Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF1

Bco2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco2Q99NF1 Gm21954-201ENSMUST00000179544 51 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
Bco2Q99NF1 Mir7-1-201ENSMUST00000083500 108 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Bco2Q99NF1 Scarna9-201ENSMUST00000104318 70 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Bco2Q99NF1 Gm25787-201ENSMUST00000104709 92 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Bco2Q99NF1 Gm11857-201ENSMUST00000119817 324 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Bco2Q99NF1 Gm22213-201ENSMUST00000157564 119 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Bco2Q99NF1 Gm24947-201ENSMUST00000158334 110 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Bco2Q99NF1 Gm25715-201ENSMUST00000158627 125 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Bco2Q99NF1 Gm24575-201ENSMUST00000175502 77 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Bco2Q99NF1 Gm28398-201ENSMUST00000186587 166 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
Bco2Q99NF1 Gm29653-201ENSMUST00000187192 166 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
Bco2Q99NF1 Gm28810-201ENSMUST00000188173 166 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
Bco2Q99NF1 Gm28575-201ENSMUST00000188234 166 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
Bco2Q99NF1 Gm28132-201ENSMUST00000189901 166 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
Bco2Q99NF1 Gm29580-201ENSMUST00000189921 166 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
Bco2Q99NF1 Gm28858-201ENSMUST00000190517 166 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
Bco2Q99NF1 Gm28210-201ENSMUST00000190631 166 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
Bco2Q99NF1 Gm28336-201ENSMUST00000190743 166 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
Bco2Q99NF1 Gm29042-201ENSMUST00000191564 166 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
Bco2Q99NF1 AC153950.1-201ENSMUST00000219916 3238 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Bco2Q99NF1 Gm25128-201ENSMUST00000083339 76 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Bco2Q99NF1 Olfr820-203ENSMUST00000215791 3956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Bco2Q99NF1 Gm22004-201ENSMUST00000101884 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Bco2Q99NF1 Gm23601-201ENSMUST00000157259 131 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Bco2Q99NF1 Snord13-201ENSMUST00000157627 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Bco2Q99NF1 Mir1961-201ENSMUST00000158643 112 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Bco2Q99NF1 Gm25380-201ENSMUST00000175463 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Bco2Q99NF1 Gm24641-201ENSMUST00000178055 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Bco2Q99NF1 Gm25484-201ENSMUST00000178217 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Bco2Q99NF1 Gm26138-201ENSMUST00000179236 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Bco2Q99NF1 Gm22821-201ENSMUST00000179288 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Bco2Q99NF1 Mir7663-201ENSMUST00000183950 61 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Bco2Q99NF1 Gm28767-201ENSMUST00000188601 114 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Bco2Q99NF1 Gm44483-201ENSMUST00000197203 97 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Bco2Q99NF1 Gm42891-201ENSMUST00000199340 281 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Bco2Q99NF1 CT025630.1-201ENSMUST00000227901 172 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Bco2Q99NF1 Gm23298-201ENSMUST00000083181 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Bco2Q99NF1 Gm24614-201ENSMUST00000083269 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Bco2Q99NF1 Gm22057-201ENSMUST00000083387 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Bco2Q99NF1 Mir30c-2-201ENSMUST00000083633 84 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Bco2Q99NF1 Gm25516-201ENSMUST00000083857 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Bco2Q99NF1 Vmn1r75-202ENSMUST00000226622 6638 ntAPPRIS P2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Bco2Q99NF1 Olfr867-202ENSMUST00000212098 4228 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
