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Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9
Opn4, Melanopsin, mouse
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (Experimental data)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
Opn4
Q9QXZ9
1700112D23Rik-202
ENSMUST00000193387
299 nt
TSL 2
BASIC
0.8
□□□□□ -2.28
Opn4
Q9QXZ9
AC126939.1-201
ENSMUST00000224943
226 nt
BASIC
0.8
□□□□□ -2.28
Opn4
Q9QXZ9
AC159093.2-201
ENSMUST00000227881
297 nt
BASIC
0.8
□□□□□ -2.28
Opn4
Q9QXZ9
mt-Ts2-201
ENSMUST00000082416
59 nt
BASIC
0.8
□□□□□ -2.28
Opn4
Q9QXZ9
Gm23347-201
ENSMUST00000083823
82 nt
BASIC
0.8
□□□□□ -2.28
Opn4
Q9QXZ9
Gm22786-201
ENSMUST00000104086
122 nt
BASIC
0.79
□□□□□ -2.28
Opn4
Q9QXZ9
Gm24842-201
ENSMUST00000158681
54 nt
BASIC
0.79
□□□□□ -2.28
Opn4
Q9QXZ9
Gm23008-201
ENSMUST00000158946
80 nt
BASIC
0.79
□□□□□ -2.28
Opn4
Q9QXZ9
Gm22708-201
ENSMUST00000158987
103 nt
BASIC
0.79
□□□□□ -2.28
Opn4
Q9QXZ9
Mir3109-201
ENSMUST00000175301
88 nt
BASIC
0.79
□□□□□ -2.28
Opn4
Q9QXZ9
Gm23966-201
ENSMUST00000179823
107 nt
BASIC
0.79
□□□□□ -2.28
Opn4
Q9QXZ9
Gm44469-201
ENSMUST00000198558
79 nt
BASIC
0.79
□□□□□ -2.28
Opn4
Q9QXZ9
Gm44488-201
ENSMUST00000199467
119 nt
BASIC
0.79
□□□□□ -2.28
Opn4
Q9QXZ9
Gm43944-201
ENSMUST00000205220
120 nt
BASIC
0.79
□□□□□ -2.28
Opn4
Q9QXZ9
Mir1191-201
ENSMUST00000116883
120 nt
BASIC
0.78
□□□□□ -2.28
Opn4
Q9QXZ9
n-R5s39-201
ENSMUST00000122613
108 nt
BASIC
0.78
□□□□□ -2.28
Opn4
Q9QXZ9
Gm24549-201
ENSMUST00000158647
139 nt
BASIC
0.78
□□□□□ -2.28
Opn4
Q9QXZ9
Gm24223-201
ENSMUST00000158827
90 nt
BASIC
0.78
□□□□□ -2.28
Opn4
Q9QXZ9
Gm44560-201
ENSMUST00000207816
3115 nt
BASIC
0.77
□□□□□ -2.29
Opn4
Q9QXZ9
Scgb1b23-ps-201
ENSMUST00000116009
252 nt
BASIC
0.77
□□□□□ -2.29
Opn4
Q9QXZ9
Gm12469-201
ENSMUST00000117623
207 nt
BASIC
0.77
□□□□□ -2.29
Opn4
Q9QXZ9
Gm24678-201
ENSMUST00000158756
104 nt
BASIC
0.77
□□□□□ -2.29
Opn4
Q9QXZ9
Gm23917-201
ENSMUST00000175256
98 nt
BASIC
0.77
□□□□□ -2.29
Opn4
Q9QXZ9
Gm26498-201
ENSMUST00000177799
79 nt
BASIC
0.77
□□□□□ -2.29
Opn4
Q9QXZ9
Gm26230-201
ENSMUST00000180141
79 nt
BASIC
0.77
□□□□□ -2.29
Opn4
Q9QXZ9
Mir21c-201
ENSMUST00000184910
78 nt
BASIC
0.77
□□□□□ -2.29
Opn4
Q9QXZ9
Gm25920-201
ENSMUST00000158307
99 nt
BASIC
0.76
□□□□□ -2.29
Opn4
Q9QXZ9
Gm38113-201
ENSMUST00000193704
201 nt
BASIC
0.76
□□□□□ -2.29
Opn4
Q9QXZ9
AC116319.1-201
ENSMUST00000227765
222 nt
BASIC
0.76
□□□□□ -2.29
Opn4
Q9QXZ9
Gm23140-201
ENSMUST00000082487
107 nt
BASIC
0.76
□□□□□ -2.29
Opn4
Q9QXZ9
Gm22558-201
ENSMUST00000157326
95 nt
BASIC
0.75
□□□□□ -2.29
Opn4
Q9QXZ9
Gm23044-201
ENSMUST00000157891
100 nt
BASIC
0.75
□□□□□ -2.29
Opn4
Q9QXZ9
Gm23857-201
ENSMUST00000158379
111 nt
BASIC
0.75
□□□□□ -2.29
Opn4
Q9QXZ9
Gm24500-201
ENSMUST00000158447
124 nt
BASIC
0.75
□□□□□ -2.29
Opn4
Q9QXZ9
Gm26158-201
ENSMUST00000158973
119 nt
BASIC
