Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1I1

Gm3893, Predicted gene 3893, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3893E9Q1I1 Mir362-201ENSMUST00000093592 65 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Gm3893E9Q1I1 Fam46d-201ENSMUST00000101292 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
Gm3893E9Q1I1 Gm26369-201ENSMUST00000157825 100 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Gm3893E9Q1I1 Gm22070-201ENSMUST00000178475 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Gm3893E9Q1I1 Gm37796-201ENSMUST00000195327 134 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Gm3893E9Q1I1 Gm42844-201ENSMUST00000200355 112 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Gm3893E9Q1I1 Gm24920-201ENSMUST00000083018 85 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Gm3893E9Q1I1 Mir466-201ENSMUST00000093591 73 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Gm3893E9Q1I1 Mir1a-1-201ENSMUST00000093635 77 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Gm3893E9Q1I1 Gm5581-201ENSMUST00000072940 2550 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Gm3893E9Q1I1 Gm25416-201ENSMUST00000104221 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Gm3893E9Q1I1 Gm22319-201ENSMUST00000157147 122 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Gm3893E9Q1I1 Gm25887-201ENSMUST00000157777 84 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Gm3893E9Q1I1 Gm25600-201ENSMUST00000158357 106 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Gm3893E9Q1I1 Mir100-201ENSMUST00000175270 80 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Gm3893E9Q1I1 Gm24323-201ENSMUST00000175342 77 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Gm3893E9Q1I1 Gm25693-201ENSMUST00000175443 85 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Gm3893E9Q1I1 Gm22055-201ENSMUST00000083388 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Gm3893E9Q1I1 Gm22828-201ENSMUST00000083768 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Gm3893E9Q1I1 Gm23203-201ENSMUST00000104374 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Gm3893E9Q1I1 Gm11694-201ENSMUST00000118637 159 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Gm3893E9Q1I1 Gm24947-201ENSMUST00000158334 110 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Gm3893E9Q1I1 Gm24129-201ENSMUST00000158537 97 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Gm3893E9Q1I1 Gm25978-201ENSMUST00000158698 90 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Gm3893E9Q1I1 Gm24524-201ENSMUST00000082925 170 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Gm3893E9Q1I1 Gm26054-201ENSMUST00000083037 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Gm3893E9Q1I1 Mir101a-201ENSMUST00000083517 83 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Gm3893E9Q1I1 Gm24492-201ENSMUST00000083798 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Gm3893E9Q1I1 Gm22689-201ENSMUST00000102452 110 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm22030-201ENSMUST00000116942 63 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm23989-201ENSMUST00000117030 66 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm24290-201ENSMUST00000157634 96 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Mir219b-201ENSMUST00000198317 65 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Traj49-202ENSMUST00000199452 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.83□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm24148-201ENSMUST00000082762 80 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Mir377-201ENSMUST00000083504 68 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Snord80-201ENSMUST00000083801 81 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm23065-201ENSMUST00000158236 130 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm24678-201ENSMUST00000158756 104 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Mir3070a-201ENSMUST00000175468 89 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm23482-201ENSMUST00000104172 122 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm24586-201ENSMUST00000116695 89 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm25753-201ENSMUST00000116792 121 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm22503-201ENSMUST00000158983 115 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm28435-201ENSMUST00000185496 108 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 AC211878.4-201ENSMUST00000220970 262 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Snord33-201ENSMUST00000083694 84 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm25684-201ENSMUST00000083941 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm23661-201ENSMUST00000122630 87 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm16265-201ENSMUST00000134558 108 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm22490-201ENSMUST00000157188 119 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm25370-201ENSMUST00000158159 94 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm25974-201ENSMUST00000158701 94 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm22509-201ENSMUST00000082775 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm25629-201ENSMUST00000084001 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm20386-201ENSMUST00000174010 132 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm25098-201ENSMUST00000177580 79 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm23356-201ENSMUST00000177610 79 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm24027-201ENSMUST00000177611 79 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm22511-201ENSMUST00000177628 79 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm22630-201ENSMUST00000177781 79 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm23560-201ENSMUST00000177782 79 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm25462-201ENSMUST00000177833 79 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm26059-201ENSMUST00000177865 79 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm22255-201ENSMUST00000177933 79 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm25146-201ENSMUST00000177976 79 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm25523-201ENSMUST00000178044 79 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm24585-201ENSMUST00000178104 79 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm22627-201ENSMUST00000178127 79 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm22912-201ENSMUST00000178242 79 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm24866-201ENSMUST00000178338 79 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm22524-201ENSMUST00000178357 79 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm25710-201ENSMUST00000178367 79 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm23575-201ENSMUST00000178406 79 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm24872-201ENSMUST00000178434 79 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm22449-201ENSMUST00000178924 79 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm24702-201ENSMUST00000178965 79 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm24206-201ENSMUST00000179011 79 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm24528-201ENSMUST00000179164 79 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm22909-201ENSMUST00000179190 79 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm26334-201ENSMUST00000179403 79 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm25463-201ENSMUST00000179405 79 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm25742-201ENSMUST00000179530 79 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm25209-201ENSMUST00000179576 79 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm26392-201ENSMUST00000179661 79 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm25230-201ENSMUST00000179740 79 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm26434-201ENSMUST00000179778 79 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm25741-201ENSMUST00000179825 79 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm24759-201ENSMUST00000179827 79 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm24219-201ENSMUST00000179861 79 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Mir6342-201ENSMUST00000183870 125 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm26202-201ENSMUST00000082910 65 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm23254-201ENSMUST00000097244 79 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm382-201ENSMUST00000096332 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.79□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm22469-201ENSMUST00000104118 133 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 n-R5s6-201ENSMUST00000122663 88 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm38113-201ENSMUST00000193704 201 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm43977-201ENSMUST00000203970 189 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Mir7-1-201ENSMUST00000083500 108 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Gm3893E9Q1I1 Gm23321-201ENSMUST00000104465 126 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 150.4 ms