Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm23170-201ENSMUST00000157158 106 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PtpreP49446 Gm24900-201ENSMUST00000158128 134 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PtpreP49446 Gm25974-201ENSMUST00000158701 94 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PtpreP49446 Gm22093-201ENSMUST00000158980 111 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PtpreP49446 Mir494-201ENSMUST00000093632 85 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PtpreP49446 Gm43484-201ENSMUST00000198333 5966 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PtpreP49446 Gm16510-201ENSMUST00000153501 249 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PtpreP49446 Gm23857-201ENSMUST00000158379 111 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PtpreP49446 AC157278.1-201ENSMUST00000221621 148 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PtpreP49446 Gm26922-201ENSMUST00000082687 72 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PtpreP49446 Gm27722-201ENSMUST00000183908 76 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PtpreP49446 Gm27443-201ENSMUST00000184660 98 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PtpreP49446 Gm37557-201ENSMUST00000191640 139 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PtpreP49446 Mir126a-201ENSMUST00000083606 73 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PtpreP49446 Gm10203-201ENSMUST00000087348 198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PtpreP49446 Fam46d-201ENSMUST00000101292 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
PtpreP49446 Olfr868-202ENSMUST00000212999 4233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PtpreP49446 Gm6985-201ENSMUST00000121255 271 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PtpreP49446 Gm24915-201ENSMUST00000157288 78 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PtpreP49446 Gm25368-201ENSMUST00000158847 131 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PtpreP49446 Hmga1b-202ENSMUST00000178955 120 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PtpreP49446 AC160976.1-201ENSMUST00000215092 148 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PtpreP49446 Gm25650-201ENSMUST00000083784 162 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PtpreP49446 Usp9y-201ENSMUST00000091188 8094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
PtpreP49446 Mir741-201ENSMUST00000103931 71 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PtpreP49446 Gm23106-201ENSMUST00000157554 101 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PtpreP49446 Gm10548-202ENSMUST00000165672 272 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PtpreP49446 Gm27517-201ENSMUST00000184347 236 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PtpreP49446 Mir6901-201ENSMUST00000185062 62 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PtpreP49446 Mir7021-201ENSMUST00000197026 63 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PtpreP49446 Mir3087-201ENSMUST00000199405 56 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PtpreP49446 Mir297-1-201ENSMUST00000103800 76 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PtpreP49446 Gm22078-201ENSMUST00000157593 103 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PtpreP49446 Gm23291-201ENSMUST00000175611 78 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PtpreP49446 Gm25730-201ENSMUST00000178753 165 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PtpreP49446 Gm22809-201ENSMUST00000082743 156 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PtpreP49446 Gm24208-201ENSMUST00000082783 135 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PtpreP49446 Snord45b-201ENSMUST00000082797 71 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PtpreP49446 Gm24134-201ENSMUST00000083361 71 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PtpreP49446 Gm24677-201ENSMUST00000158755 150 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PtpreP49446 Gm25958-201ENSMUST00000175114 71 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PtpreP49446 n-R5s70-201ENSMUST00000122650 116 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PtpreP49446 Gm25460-201ENSMUST00000157954 127 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PtpreP49446 Trgj1-201ENSMUST00000200495 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PtpreP49446 Gm44948-201ENSMUST00000209050 149 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PtpreP49446 Snora69-201ENSMUST00000083708 131 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PtpreP49446 Gm26257-201ENSMUST00000122500 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PtpreP49446 Gm25423-201ENSMUST00000157609 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PtpreP49446 Gm22556-201ENSMUST00000157803 100 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PtpreP49446 Gm25366-201ENSMUST00000158845 124 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PtpreP49446 Olfr659-202ENSMUST00000214986 4842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PtpreP49446 Mir544-201ENSMUST00000103813 78 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PtpreP49446 Gm23172-201ENSMUST00000157160 124 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PtpreP49446 Gm22801-201ENSMUST00000175624 84 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PtpreP49446 AC156794.1-201ENSMUST00000214415 214 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PtpreP49446 Olfr711-203ENSMUST00000216335 4724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PtpreP49446 Gm13231-201ENSMUST00000119218 2850 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PtpreP49446 Gm25110-201ENSMUST00000116684 121 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PtpreP49446 Gm25775-201ENSMUST00000116716 121 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PtpreP49446 Gm24795-201ENSMUST00000116737 121 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PtpreP49446 Gm25171-201ENSMUST00000116926 121 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PtpreP49446 Gm22788-201ENSMUST00000157876 61 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PtpreP49446 Gm26089-201ENSMUST00000157898 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PtpreP49446 Gm24076-201ENSMUST00000158179 94 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PtpreP49446 Gm22862-201ENSMUST00000178593 121 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PtpreP49446 Gm24638-201ENSMUST00000179807 132 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PtpreP49446 Mir8116-201ENSMUST00000184134 97 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PtpreP49446 Trgj4-201ENSMUST00000184430 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PtpreP49446 Gm43885-201ENSMUST00000204928 2542 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PtpreP49446 Mir216b-201ENSMUST00000102363 86 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PtpreP49446 Gm27450-201ENSMUST00000104632 90 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PtpreP49446 Gm24290-201ENSMUST00000157634 96 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PtpreP49446 Gm25693-201ENSMUST00000175443 85 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PtpreP49446 Snord14a-201ENSMUST00000082807 87 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PtpreP49446 Gm22727-201ENSMUST00000158090 116 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PtpreP49446 Gm22406-201ENSMUST00000174923 93 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PtpreP49446 Gm24154-201ENSMUST00000175261 130 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PtpreP49446 Gm36956-201ENSMUST00000193830 214 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PtpreP49446 Mir468-201ENSMUST00000197332 78 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PtpreP49446 Gm44488-201ENSMUST00000199467 119 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PtpreP49446 Gm43907-201ENSMUST00000203128 117 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PtpreP49446 Mir301b-201ENSMUST00000102333 97 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PtpreP49446 Gm24983-201ENSMUST00000104457 69 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PtpreP49446 B230307C23Rik-201ENSMUST00000113729 192 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PtpreP49446 Gm25183-201ENSMUST00000157752 106 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PtpreP49446 Mir7016-201ENSMUST00000184308 72 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PtpreP49446 Mir6352-201ENSMUST00000184495 116 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PtpreP49446 Gm24201-201ENSMUST00000082946 125 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PtpreP49446 Gm24476-201ENSMUST00000157437 131 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PtpreP49446 Gm24229-201ENSMUST00000158830 118 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PtpreP49446 Gm23649-201ENSMUST00000179007 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PtpreP49446 CT485608.2-201ENSMUST00000227210 291 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PtpreP49446 Gm23100-201ENSMUST00000083455 141 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PtpreP49446 Olfr832-202ENSMUST00000218385 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PtpreP49446 Gm22030-201ENSMUST00000116942 63 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PtpreP49446 Gm22929-201ENSMUST00000175517 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PtpreP49446 Gm27549-201ENSMUST00000183508 62 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PtpreP49446 Snora75-201ENSMUST00000082903 133 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PtpreP49446 Mir876-201ENSMUST00000104659 81 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PtpreP49446 Gm22039-201ENSMUST00000157278 132 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
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