Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Mir21c-201ENSMUST00000184910 78 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Ttf1Q62187 Gm43907-201ENSMUST00000203128 117 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Ttf1Q62187 AC125190.3-201ENSMUST00000223224 121 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Ttf1Q62187 Gm21940-201ENSMUST00000204940 2278 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Ttf1Q62187 Snora16a-202ENSMUST00000196061 137 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Ttf1Q62187 Gm23378-201ENSMUST00000082942 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Ttf1Q62187 Snord2-201ENSMUST00000157899 69 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Ttf1Q62187 Mir7651-201ENSMUST00000184154 64 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Ttf1Q62187 AC154390.1-201ENSMUST00000225629 277 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Ttf1Q62187 Gm23483-201ENSMUST00000104179 108 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Ttf1Q62187 Gm23901-201ENSMUST00000157570 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Ttf1Q62187 Mir183-201ENSMUST00000083685 70 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Ttf1Q62187 Gm12013-201ENSMUST00000121971 155 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Ttf1Q62187 Gm27465-201ENSMUST00000184290 91 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Ttf1Q62187 Snord67-201ENSMUST00000104033 111 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Ttf1Q62187 Gm25497-201ENSMUST00000104425 132 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Ttf1Q62187 Gm25482-201ENSMUST00000083225 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Ttf1Q62187 Gm25055-201ENSMUST00000157369 76 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Ttf1Q62187 Gm22675-201ENSMUST00000158430 104 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Ttf1Q62187 Ighv15-1-201ENSMUST00000194450 276 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Ttf1Q62187 Gm44338-201ENSMUST00000198614 110 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Ttf1Q62187 Gm26081-201ENSMUST00000104068 132 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Ttf1Q62187 Gm24868-201ENSMUST00000157265 136 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Ttf1Q62187 Gm24077-201ENSMUST00000158183 136 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Ttf1Q62187 Gm23900-201ENSMUST00000157569 108 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Ttf1Q62187 Gm23260-201ENSMUST00000158317 172 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Ttf1Q62187 Gm24054-201ENSMUST00000158619 105 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Ttf1Q62187 Gm23977-201ENSMUST00000177871 74 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Ttf1Q62187 Gm26097-201ENSMUST00000179642 93 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Ttf1Q62187 Gm37624-201ENSMUST00000193751 219 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Ttf1Q62187 Mir466e-201ENSMUST00000198862 84 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Ttf1Q62187 Mir466c-1-201ENSMUST00000200654 84 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Ttf1Q62187 Gm23690-201ENSMUST00000083036 94 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Ttf1Q62187 Gm24522-201ENSMUST00000083964 108 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Ttf1Q62187 Gm25680-201ENSMUST00000116917 126 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Ttf1Q62187 Gm22635-201ENSMUST00000116962 126 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Ttf1Q62187 Gm24399-201ENSMUST00000157869 74 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Ttf1Q62187 Gm22542-201ENSMUST00000158166 95 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Ttf1Q62187 Gm23258-201ENSMUST00000158319 106 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Ttf1Q62187 Gm25993-201ENSMUST00000175391 80 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Ttf1Q62187 Gm23291-201ENSMUST00000175611 78 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Ttf1Q62187 Snora16a-201ENSMUST00000083163 136 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Ttf1Q62187 Gm22720-201ENSMUST00000122710 87 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Ttf1Q62187 Gm26133-201ENSMUST00000157363 100 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Ttf1Q62187 Gm25060-201ENSMUST00000157374 130 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Ttf1Q62187 Gm26426-201ENSMUST00000177866 123 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Ttf1Q62187 Gm26060-201ENSMUST00000180094 123 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Ttf1Q62187 Traj49-202ENSMUST00000199452 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
Ttf1Q62187 Gm26438-201ENSMUST00000082593 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Ttf1Q62187 Gm25337-201ENSMUST00000083723 104 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Ttf1Q62187 Mir466b-8-201ENSMUST00000103883 86 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
