Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Gm25600-201ENSMUST00000158357 106 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Gm25974-201ENSMUST00000158701 94 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Traj45-201ENSMUST00000103697 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.14□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Gm23661-201ENSMUST00000122630 87 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Gm22515-201ENSMUST00000158273 305 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Gm27993-201ENSMUST00000184362 85 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Mir3087-201ENSMUST00000199405 56 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Gm20108-201ENSMUST00000219977 153 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Gm26224-201ENSMUST00000082506 80 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Mir324-201ENSMUST00000083600 89 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Olfr820-203ENSMUST00000215791 3956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Gm22677-201ENSMUST00000116977 108 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Gm24686-201ENSMUST00000157755 93 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Gm26158-201ENSMUST00000158973 119 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Gm38074-201ENSMUST00000193467 145 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 AC147560.1-201ENSMUST00000197528 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Gm44488-201ENSMUST00000199467 119 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Zfp960-201ENSMUST00000127027 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 AC164629.4-201ENSMUST00000218505 3247 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Gm24271-201ENSMUST00000102327 111 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Snord69-201ENSMUST00000104024 80 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Gm25968-201ENSMUST00000157167 100 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Gm24009-201ENSMUST00000157734 93 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Gm22140-201ENSMUST00000158745 120 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Gm27711-201ENSMUST00000183802 118 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Gm38295-201ENSMUST00000191951 151 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Gm43927-201ENSMUST00000204599 117 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Mir211-201ENSMUST00000083651 106 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Gm23528-201ENSMUST00000104571 132 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Gm23788-201ENSMUST00000122535 106 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Gm24183-201ENSMUST00000122572 93 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Gm22559-201ENSMUST00000157329 134 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Gm27297-201ENSMUST00000183395 105 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Mir8090-201ENSMUST00000185078 136 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Gm28794-201ENSMUST00000185276 136 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 AC157602.1-201ENSMUST00000197446 105 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Gm26441-201ENSMUST00000082590 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Mir410-201ENSMUST00000083563 81 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Gm24697-201ENSMUST00000083881 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Tex15-201ENSMUST00000009772 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 B230307C23Rik-201ENSMUST00000113729 192 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Mup-ps5-201ENSMUST00000118667 99 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Gm25112-201ENSMUST00000122680 104 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Gm22605-201ENSMUST00000158289 108 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Gm24637-201ENSMUST00000158674 85 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Gm25229-201ENSMUST00000178587 79 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Gm38323-201ENSMUST00000192450 210 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Vmn1r75-204ENSMUST00000227611 4336 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Mir216b-201ENSMUST00000102363 86 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Gm24865-201ENSMUST00000103246 96 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Gm22030-201ENSMUST00000116942 63 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Gm22033-201ENSMUST00000116947 90 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Mir7063-201ENSMUST00000184158 91 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 AC139186.1-201ENSMUST00000197610 94 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Gm24208-201ENSMUST00000082783 135 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Mir500-201ENSMUST00000093600 92 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Ddb2Q99J79 Gm10945-201ENSMUST00000105596 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 Gm14947-201ENSMUST00000133704 303 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 Gm24648-201ENSMUST00000157111 132 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 Gm23468-201ENSMUST00000157125 108 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 Gm26089-201ENSMUST00000157898 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 Gm27639-201ENSMUST00000184937 85 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 Olfr820-202ENSMUST00000214917 4701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 Mir3098-201ENSMUST00000175416 87 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 Gm27686-201ENSMUST00000185123 91 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 AC168062.3-201ENSMUST00000227025 165 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 Gm24311-201ENSMUST00000082570 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 Gm22205-201ENSMUST00000122655 71 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 Gm23967-201ENSMUST00000175062 78 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 Gm22466-201ENSMUST00000175278 69 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 Gm25693-201ENSMUST00000175443 85 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 Mir509-201ENSMUST00000196089 75 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 AC116319.1-201ENSMUST00000227765 222 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 Gm25696-201ENSMUST00000082900 105 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 Gm24527-201ENSMUST00000082920 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 Gm25128-201ENSMUST00000083339 76 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 Gm11857-201ENSMUST00000119817 324 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 Gm24290-201ENSMUST00000157634 96 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 Gm22732-201ENSMUST00000158093 121 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 Gm23267-201ENSMUST00000178490 132 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 Gm26712-201ENSMUST00000180813 217 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 Gm27975-201ENSMUST00000184400 101 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 Gm43944-201ENSMUST00000205220 120 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 Gm22980-201ENSMUST00000082608 70 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 Mir29a-201ENSMUST00000083676 88 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 Olfr832-202ENSMUST00000218385 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 n-R5s157-201ENSMUST00000122543 121 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 Gm22541-201ENSMUST00000158165 127 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 Gm24549-201ENSMUST00000158647 139 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 Gm3702-201ENSMUST00000211754 346 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 Mir30a-201ENSMUST00000083471 71 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 Mir377-201ENSMUST00000083504 68 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 Gm22233-201ENSMUST00000157464 114 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 Gm22485-201ENSMUST00000157990 109 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 Gm25868-201ENSMUST00000158253 114 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 Gm7258-201ENSMUST00000179317 300 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 Mir7091-201ENSMUST00000184075 79 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 Gm23301-201ENSMUST00000082713 65 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 Gm23245-201ENSMUST00000083370 135 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Ddb2Q99J79 Gm22786-201ENSMUST00000104086 122 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
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