Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Vmn1r14-205ENSMUST00000227884 7542 ntAPPRIS P2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Hoxd11P23813 Gm24177-201ENSMUST00000158927 131 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Hoxd11P23813 Mir7683-201ENSMUST00000183842 61 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Hoxd11P23813 Mir7225-201ENSMUST00000184178 54 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Hoxd11P23813 Gm43512-201ENSMUST00000198495 176 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Hoxd11P23813 Gm22298-201ENSMUST00000082662 133 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Hoxd11P23813 Mir200b-201ENSMUST00000083615 70 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Hoxd11P23813 Gm18337-201ENSMUST00000219023 5762 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Hoxd11P23813 Gm25040-201ENSMUST00000103877 66 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Hoxd11P23813 Gm15536-201ENSMUST00000121411 114 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Hoxd11P23813 Mir1949-201ENSMUST00000157434 141 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Hoxd11P23813 Gm26297-201ENSMUST00000179464 132 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Hoxd11P23813 Gm27893-201ENSMUST00000184408 194 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Hoxd11P23813 Mir300-201ENSMUST00000083485 79 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Hoxd11P23813 Skint5-202ENSMUST00000169631 4497 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
Hoxd11P23813 Obscn-201ENSMUST00000020732 23483 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Hoxd11P23813 Gm42993-201ENSMUST00000196856 7325 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Hoxd11P23813 Gm24194-201ENSMUST00000116805 90 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Hoxd11P23813 Gm23106-201ENSMUST00000157554 101 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Hoxd11P23813 Mir125b-1-201ENSMUST00000175613 77 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Hoxd11P23813 Mir468-201ENSMUST00000197332 78 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Hoxd11P23813 AC168266.1-201ENSMUST00000216024 226 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Hoxd11P23813 Gm5239-201ENSMUST00000081864 369 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Hoxd11P23813 Gm22652-201ENSMUST00000083207 131 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Hoxd11P23813 Mir26a-1-201ENSMUST00000083579 90 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Hoxd11P23813 Olfr843-202ENSMUST00000214019 7499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Hoxd11P23813 4932415D10Rik-202ENSMUST00000217661 15111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
Hoxd11P23813 Gm24075-201ENSMUST00000158175 72 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Hoxd11P23813 Gm25368-201ENSMUST00000158847 131 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Hoxd11P23813 Gm44408-201ENSMUST00000200205 66 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Hoxd11P23813 Gm26227-201ENSMUST00000082510 101 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Hoxd11P23813 Mir127-201ENSMUST00000093568 70 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Hoxd11P23813 Ptprz1-201ENSMUST00000090568 8068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
Hoxd11P23813 Gm26145-201ENSMUST00000104476 127 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Hoxd11P23813 Gm24651-201ENSMUST00000157107 107 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Hoxd11P23813 Gm25994-201ENSMUST00000175392 101 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Hoxd11P23813 Gm23125-201ENSMUST00000157651 106 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Hoxd11P23813 Zfp72-202ENSMUST00000223163 4153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Hoxd11P23813 Gm43484-201ENSMUST00000198333 5966 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Hoxd11P23813 Gm24210-201ENSMUST00000158263 133 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Hoxd11P23813 CAAA01090905.1-201ENSMUST00000219056 426 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Hoxd11P23813 Nebl-202ENSMUST00000124270 8079 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Hoxd11P23813 Mir3070b-201ENSMUST00000175205 89 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Hoxd11P23813 Gm27717-201ENSMUST00000183933 151 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Hoxd11P23813 Gm23172-201ENSMUST00000157160 124 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Hoxd11P23813 AC127578.1-201ENSMUST00000227289 93 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Hoxd11P23813 Erbb4-201ENSMUST00000119142 11782 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Hoxd11P23813 Lyst-201ENSMUST00000110559 13181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd11P23813 Gm25528-201ENSMUST00000180264 132 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd11P23813 Gm37575-201ENSMUST00000195467 309 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd11P23813 Gm44211-201ENSMUST00000204867 145 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd11P23813 Gm45654-201ENSMUST00000210980 123 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd11P23813 n-R5s176-201ENSMUST00000082683 109 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd11P23813 Neb-202ENSMUST00000036934 22489 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Hoxd11P23813 Gm8995-201ENSMUST00000184842 7280 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Hoxd11P23813 Chl1-201ENSMUST00000066905 7562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Hoxd11P23813 Gm27263-201ENSMUST00000184760 76 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Hoxd11P23813 n-TSaga9-201ENSMUST00000197675 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Hoxd11P23813 Gm26494-201ENSMUST00000083154 143 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Hoxd11P23813 Gm24493-201ENSMUST00000083805 143 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Hoxd11P23813 Vmn1r216-203ENSMUST00000228389 10213 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Hoxd11P23813 Mga-204ENSMUST00000110774 13931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Hoxd11P23813 Gm14443-201ENSMUST00000109054 4516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Hoxd11P23813 Pkhd1l1-203ENSMUST00000209244 12949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Hoxd11P23813 Csmd3-201ENSMUST00000100670 13022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Hoxd11P23813 Gm22466-201ENSMUST00000175278 69 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Hoxd11P23813 Mir6342-201ENSMUST00000183870 125 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Hoxd11P23813 Dnah12-201ENSMUST00000022433 12009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Hoxd11P23813 Vmn1r80-202ENSMUST00000227205 10892 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Hoxd11P23813 Vmn1r46-202ENSMUST00000205088 10770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Hoxd11P23813 Dnah7a-201ENSMUST00000094964 12245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Hoxd11P23813 Traj24-201ENSMUST00000103717 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Hoxd11P23813 n-R5s96-201ENSMUST00000082574 124 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Hoxd11P23813 Rab27b-203ENSMUST00000121693 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Hoxd11P23813 Gm23010-201ENSMUST00000104151 126 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Hoxd11P23813 Mir1961-201ENSMUST00000158643 112 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Hoxd11P23813 Mir322-201ENSMUST00000083484 95 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Hoxd11P23813 Syne2-201ENSMUST00000044217 21690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Hoxd11P23813 Gm23708-201ENSMUST00000104367 123 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Hoxd11P23813 Gm24067-201ENSMUST00000104514 85 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Hoxd11P23813 Gm25055-201ENSMUST00000157369 76 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Hoxd11P23813 Gm24930-201ENSMUST00000158315 83 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Hoxd11P23813 Mir7013-201ENSMUST00000183540 72 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Hoxd11P23813 9230110F11Rik-202ENSMUST00000212907 191 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Hoxd11P23813 Mir324-201ENSMUST00000083600 89 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Hoxd11P23813 Pde1a-206ENSMUST00000102655 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Hoxd11P23813 Gm13065-201ENSMUST00000119178 141 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd11P23813 Gm28030-201ENSMUST00000184987 138 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd11P23813 Mir377-201ENSMUST00000083504 68 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd11P23813 Zfp518a-201ENSMUST00000050092 6840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd11P23813 Traj39-201ENSMUST00000103703 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd11P23813 Gm24372-201ENSMUST00000104400 110 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd11P23813 Gm23322-201ENSMUST00000104464 167 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd11P23813 Mir1933-201ENSMUST00000158930 88 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd11P23813 Gm23419-201ENSMUST00000175523 84 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd11P23813 Mir6997-201ENSMUST00000184313 71 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd11P23813 Vmn1r81-205ENSMUST00000228764 13763 ntAPPRIS P2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd11P23813 Gm24898-201ENSMUST00000158133 106 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd11P23813 Snord14a-201ENSMUST00000082807 87 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd11P23813 Mir28a-201ENSMUST00000083560 86 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
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