Ttf1Q62187 Gm24648-201ENSMUST00000157111 132 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
Ttf1Q62187 Gm22139-201ENSMUST00000158747 105 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
Ttf1Q62187 Gm25249-201ENSMUST00000175471 78 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
Ttf1Q62187 Mir141-201ENSMUST00000083540 72 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
Ttf1Q62187 Gm25388-201ENSMUST00000157339 151 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Ttf1Q62187 Gm24686-201ENSMUST00000157755 93 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Ttf1Q62187 Mir802-201ENSMUST00000103258 97 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
Ttf1Q62187 Gm26011-201ENSMUST00000104410 104 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
Ttf1Q62187 Gm24246-201ENSMUST00000157315 132 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
Ttf1Q62187 Gm22606-201ENSMUST00000158290 103 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
Ttf1Q62187 Gm22989-201ENSMUST00000158313 86 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
Ttf1Q62187 Gm24508-201ENSMUST00000180104 107 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
Ttf1Q62187 Gm37545-201ENSMUST00000186512 148 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
Ttf1Q62187 Gm44409-201ENSMUST00000198810 166 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
Ttf1Q62187 AC158982.2-201ENSMUST00000226283 184 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
Ttf1Q62187 Gm23947-201ENSMUST00000093636 107 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
Ttf1Q62187 Gm26421-201ENSMUST00000104279 132 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
Ttf1Q62187 Gm22373-201ENSMUST00000104584 89 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
Ttf1Q62187 Mir669g-201ENSMUST00000116809 123 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
Ttf1Q62187 Mup-ps5-201ENSMUST00000118667 99 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
Ttf1Q62187 Gm22089-201ENSMUST00000158336 102 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
Ttf1Q62187 Gm25656-201ENSMUST00000158466 66 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
Ttf1Q62187 Gm25772-201ENSMUST00000158574 56 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
Ttf1Q62187 Gm23504-201ENSMUST00000158988 95 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
Ttf1Q62187 Gm25596-201ENSMUST00000178368 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
Ttf1Q62187 Mir148a-201ENSMUST00000083571 99 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
Ttf1Q62187 Gm11116-201ENSMUST00000113257 54 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
Ttf1Q62187 Gm23715-201ENSMUST00000157354 106 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Ttf1Q62187 Gm26369-201ENSMUST00000157825 100 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Ttf1Q62187 Gm25014-201ENSMUST00000158401 103 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Ttf1Q62187 Mir344h-1-201ENSMUST00000174922 60 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Ttf1Q62187 Mir344h-2-201ENSMUST00000175612 60 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Ttf1Q62187 Gm22169-201ENSMUST00000083229 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Ttf1Q62187 Gm24455-201ENSMUST00000083348 131 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Ttf1Q62187 Mir471-201ENSMUST00000093596 67 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Ttf1Q62187 Gm26091-201ENSMUST00000122704 82 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
Ttf1Q62187 Gm23337-201ENSMUST00000158959 118 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
Ttf1Q62187 Snord49b-201ENSMUST00000082503 72 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
Ttf1Q62187 Gm23056-201ENSMUST00000082803 111 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
Ttf1Q62187 Snord90-201ENSMUST00000104568 111 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
Ttf1Q62187 Gm24718-201ENSMUST00000157521 136 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
Ttf1Q62187 Gm22259-201ENSMUST00000178926 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
Ttf1Q62187 mt-Tl1-201ENSMUST00000082391 75 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
Ttf1Q62187 mt-Tw-201ENSMUST00000082397 67 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
Ttf1Q62187 Gm24461-201ENSMUST00000082735 103 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
Ttf1Q62187 Mir103-1-201ENSMUST00000083619 86 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
Ttf1Q62187 Gm25522-201ENSMUST00000158394 105 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
Ttf1Q62187 Gm23351-201ENSMUST00000158427 125 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
Ttf1Q62187 Olfr880-ps1-201ENSMUST00000212344 229 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 197.9 ms