Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm22505-201ENSMUST00000082956 108 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Ccl20O89093 Gm22363-201ENSMUST00000083100 108 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Ccl20O89093 Gm23814-201ENSMUST00000083230 102 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Ccl20O89093 Gm23012-201ENSMUST00000104149 83 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Ccl20O89093 Mir467g-201ENSMUST00000116906 120 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Ccl20O89093 Gm22708-201ENSMUST00000158987 103 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Ccl20O89093 Mir6985-201ENSMUST00000184641 61 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Ccl20O89093 Traj49-202ENSMUST00000199452 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
Ccl20O89093 Mir1197-201ENSMUST00000117037 120 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Ccl20O89093 Gm24141-201ENSMUST00000122776 115 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Ccl20O89093 Gm24649-201ENSMUST00000157106 134 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Ccl20O89093 Gm24399-201ENSMUST00000157869 74 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Ccl20O89093 Gm22089-201ENSMUST00000158336 102 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Ccl20O89093 Gm26007-201ENSMUST00000158798 120 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Ccl20O89093 Gm43907-201ENSMUST00000203128 117 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Ccl20O89093 Gm22509-201ENSMUST00000082775 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Ccl20O89093 Gm25943-201ENSMUST00000103791 90 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Ccl20O89093 Mir466b-7-201ENSMUST00000103804 88 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Ccl20O89093 Mir466b-5-201ENSMUST00000103900 88 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Ccl20O89093 Gm24288-201ENSMUST00000157630 144 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Ccl20O89093 Gm24686-201ENSMUST00000157755 93 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Ccl20O89093 Gm22966-201ENSMUST00000157957 129 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Ccl20O89093 Gm25366-201ENSMUST00000158845 124 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Ccl20O89093 Mir466b-4-201ENSMUST00000178801 90 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Ccl20O89093 Gm25285-201ENSMUST00000178951 90 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Ccl20O89093 Mir466b-6-201ENSMUST00000180061 90 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Ccl20O89093 Mir466c-2-201ENSMUST00000180211 90 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Ccl20O89093 Mir219b-201ENSMUST00000198317 65 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Ccl20O89093 Gm22772-201ENSMUST00000104451 121 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Ccl20O89093 Gm24717-201ENSMUST00000157522 124 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Ccl20O89093 Gm23900-201ENSMUST00000157569 108 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Ccl20O89093 Gm45492-201ENSMUST00000211611 288 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Ccl20O89093 Mir410-201ENSMUST00000083563 81 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Ccl20O89093 Gm25756-201ENSMUST00000103990 136 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm24796-201ENSMUST00000104007 107 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm26018-201ENSMUST00000104406 128 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Snord2-201ENSMUST00000157899 69 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm23159-201ENSMUST00000175088 77 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Ranbp2-ps1-201ENSMUST00000184001 403 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Mir7116-201ENSMUST00000195956 70 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm25635-201ENSMUST00000082675 131 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm24648-201ENSMUST00000157111 132 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm26133-201ENSMUST00000157363 100 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm23065-201ENSMUST00000158236 130 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm26712-201ENSMUST00000180813 217 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Mir3065-201ENSMUST00000198674 87 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm44328-201ENSMUST00000199331 75 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm22813-201ENSMUST00000199948 123 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 n-R5s42-201ENSMUST00000082697 104 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Mir382-201ENSMUST00000083494 76 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm24449-201ENSMUST00000083985 106 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm23126-201ENSMUST00000104260 134 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm23986-201ENSMUST00000157144 63 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm22349-201ENSMUST00000157864 107 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm25014-201ENSMUST00000158401 103 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm22431-201ENSMUST00000158545 107 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm22638-201ENSMUST00000179674 107 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 mt-Atp8-201ENSMUST00000082407 204 ntAPPRIS P1 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm24842-201ENSMUST00000158681 54 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm22775-201ENSMUST00000177630 120 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm23569-201ENSMUST00000180120 120 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm27980-201ENSMUST00000184094 169 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm22681-201ENSMUST00000083853 106 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm25328-201ENSMUST00000175013 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm23291-201ENSMUST00000175611 78 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm37750-201ENSMUST00000193563 129 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm23239-201ENSMUST00000083006 181 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Mir344-201ENSMUST00000083634 95 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 AC154506.4-201ENSMUST00000224898 3416 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Traj9-201ENSMUST00000103731 58 ntAPPRIS P1 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm22196-201ENSMUST00000116865 109 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Mup-ps5-201ENSMUST00000118667 99 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm25623-201ENSMUST00000157216 108 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm23601-201ENSMUST00000157259 131 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm22838-201ENSMUST00000158437 99 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm23384-201ENSMUST00000158593 103 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm27851-201ENSMUST00000183529 63 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Mir6896-201ENSMUST00000198033 73 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Mir327-201ENSMUST00000199328 69 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm26062-201ENSMUST00000083379 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm24379-201ENSMUST00000122695 86 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm25160-201ENSMUST00000158914 102 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm22503-201ENSMUST00000158983 115 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm27928-201ENSMUST00000183747 256 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm29432-201ENSMUST00000185397 139 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm25401-201ENSMUST00000082975 106 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm23722-201ENSMUST00000083002 130 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Mir142b-201ENSMUST00000083486 115 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Snord80-201ENSMUST00000083801 81 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Ccl20O89093 Gm24263-201ENSMUST00000104059 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Ccl20O89093 Gm25055-201ENSMUST00000157369 76 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Ccl20O89093 Gm22336-201ENSMUST00000157719 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Ccl20O89093 Gm26210-201ENSMUST00000158680 91 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Ccl20O89093 Mir344-2-201ENSMUST00000175446 80 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Ccl20O89093 Gm26498-201ENSMUST00000177799 79 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Ccl20O89093 Gm25618-201ENSMUST00000179484 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Ccl20O89093 Gm26230-201ENSMUST00000180141 79 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Ccl20O89093 AC125190.3-201ENSMUST00000223224 121 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Ccl20O89093 Gm26395-201ENSMUST00000104094 132 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Ccl20O89093 Gm22100-201ENSMUST00000157926 63 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
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