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Protein–RNA interactions for Protein: Q62395
Tff3, Trefoil factor 3, mouse
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (Experimental data)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
Tff3
Q62395
Gm22336-201
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BASIC
-4.31
□□□□□ -3.1
Tff3
Q62395
Gm22557-201
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102 nt
BASIC
-4.31
□□□□□ -3.1
Tff3
Q62395
Gm24037-201
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180 nt
BASIC
-4.31
□□□□□ -3.1
Tff3
Q62395
Mir489-201
ENSMUST00000093599
107 nt
BASIC
-4.31
□□□□□ -3.1
Tff3
Q62395
Gm24867-201
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107 nt
BASIC
-4.32
□□□□□ -3.1
Tff3
Q62395
Gm25781-201
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BASIC
-4.32
□□□□□ -3.1
Tff3
Q62395
Gm24097-201
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107 nt
BASIC
-4.32
□□□□□ -3.1
Tff3
Q62395
Gm24610-201
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BASIC
-4.32
□□□□□ -3.1
Tff3
Q62395
Gm13801-201
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BASIC
-4.33
□□□□□ -3.1
Tff3
Q62395
n-R5s218-201
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BASIC
-4.33
□□□□□ -3.1
Tff3
Q62395
Gm23536-201
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BASIC
-4.33
□□□□□ -3.1
Tff3
Q62395
Gm22602-201
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BASIC
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□□□□□ -3.1
Tff3
Q62395
Igkv13-56-1-201
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BASIC
-4.33
□□□□□ -3.1
Tff3
Q62395
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TSL 5
BASIC
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□□□□□ -3.1
Tff3
Q62395
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BASIC
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□□□□□ -3.1
Tff3
Q62395
Gm22296-201
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BASIC
-4.33
□□□□□ -3.1
Tff3
Q62395
Gm26500-201
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BASIC
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□□□□□ -3.1
Tff3
Q62395
Gm25364-201
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BASIC
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Tff3
Q62395
Mir28c-201
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BASIC
-4.34
□□□□□ -3.1
Tff3
Q62395
AC132615.1-201
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BASIC
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□□□□□ -3.1
Tff3
Q62395
Gm44990-201
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BASIC
-4.36
□□□□□ -3.11
Tff3
Q62395
Mir190b-201
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BASIC
-4.37
□□□□□ -3.11
Tff3
Q62395
Gm23567-201
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BASIC
-4.37
□□□□□ -3.11
Tff3
Q62395
Gm23648-201
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BASIC
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Tff3
Q62395
Gm44563-201
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BASIC
-4.37
□□□□□ -3.11
Tff3
Q62395
Gm14567-201
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BASIC
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□□□□□ -3.11
Tff3
Q62395
Gm24801-201
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BASIC
-4.38
□□□□□ -3.11
Tff3
Q62395
Gm22232-201
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BASIC
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□□□□□ -3.11
Tff3
Q62395
Gm27446-201
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BASIC
-4.39
□□□□□ -3.11
Tff3
Q62395
Gm28330-201
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BASIC
-4.39
□□□□□ -3.11
Tff3
Q62395
Gm45655-201
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BASIC
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□□□□□ -3.11
Tff3
Q62395
Gm25635-201
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BASIC
-4.39
□□□□□ -3.11
Tff3
Q62395
Gm11835-201
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BASIC
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□□□□□ -3.11
Tff3
Q62395
Gm17631-201
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TSL 5
BASIC
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□□□□□ -3.11
Tff3
Q62395
Gm23571-201
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BASIC
-4.4
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Tff3
Q62395
Gm24518-201
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BASIC
-4.4
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Tff3
Q62395
Mirlet7a-1-201
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BASIC
-4.4
□□□□□ -3.11
Tff3
Q62395
Gm42594-201
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BASIC
-4.41
□□□□□ -3.12
Tff3
Q62395
Smr2-204
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APPRIS ALT2
TSL 1 (best)
BASIC
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□□□□□ -3.12
Tff3
Q62395
n-R5s94-201
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BASIC
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Tff3
Q62395
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BASIC
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Tff3
Q62395
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BASIC
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□□□□□ -3.12
Tff3
Q62395
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Tff3
Q62395
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BASIC
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Tff3
Q62395
Mir691-201
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BASIC
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Tff3
Q62395
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BASIC
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Tff3
Q62395
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BASIC
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Tff3
Q62395
Gm24683-201
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BASIC
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Tff3
Q62395
Gm11168-204
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672 nt
