Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Gm23947-201ENSMUST00000093636 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Ccdc170D3YXL0 n-R5s39-201ENSMUST00000122613 108 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Ccdc170D3YXL0 Gm23314-201ENSMUST00000157218 107 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Ccdc170D3YXL0 Gm23278-201ENSMUST00000157911 143 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Ccdc170D3YXL0 Gm23337-201ENSMUST00000158959 118 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Ccdc170D3YXL0 Mir466b-1-201ENSMUST00000177988 82 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Ccdc170D3YXL0 Gm44375-201ENSMUST00000196657 150 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Ccdc170D3YXL0 Snord90-201ENSMUST00000104568 111 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
Ccdc170D3YXL0 Gm22337-201ENSMUST00000157721 132 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
Ccdc170D3YXL0 Gm26210-201ENSMUST00000158680 91 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
Ccdc170D3YXL0 Mir1966-201ENSMUST00000158807 108 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
Ccdc170D3YXL0 Gm24374-201ENSMUST00000104394 106 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Ccdc170D3YXL0 Gm11749-201ENSMUST00000127327 184 ntTSL 2 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
Ccdc170D3YXL0 Gm24718-201ENSMUST00000157521 136 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Ccdc170D3YXL0 Gm23260-201ENSMUST00000158317 172 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Ccdc170D3YXL0 Gm22699-201ENSMUST00000175376 105 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Ccdc170D3YXL0 AC125190.3-201ENSMUST00000223224 121 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Ccdc170D3YXL0 Gm24131-201ENSMUST00000158539 107 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
Ccdc170D3YXL0 Mir327-201ENSMUST00000199328 69 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
Ccdc170D3YXL0 Gm43907-201ENSMUST00000203128 117 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
Ccdc170D3YXL0 Gm25797-201ENSMUST00000082640 107 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
Ccdc170D3YXL0 Traj35-201ENSMUST00000103706 65 ntAPPRIS P1 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
Ccdc170D3YXL0 Gm23209-201ENSMUST00000158667 110 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
Ccdc170D3YXL0 Gm38295-201ENSMUST00000191951 151 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
Ccdc170D3YXL0 Traj38-201ENSMUST00000103704 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
Ccdc170D3YXL0 Gm25680-201ENSMUST00000116917 126 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
Ccdc170D3YXL0 Gm22635-201ENSMUST00000116962 126 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
Ccdc170D3YXL0 Gm22340-201ENSMUST00000157717 114 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
Ccdc170D3YXL0 Gm23180-201ENSMUST00000158686 125 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
Ccdc170D3YXL0 Gm26007-201ENSMUST00000158798 120 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
Ccdc170D3YXL0 Gm23504-201ENSMUST00000158988 95 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
Ccdc170D3YXL0 Gm17677-201ENSMUST00000166746 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.51□□□□□ -2.49
Ccdc170D3YXL0 Gm26091-201ENSMUST00000122704 82 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
Ccdc170D3YXL0 Snord2-201ENSMUST00000157899 69 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
Ccdc170D3YXL0 Mir6915-201ENSMUST00000198839 69 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
Ccdc170D3YXL0 AL845349.1-201ENSMUST00000213794 78 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
Ccdc170D3YXL0 Mir802-201ENSMUST00000103258 97 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
Ccdc170D3YXL0 Mir669f-201ENSMUST00000103850 121 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
Ccdc170D3YXL0 Gm26133-201ENSMUST00000157363 100 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
Ccdc170D3YXL0 Gm25716-201ENSMUST00000158628 104 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
Ccdc170D3YXL0 Gm25899-201ENSMUST00000082672 141 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
Ccdc170D3YXL0 Traj9-201ENSMUST00000103731 58 ntAPPRIS P1 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
Ccdc170D3YXL0 Gm25060-201ENSMUST00000157374 130 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
Ccdc170D3YXL0 Gm23900-201ENSMUST00000157569 108 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
Ccdc170D3YXL0 Mir344-2-201ENSMUST00000175446 80 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
Ccdc170D3YXL0 Gm6607-201ENSMUST00000215035 328 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
Ccdc170D3YXL0 Gm23442-201ENSMUST00000082919 134 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
Ccdc170D3YXL0 Mir145a-201ENSMUST00000083658 70 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