Bco2Q99NF1 Gm23986-201ENSMUST00000157144 63 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Bco2Q99NF1 Gm25887-201ENSMUST00000157777 84 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Bco2Q99NF1 Gm24728-201ENSMUST00000158226 125 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Bco2Q99NF1 Gm23384-201ENSMUST00000158593 103 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Bco2Q99NF1 Gm22944-201ENSMUST00000158662 133 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Bco2Q99NF1 Mir324-201ENSMUST00000083600 89 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Bco2Q99NF1 Gm24271-201ENSMUST00000102327 111 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Bco2Q99NF1 Gm26421-201ENSMUST00000104279 132 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Bco2Q99NF1 Gm22862-201ENSMUST00000178593 121 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Bco2Q99NF1 Mir219a-2-201ENSMUST00000083551 97 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Bco2Q99NF1 AC127302.3-201ENSMUST00000215480 2791 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Bco2Q99NF1 n-R5s70-201ENSMUST00000122650 116 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Bco2Q99NF1 Gm22233-201ENSMUST00000157464 114 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Bco2Q99NF1 Gm25868-201ENSMUST00000158253 114 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Bco2Q99NF1 Trbv25-201ENSMUST00000194700 273 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Bco2Q99NF1 Gm25851-201ENSMUST00000082794 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Bco2Q99NF1 Snora2b-201ENSMUST00000084005 137 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Bco2Q99NF1 Mir709-201ENSMUST00000102190 88 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Bco2Q99NF1 Gm23130-201ENSMUST00000104252 74 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Bco2Q99NF1 Gm22089-201ENSMUST00000158336 102 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Bco2Q99NF1 Gm17172-201ENSMUST00000171782 190 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
Bco2Q99NF1 Gm26398-201ENSMUST00000179015 127 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Bco2Q99NF1 n-R5s157-201ENSMUST00000122543 121 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Bco2Q99NF1 Mir1899-201ENSMUST00000122798 96 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Bco2Q99NF1 Gm23351-201ENSMUST00000158427 125 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Bco2Q99NF1 Gm24877-201ENSMUST00000158779 116 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Bco2Q99NF1 Gm22801-201ENSMUST00000175624 84 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Bco2Q99NF1 AC160550.1-201ENSMUST00000228659 181 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Bco2Q99NF1 Gm23245-201ENSMUST00000083370 135 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Bco2Q99NF1 Snhg14-211ENSMUST00000189581 6861 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
Bco2Q99NF1 Mir802-201ENSMUST00000103258 97 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Bco2Q99NF1 Traj45-201ENSMUST00000103697 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Bco2Q99NF1 Gm22319-201ENSMUST00000157147 122 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Bco2Q99NF1 Gm22559-201ENSMUST00000157329 134 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Bco2Q99NF1 Gm22663-201ENSMUST00000158721 102 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Bco2Q99NF1 Gm25161-201ENSMUST00000158913 132 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Bco2Q99NF1 mt-Tv-201ENSMUST00000082389 69 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Bco2Q99NF1 Mir10b-201ENSMUST00000083566 68 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Bco2Q99NF1 Gm37998-201ENSMUST00000195699 166 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Bco2Q99NF1 Olfr865-ps1-201ENSMUST00000212071 85 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Bco2Q99NF1 Gm24865-201ENSMUST00000103246 96 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Bco2Q99NF1 Gm25506-201ENSMUST00000104339 70 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Bco2Q99NF1 Mir1191-201ENSMUST00000116883 120 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Bco2Q99NF1 Gm23991-201ENSMUST00000117033 93 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Bco2Q99NF1 Gm22515-201ENSMUST00000158273 305 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Bco2Q99NF1 Gm24547-201ENSMUST00000158649 149 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Bco2Q99NF1 Gm24223-201ENSMUST00000158827 90 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Bco2Q99NF1 Gm27711-201ENSMUST00000183802 118 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Bco2Q99NF1 Snord60-201ENSMUST00000082834 78 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Bco2Q99NF1 Vmn1r75-204ENSMUST00000227611 4336 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Bco2Q99NF1 AC159093.2-201ENSMUST00000227881 297 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Bco2Q99NF1 Gm26290-201ENSMUST00000158891 145 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Bco2Q99NF1 Mir6381-201ENSMUST00000183426 87 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Bco2Q99NF1 Sult1c2-ps2-201ENSMUST00000196414 276 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Bco2Q99NF1 Gm43977-201ENSMUST00000203970 189 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Bco2Q99NF1 Gm22980-201ENSMUST00000082608 70 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Bco2Q99NF1 Gm24524-201ENSMUST00000082925 170 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
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