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BASIC
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□□□□□ -3.12
Tff3
Q62395
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BASIC
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Tff3
Q62395
Mir9-2-201
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BASIC
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Tff3
Q62395
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Tff3
Q62395
Gm44347-201
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BASIC
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Tff3
Q62395
Gm25930-201
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BASIC
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Tff3
Q62395
Gm10663-201
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APPRIS P1
TSL 5
BASIC
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□□□□□ -3.12
Tff3
Q62395
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BASIC
-4.45
□□□□□ -3.12
Tff3
Q62395
Gm22693-201
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BASIC
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□□□□□ -3.12
Tff3
Q62395
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BASIC
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Tff3
Q62395
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BASIC
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Tff3
Q62395
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BASIC
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Tff3
Q62395
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BASIC
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Tff3
Q62395
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BASIC
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Tff3
Q62395
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BASIC
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Tff3
Q62395
Snord100-201
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BASIC
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Tff3
Q62395
Gm23725-201
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BASIC
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Tff3
Q62395
RMST_1.1-206
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309 nt
TSL 3
BASIC
-4.49
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Tff3
Q62395
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254 nt
BASIC
-4.5
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Tff3
Q62395
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Tff3
Q62395
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BASIC
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Tff3
Q62395
Gm22686-201
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BASIC
-4.51
□□□□□ -3.13
Tff3
Q62395
Gm23138-201
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BASIC
-4.51
□□□□□ -3.13
Tff3
Q62395
Gm26482-201
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62 nt
BASIC
-4.52
□□□□□ -3.13
Tff3
Q62395
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BASIC
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Tff3
Q62395
Gm26287-201
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81 nt
BASIC
-4.52
□□□□□ -3.13
Tff3
Q62395
Gm27928-201
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BASIC
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□□□□□ -3.13
Tff3
Q62395
Gm44858-201
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BASIC
-4.52
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Tff3
Q62395
Gm23041-201
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BASIC
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□□□□□ -3.13
Tff3
Q62395
Snora19-201
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BASIC
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□□□□□ -3.13
Tff3
Q62395
Gm23658-201
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132 nt
BASIC
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Tff3
Q62395
Mir1906-1-201
ENSMUST00000122586
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BASIC
-4.54
□□□□□ -3.14
Tff3
Q62395
Mir1906-2-201
ENSMUST00000122610
80 nt
BASIC
-4.54
□□□□□ -3.14
Tff3
Q62395
Gm45402-201
ENSMUST00000211796
223 nt
BASIC
-4.54
□□□□□ -3.14
Tff3
Q62395
Gm24697-201
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107 nt
BASIC
-4.54
□□□□□ -3.14
Tff3
Q62395
Mir493-201
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83 nt
BASIC
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□□□□□ -3.14
Tff3
Q62395
Gm25367-201
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106 nt
BASIC
-4.55
□□□□□ -3.14
Tff3
Q62395
Gm27882-201
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BASIC
-4.55
□□□□□ -3.14
Tff3
Q62395
Gm26293-201
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BASIC
-4.56
□□□□□ -3.14
Tff3
Q62395
Gm24418-201
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BASIC
-4.56
□□□□□ -3.14
Tff3
Q62395
Gm24639-201
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BASIC
-4.56
□□□□□ -3.14
Tff3
Q62395
Gm23076-201
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BASIC
-4.56
□□□□□ -3.14
Tff3
Q62395
Gm25077-201
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BASIC
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□□□□□ -3.14
Tff3
Q62395
Gm23344-201
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BASIC
-4.56
□□□□□ -3.14
Tff3
Q62395
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BASIC
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□□□□□ -3.14
Tff3
Q62395
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107 nt
BASIC
-4.57
□□□□□ -3.14
Tff3
Q62395
Gm27476-201
ENSMUST00000183366
104 nt
BASIC
-4.57
□□□□□ -3.14
Tff3
Q62395
Gm27410-201
ENSMUST00000183851
115 nt
BASIC
-4.57
□□□□□ -3.14
Tff3
Q62395
Gm22113-201
ENSMUST00000158343
104 nt
BASIC
-4.58
□□□□□ -3.14
Tff3
Q62395
Gm23384-201
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103 nt
BASIC
-4.58
□□□□□ -3.14
Tff3
Q62395
Traj61-201
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72 nt
BASIC
-4.58
□□□□□ -3.14
Tff3
Q62395
Gm44142-201
ENSMUST00000203358
311 nt
BASIC
-4.58
□□□□□ -3.14
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