0.75
□□□□□ -2.29
Opn4
Q9QXZ9
Snord33-201
ENSMUST00000083694
84 nt
BASIC
0.75
□□□□□ -2.29
Opn4
Q9QXZ9
Gm25378-201
ENSMUST00000104333
129 nt
BASIC
0.74
□□□□□ -2.29
Opn4
Q9QXZ9
Gm24649-201
ENSMUST00000157106
134 nt
BASIC
0.74
□□□□□ -2.29
Opn4
Q9QXZ9
Scarna3a-201
ENSMUST00000158911
140 nt
BASIC
0.74
□□□□□ -2.29
Opn4
Q9QXZ9
Gm25138-201
ENSMUST00000083248
136 nt
BASIC
0.74
□□□□□ -2.29
Opn4
Q9QXZ9
Gm23138-201
ENSMUST00000083365
103 nt
BASIC
0.74
□□□□□ -2.29
Opn4
Q9QXZ9
Gm22196-201
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109 nt
BASIC
0.73
□□□□□ -2.29
Opn4
Q9QXZ9
Gm23989-201
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66 nt
BASIC
0.73
□□□□□ -2.29
Opn4
Q9QXZ9
Gm23434-201
ENSMUST00000157179
100 nt
BASIC
0.73
□□□□□ -2.29
Opn4
Q9QXZ9
Gm24129-201
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97 nt
BASIC
0.73
□□□□□ -2.29
Opn4
Q9QXZ9
Gm26290-201
ENSMUST00000158891
145 nt
BASIC
0.73
□□□□□ -2.29
Opn4
Q9QXZ9
Gm24323-201
ENSMUST00000175342
77 nt
BASIC
0.73
□□□□□ -2.29
Opn4
Q9QXZ9
Gm44211-201
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145 nt
BASIC
0.73
□□□□□ -2.29
Opn4
Q9QXZ9
AC124687.1-201
ENSMUST00000221868
189 nt
BASIC
0.73
□□□□□ -2.29
Opn4
Q9QXZ9
Defb38-201
ENSMUST00000066416
286 nt
APPRIS P1
TSL 1 (best)
BASIC
0.73
□□□□□ -2.29
Opn4
Q9QXZ9
Gm23301-201
ENSMUST00000082713
65 nt
BASIC
0.73
□□□□□ -2.29
Opn4
Q9QXZ9
Gm25812-201
ENSMUST00000082751
103 nt
BASIC
0.73
□□□□□ -2.29
Opn4
Q9QXZ9
Gm22772-201
ENSMUST00000104451
121 nt
BASIC
0.72
□□□□□ -2.29
Opn4
Q9QXZ9
Gm23654-201
ENSMUST00000116758
126 nt
BASIC
0.72
□□□□□ -2.29
Opn4
Q9QXZ9
Gm23735-201
ENSMUST00000082551
134 nt
BASIC
0.72
□□□□□ -2.29
Opn4
Q9QXZ9
Gm22469-201
ENSMUST00000104118
133 nt
BASIC
0.71
□□□□□ -2.3
Opn4
Q9QXZ9
B230307C23Rik-201
ENSMUST00000113729
192 nt
TSL 5
BASIC
0.71
□□□□□ -2.3
Opn4
Q9QXZ9
Gm23601-201
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131 nt
BASIC
0.71
□□□□□ -2.3
Opn4
Q9QXZ9
Gm24916-201
ENSMUST00000157287
79 nt
BASIC
0.71
□□□□□ -2.3
Opn4
Q9QXZ9
Gm22089-201
ENSMUST00000158336
102 nt
BASIC
0.71
□□□□□ -2.3
Opn4
Q9QXZ9
Gm22638-201
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107 nt
BASIC
0.71
□□□□□ -2.3
Opn4
Q9QXZ9
Gm28435-201
ENSMUST00000185496
108 nt
BASIC
0.71
□□□□□ -2.3
Opn4
Q9QXZ9
Mir377-201
ENSMUST00000083504
68 nt
BASIC
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□□□□□ -2.3
Opn4
Q9QXZ9
Gm22689-201
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110 nt
BASIC
0.7
□□□□□ -2.3
Opn4
Q9QXZ9
Gm25416-201
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107 nt
BASIC
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□□□□□ -2.3
Opn4
Q9QXZ9
Gm25787-201
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92 nt
BASIC
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□□□□□ -2.3
Opn4
Q9QXZ9
Gm25680-201
ENSMUST00000116917
126 nt
BASIC
