895-201ENSMUST00000122742 74 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RpainQ9CWY9 Gm25901-201ENSMUST00000158494 130 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RpainQ9CWY9 Gm25950-201ENSMUST00000175331 100 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RpainQ9CWY9 Gm44483-201ENSMUST00000197203 97 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RpainQ9CWY9 Mir320-201ENSMUST00000083594 82 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RpainQ9CWY9 Gm22149-201ENSMUST00000104442 136 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RpainQ9CWY9 Gm23661-201ENSMUST00000122630 87 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RpainQ9CWY9 Gm24902-201ENSMUST00000158126 123 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RpainQ9CWY9 Gm24229-201ENSMUST00000158830 118 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RpainQ9CWY9 Mir7675-201ENSMUST00000184262 58 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RpainQ9CWY9 Gm38295-201ENSMUST00000191951 151 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RpainQ9CWY9 Gm43038-201ENSMUST00000202359 88 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RpainQ9CWY9 Snord14a-201ENSMUST00000082807 87 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RpainQ9CWY9 Gm23376-201ENSMUST00000082938 160 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RpainQ9CWY9 Gm23570-201ENSMUST00000083029 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RpainQ9CWY9 Mir29a-201ENSMUST00000083676 88 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RpainQ9CWY9 Gm25068-201ENSMUST00000103895 110 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RpainQ9CWY9 Gm24915-201ENSMUST00000157288 78 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RpainQ9CWY9 Gm23826-201ENSMUST00000157394 119 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RpainQ9CWY9 Gm25958-201ENSMUST00000175114 71 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RpainQ9CWY9 Gm22929-201ENSMUST00000175517 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RpainQ9CWY9 Gm23419-201ENSMUST00000175523 84 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RpainQ9CWY9 Mir509-201ENSMUST00000196089 75 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RpainQ9CWY9 AL928567.1-201ENSMUST00000197891 138 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RpainQ9CWY9 Zfp981-203ENSMUST00000179175 2953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
RpainQ9CWY9 Mir653-201ENSMUST00000102402 85 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RpainQ9CWY9 Gm23203-201ENSMUST00000104374 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RpainQ9CWY9 Mup-ps5-201ENSMUST00000118667 99 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RpainQ9CWY9 Gm24648-201ENSMUST00000157111 132 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RpainQ9CWY9 Gm23170-201ENSMUST00000157158 106 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RpainQ9CWY9 Gm25160-201ENSMUST00000158914 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RpainQ9CWY9 Gm21905-201ENSMUST00000177616 87 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
RpainQ9CWY9 Gm25354-201ENSMUST00000179110 105 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RpainQ9CWY9 Gm27711-201ENSMUST00000183802 118 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RpainQ9CWY9 Mir468-201ENSMUST00000197332 78 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RpainQ9CWY9 AC147560.1-201ENSMUST00000197528 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RpainQ9CWY9 Gm43927-201ENSMUST00000204599 117 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RpainQ9CWY9 Gm44948-201ENSMUST00000209050 149 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RpainQ9CWY9 Gm25798-201ENSMUST00000082641 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RpainQ9CWY9 Gm26207-201ENSMUST00000082909 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RpainQ9CWY9 Snord1a-201ENSMUST00000083160 74 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RpainQ9CWY9 Gm15115-201ENSMUST00000121145 264 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RpainQ9CWY9 Gm22559-201ENSMUST00000157329 134 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RpainQ9CWY9 Gm22095-201ENSMUST00000158984 150 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RpainQ9CWY9 n-R5s70-201ENSMUST00000122650 116 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RpainQ9CWY9 Gm24009-201ENSMUST00000157734 93 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RpainQ9CWY9 Gm23967-201ENSMUST00000175062 78 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RpainQ9CWY9 Gm28435-201ENSMUST00000185496 108 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RpainQ9CWY9 Gm29047-201ENSMUST00000189816 108 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RpainQ9CWY9 Gm26202-201ENSMUST00000082910 65 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RpainQ9CWY9 Mirlet7a-1-201ENSMUST00000083487 94 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RpainQ9CWY9 Olfr307-203ENSMUST00000217494 4515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
RpainQ9CWY9 Arhgap5-201ENSMUST00000110725 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
RpainQ9CWY9 Gm23060-201ENSMUST00000102345 109 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RpainQ9CWY9 Gm24379-201ENSMUST00000122695 86 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RpainQ9CWY9 Gm23857-201ENSMUST00000158379 111 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RpainQ9CWY9 Gm24129-201ENSMUST00000158537 97 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RpainQ9CWY9 Gm10548-202ENSMUST00000165672 272 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RpainQ9CWY9 Gm25936-201ENSMUST00000179952 114 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RpainQ9CWY9 Gm28794-201ENSMUST00000185276 136 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RpainQ9CWY9 Gm20305-201ENSMUST00000193226 177 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RpainQ9CWY9 Sycp1-ps1-201ENSMUST00000207882 2768 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RpainQ9CWY9 Gm25663-201ENSMUST00000157698 135 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RpainQ9CWY9 Gm25600-201ENSMUST00000158357 106 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RpainQ9CWY9 Trgj4-201ENSMUST00000184430 61 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
RpainQ9CWY9 Gm44469-201ENSMUST00000198558 79 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RpainQ9CWY9 Gm25847-201ENSMUST00000116793 96 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RpainQ9CWY9 Mir1197-201ENSMUST00000117037 120 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RpainQ9CWY9 Gm23558-201ENSMUST00000157823 80 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RpainQ9CWY9 Gm26158-201ENSMUST00000158973 119 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RpainQ9CWY9 Gm27297-201ENSMUST00000183395 105 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
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