Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Gm23140-201ENSMUST00000082487 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Ctdnep1Q3TP92 Gm22981-201ENSMUST00000082611 75 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Ctdnep1Q3TP92 Gm22652-201ENSMUST00000083207 131 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Ctdnep1Q3TP92 Gm24141-201ENSMUST00000122776 115 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Ctdnep1Q3TP92 Gm25247-201ENSMUST00000175475 90 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Ctdnep1Q3TP92 Gm8034-201ENSMUST00000178853 132 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Ctdnep1Q3TP92 Defb38-201ENSMUST00000066416 286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.03□□□□□ -2.4
Ctdnep1Q3TP92 Mir18-201ENSMUST00000083469 96 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Ctdnep1Q3TP92 Gm25629-201ENSMUST00000084001 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Ctdnep1Q3TP92 Gm24913-201ENSMUST00000157286 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Ctdnep1Q3TP92 Gm22788-201ENSMUST00000157876 61 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Ctdnep1Q3TP92 Gm22089-201ENSMUST00000158336 102 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Ctdnep1Q3TP92 Mir3967-201ENSMUST00000198710 68 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Ctdnep1Q3TP92 Gm44803-201ENSMUST00000204384 156 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Ctdnep1Q3TP92 Gm43927-201ENSMUST00000204599 117 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Ctdnep1Q3TP92 Gm45492-201ENSMUST00000211611 288 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Ctdnep1Q3TP92 mt-Tc-201ENSMUST00000082400 66 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Ctdnep1Q3TP92 mt-Atp8-201ENSMUST00000082407 204 ntAPPRIS P1 BASIC0.02□□□□□ -2.41
Ctdnep1Q3TP92 mt-Ts2-201ENSMUST00000082416 59 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Ctdnep1Q3TP92 Gm25401-201ENSMUST00000082975 106 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Ctdnep1Q3TP92 Gm25703-201ENSMUST00000083123 151 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Ctdnep1Q3TP92 Gm26018-201ENSMUST00000104406 128 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Ctdnep1Q3TP92 Gm25056-201ENSMUST00000157372 62 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Ctdnep1Q3TP92 Gm45197-201ENSMUST00000205288 151 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Ctdnep1Q3TP92 Gm23654-201ENSMUST00000116758 126 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Ctdnep1Q3TP92 Gm22349-201ENSMUST00000157864 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Ctdnep1Q3TP92 Mir3473d-201ENSMUST00000175346 81 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Ctdnep1Q3TP92 Gm28270-201ENSMUST00000188550 109 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Ctdnep1Q3TP92 Gm28328-201ENSMUST00000188869 109 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Ctdnep1Q3TP92 Gm29047-201ENSMUST00000189816 108 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Ctdnep1Q3TP92 Traj49-202ENSMUST00000199452 62 ntAPPRIS P1 BASIC0□□□□□ -2.41
Ctdnep1Q3TP92 AC126939.1-201ENSMUST00000224943 226 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Ctdnep1Q3TP92 Mir802-201ENSMUST00000103258 97 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Ctdnep1Q3TP92 Gm11749-201ENSMUST00000127327 184 ntTSL 2 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
Ctdnep1Q3TP92 Gm24649-201ENSMUST00000157106 134 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Ctdnep1Q3TP92 Gm22966-201ENSMUST00000157957 129 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Ctdnep1Q3TP92 Gm23351-201ENSMUST00000158427 125 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Ctdnep1Q3TP92 Gm23020-201ENSMUST00000158766 253 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Ctdnep1Q3TP92 Gm27928-201ENSMUST00000183747 256 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Ctdnep1Q3TP92 Gm25791-201ENSMUST00000083292 137 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Ctdnep1Q3TP92 Gm24449-201ENSMUST00000083985 106 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Ctdnep1Q3TP92 Gm6358-201ENSMUST00000089101 156 ntAPPRIS ALT2 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
Ctdnep1Q3TP92 Gm22368-201ENSMUST00000102416 109 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Ctdnep1Q3TP92 Gm22772-201ENSMUST00000104451 121 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Ctdnep1Q3TP92 Gm22340-201ENSMUST00000157717 114 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Ctdnep1Q3TP92 Gm24399-201ENSMUST00000157869 74 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Ctdnep1Q3TP92 Gm22088-201ENSMUST00000158341 117 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Ctdnep1Q3TP92 Gm22708-201ENSMUST00000158987 103 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Ctdnep1Q3TP92 Gm45374-201ENSMUST00000211388 136 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Ctdnep1Q3TP92 Gm25081-201ENSMUST00000082534 108 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Ctdnep1Q3TP92 