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□□□□□ -2.3
Opn4
Q9QXZ9
Gm22635-201
ENSMUST00000116962
126 nt
BASIC
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□□□□□ -2.3
Opn4
Q9QXZ9
Gm23416-201
ENSMUST00000175520
95 nt
BASIC
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□□□□□ -2.3
Opn4
Q9QXZ9
Gm24926-201
ENSMUST00000178053
79 nt
BASIC
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□□□□□ -2.3
Opn4
Q9QXZ9
Gm22632-201
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79 nt
BASIC
0.7
□□□□□ -2.3
Opn4
Q9QXZ9
Gm26202-201
ENSMUST00000082910
65 nt
BASIC
0.7
□□□□□ -2.3
Opn4
Q9QXZ9
Gm25629-201
ENSMUST00000084001
107 nt
BASIC
0.7
□□□□□ -2.3
Opn4
Q9QXZ9
Gm6985-201
ENSMUST00000121255
271 nt
BASIC
0.69
□□□□□ -2.3
Opn4
Q9QXZ9
Gm22030-201
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63 nt
BASIC
0.68
□□□□□ -2.3
Opn4
Q9QXZ9
n-R5s6-201
ENSMUST00000122663
88 nt
BASIC
0.68
□□□□□ -2.3
Opn4
Q9QXZ9
Gm24288-201
ENSMUST00000157630
144 nt
BASIC
0.68
□□□□□ -2.3
Opn4
Q9QXZ9
Gm25600-201
ENSMUST00000158357
106 nt
BASIC
0.68
□□□□□ -2.3
Opn4
Q9QXZ9
Mir100-201
ENSMUST00000175270
80 nt
BASIC
0.68
□□□□□ -2.3
Opn4
Q9QXZ9
Mir3070a-201
ENSMUST00000175468
89 nt
BASIC
0.68
□□□□□ -2.3
Opn4
Q9QXZ9
Gm23507-201
ENSMUST00000083078
107 nt
BASIC
0.68
□□□□□ -2.3
Opn4
Q9QXZ9
Gm5581-201
ENSMUST00000072940
2550 nt
BASIC
0.67
□□□□□ -2.3
Opn4
Q9QXZ9
Gm24579-201
ENSMUST00000103964
144 nt
BASIC
0.67
□□□□□ -2.3
Opn4
Q9QXZ9
Gm22541-201
ENSMUST00000158165
127 nt
BASIC
0.67
□□□□□ -2.3
Opn4
Q9QXZ9
Gm22522-201
ENSMUST00000158271
151 nt
BASIC
0.67
□□□□□ -2.3
Opn4
Q9QXZ9
mt-Tm-201
ENSMUST00000082395
69 nt
BASIC
0.67
□□□□□ -2.3
Opn4
Q9QXZ9
n-R5s96-201
ENSMUST00000082574
124 nt
BASIC
0.67
□□□□□ -2.3
Opn4
Q9QXZ9
Gm8251-201
ENSMUST00000168641
5985 nt
APPRIS P1
BASIC
0.66
□□□□□ -2.3
Opn4
Q9QXZ9
Snord78-201
ENSMUST00000104032
66 nt
BASIC
0.66
□□□□□ -2.3
Opn4
Q9QXZ9
Gm24894-201
ENSMUST00000122744
118 nt
BASIC
0.66
□□□□□ -2.3
Opn4
Q9QXZ9
Gm25974-201
ENSMUST00000158701
94 nt
BASIC
0.66
□□□□□ -2.3
Opn4
Q9QXZ9
Mir7010-201
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63 nt
BASIC
0.66
□□□□□ -2.3
Opn4
Q9QXZ9
Mir7079-201
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69 nt
BASIC
0.66
□□□□□ -2.3
Opn4
Q9QXZ9
Mir216a-201
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72 nt
BASIC
0.66
□□□□□ -2.3
Opn4
Q9QXZ9
Gm13577-201
ENSMUST00000121365
205 nt
BASIC
0.65
□□□□□ -2.31
Opn4
Q9QXZ9
Gm16265-201
ENSMUST00000134558
108 nt
BASIC
0.65
□□□□□ -2.31
Opn4
Q9QXZ9
Gm23351-201
ENSMUST00000158427
125 nt
BASIC
0.65
□□□□□ -2.31
Opn4
Q9QXZ9
Gm25978-201
ENSMUST00000158698
90 nt
BASIC
0.65
□□□□□ -2.31
Opn4
Q9QXZ9
Gm25161-201
ENSMUST00000158913
132 nt
BASIC
0.65
□□□□□ -2.31
Opn4
Q9QXZ9
Gm25693-201
ENSMUST00000175443
85 nt
BASIC
0.65
□□□□□ -2.31
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