Ccdc170D3YXL0 Mir487b-201ENSMUST00000102265 82 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Ccdc170D3YXL0 Gm22451-201ENSMUST00000122803 151 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Ccdc170D3YXL0 Gm24648-201ENSMUST00000157111 132 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Ccdc170D3YXL0 Gm26084-201ENSMUST00000157903 104 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Ccdc170D3YXL0 Gm22607-201ENSMUST00000158291 105 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Ccdc170D3YXL0 Gm24461-201ENSMUST00000082735 103 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Ccdc170D3YXL0 Gm23749-201ENSMUST00000104223 131 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Ccdc170D3YXL0 Gm24587-201ENSMUST00000116697 89 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Ccdc170D3YXL0 Gm14947-201ENSMUST00000133704 303 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Ccdc170D3YXL0 Gm25885-201ENSMUST00000157779 109 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Ccdc170D3YXL0 Gm25599-201ENSMUST00000157816 103 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Ccdc170D3YXL0 Gm24843-201ENSMUST00000158682 76 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Ccdc170D3YXL0 Gm25328-201ENSMUST00000175013 107 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Ccdc170D3YXL0 AC126939.1-201ENSMUST00000224943 226 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Ccdc170D3YXL0 Gm25160-201ENSMUST00000158914 102 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
Ccdc170D3YXL0 Gm17528-201ENSMUST00000171026 239 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
Ccdc170D3YXL0 Gm25032-201ENSMUST00000175411 84 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
Ccdc170D3YXL0 Traj49-202ENSMUST00000199452 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
Ccdc170D3YXL0 mt-Ts2-201ENSMUST00000082416 59 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
Ccdc170D3YXL0 Ighv15-1-201ENSMUST00000194450 276 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Ccdc170D3YXL0 Gm24868-201ENSMUST00000157265 136 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Ccdc170D3YXL0 Gm24913-201ENSMUST00000157286 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Ccdc170D3YXL0 Gm24077-201ENSMUST00000158183 136 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Ccdc170D3YXL0 Gm25367-201ENSMUST00000158846 106 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Ccdc170D3YXL0 Mir5124a-201ENSMUST00000175528 72 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Ccdc170D3YXL0 Gm23291-201ENSMUST00000175611 78 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Ccdc170D3YXL0 Olfr880-ps1-201ENSMUST00000212344 229 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Ccdc170D3YXL0 Gm26062-201ENSMUST00000083379 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Ccdc170D3YXL0 Gm26369-201ENSMUST00000157825 100 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Ccdc170D3YXL0 Gm22542-201ENSMUST00000158166 95 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Ccdc170D3YXL0 Gm26092-201ENSMUST00000179798 97 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Ccdc170D3YXL0 Mir669a-1-201ENSMUST00000180238 97 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Ccdc170D3YXL0 Gm27694-201ENSMUST00000184740 86 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Ccdc170D3YXL0 Gm37746-201ENSMUST00000193249 198 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Ccdc170D3YXL0 Snora16a-202ENSMUST00000196061 137 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Ccdc170D3YXL0 Gm25091-201ENSMUST00000103997 71 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Ccdc170D3YXL0 Gm22048-201ENSMUST00000104721 89 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Ccdc170D3YXL0 Mir466h-201ENSMUST00000104748 81 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Ccdc170D3YXL0 Scgb1b23-ps-201ENSMUST00000116009 252 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Ccdc170D3YXL0 Gm24399-201ENSMUST00000157869 74 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Ccdc170D3YXL0 Gm25014-201ENSMUST00000158401 103 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Ccdc170D3YXL0 Gm26712-201ENSMUST00000180813 217 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Ccdc170D3YXL0 Gm25802-201ENSMUST00000082639 77 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Ccdc170D3YXL0 Gm24457-201ENSMUST00000083196 105 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Ccdc170D3YXL0 Gm26081-201ENSMUST00000104068 132 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Ccdc170D3YXL0 Gm23990-201ENSMUST00000117031 117 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Ccdc170D3YXL0 Gm24686-201ENSMUST00000157755 93 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Ccdc170D3YXL0 Mir7038-201ENSMUST00000184833 71 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Ccdc170D3YXL0 Mir183-201ENSMUST00000083685 70 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Ccdc170D3YXL0 Gm23986-201ENSMUST00000157144 63 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Ccdc170D3YXL0 Mir669j-201ENSMUST00000179023 121 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Ccdc170D3YXL0 Gm24649-201ENSMUST00000157106 134 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
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