n-R5s12-201ENSMUST00000083785 119 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Ctdnep1Q3TP92 Gm24263-201ENSMUST00000104059 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Ctdnep1Q3TP92 Gm26369-201ENSMUST00000157825 100 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Ctdnep1Q3TP92 Gm22775-201ENSMUST00000177630 120 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Ctdnep1Q3TP92 Gm23569-201ENSMUST00000180120 120 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Ctdnep1Q3TP92 Gm44345-201ENSMUST00000199560 135 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Ctdnep1Q3TP92 Gm23722-201ENSMUST00000083002 130 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Ctdnep1Q3TP92 Gm22681-201ENSMUST00000083853 106 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Ctdnep1Q3TP92 Gm23531-201ENSMUST00000104567 68 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Ctdnep1Q3TP92 Gm25375-201ENSMUST00000158157 135 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Ctdnep1Q3TP92 Gm25309-201ENSMUST00000116728 126 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Ctdnep1Q3TP92 Gm23900-201ENSMUST00000157569 108 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Ctdnep1Q3TP92 Gm24686-201ENSMUST00000157755 93 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Ctdnep1Q3TP92 Gm24884-201ENSMUST00000158784 119 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Ctdnep1Q3TP92 Gm26007-201ENSMUST00000158798 120 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Ctdnep1Q3TP92 Gm25161-201ENSMUST00000158913 132 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Ctdnep1Q3TP92 Gm38208-201ENSMUST00000192476 114 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Ctdnep1Q3TP92 Gm45617-201ENSMUST00000211132 209 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Ctdnep1Q3TP92 Snord85-201ENSMUST00000083262 73 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Ctdnep1Q3TP92 Gm23012-201ENSMUST00000104149 83 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Ctdnep1Q3TP92 Gm23065-201ENSMUST00000158236 130 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Ctdnep1Q3TP92 Gm22327-201ENSMUST00000158899 108 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Ctdnep1Q3TP92 Gm44322-201ENSMUST00000196830 115 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Ctdnep1Q3TP92 Gm43907-201ENSMUST00000203128 117 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Ctdnep1Q3TP92 Gm25635-201ENSMUST00000082675 131 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Ctdnep1Q3TP92 Gm23788-201ENSMUST00000122535 106 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Ctdnep1Q3TP92 Gm25623-201ENSMUST00000157216 108 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Ctdnep1Q3TP92 Gm23601-201ENSMUST00000157259 131 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Ctdnep1Q3TP92 Gm26133-201ENSMUST00000157363 100 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Ctdnep1Q3TP92 Gm22077-201ENSMUST00000157594 93 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Ctdnep1Q3TP92 Gm25014-201ENSMUST00000158401 103 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Ctdnep1Q3TP92 Gm24842-201ENSMUST00000158681 54 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Ctdnep1Q3TP92 Gm22638-201ENSMUST00000179674 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Ctdnep1Q3TP92 Gm44470-201ENSMUST00000203913 142 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Ctdnep1Q3TP92 Mir363-201ENSMUST00000093598 75 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Ctdnep1Q3TP92 Gm25366-201ENSMUST00000158845 124 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Ctdnep1Q3TP92 n-R5s96-201ENSMUST00000082574 124 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Ctdnep1Q3TP92 Mir466b-3-201ENSMUST00000103806 81 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Ctdnep1Q3TP92 Gm23986-201ENSMUST00000157144 63 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Ctdnep1Q3TP92 Snord2-201ENSMUST00000157899 69 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Ctdnep1Q3TP92 Gm23994-201ENSMUST00000158059 88 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Ctdnep1Q3TP92 Gm26498-201ENSMUST00000177799 79 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Ctdnep1Q3TP92 Gm26230-201ENSMUST00000180141 79 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Ctdnep1Q3TP92 Gm26712-201ENSMUST00000180813 217 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Ctdnep1Q3TP92 Mir3065-201ENSMUST00000198674 87 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Ctdnep1Q3TP92 AL929417.1-201ENSMUST00000214901 124 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Ctdnep1Q3TP92 Gm23239-201ENSMUST00000083006 181 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Ctdnep1Q3TP92 Gm22196-201ENSMUST00000116865 109 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Ctdnep1Q3TP92 Mup-ps5-201ENSMUST00000118667 99 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Ctdnep1Q3TP92 Gm24648-201ENSMUST00000157111 132 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
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