Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Gm24547-201ENSMUST00000158649 149 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SrrtQ99MR6 Mir3083-201ENSMUST00000175377 64 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SrrtQ99MR6 A730009L09Rik-202ENSMUST00000210306 201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SrrtQ99MR6 Gm24271-201ENSMUST00000102327 111 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SrrtQ99MR6 Gm23130-201ENSMUST00000104252 74 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SrrtQ99MR6 Gm16265-201ENSMUST00000134558 108 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SrrtQ99MR6 Gm24808-201ENSMUST00000157993 118 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SrrtQ99MR6 Gm23221-201ENSMUST00000158118 93 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SrrtQ99MR6 Gm23065-201ENSMUST00000158236 130 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SrrtQ99MR6 Gm26062-201ENSMUST00000083379 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SrrtQ99MR6 Gm26109-201ENSMUST00000083970 70 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SrrtQ99MR6 Gm23881-201ENSMUST00000116872 66 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SrrtQ99MR6 Gm14882-201ENSMUST00000117216 218 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SrrtQ99MR6 Gm12469-201ENSMUST00000117623 207 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SrrtQ99MR6 Gm25901-201ENSMUST00000158494 130 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SrrtQ99MR6 Olfr8-203ENSMUST00000214952 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SrrtQ99MR6 Gm15115-201ENSMUST00000121145 264 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SrrtQ99MR6 Gm26274-201ENSMUST00000157103 321 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SrrtQ99MR6 Mir6390-201ENSMUST00000184405 129 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SrrtQ99MR6 Traj49-202ENSMUST00000199452 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SrrtQ99MR6 AC140930.2-201ENSMUST00000221803 109 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SrrtQ99MR6 Gm14400-201ENSMUST00000117234 2135 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SrrtQ99MR6 Gm23267-201ENSMUST00000178490 132 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SrrtQ99MR6 Gm25618-201ENSMUST00000179484 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SrrtQ99MR6 Gm43944-201ENSMUST00000205220 120 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SrrtQ99MR6 Mir1a-1-201ENSMUST00000093635 77 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SrrtQ99MR6 Gm14884-201ENSMUST00000120456 196 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SrrtQ99MR6 Gm23967-201ENSMUST00000175062 78 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SrrtQ99MR6 AC147560.1-201ENSMUST00000197528 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SrrtQ99MR6 Gm44469-201ENSMUST00000198558 79 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SrrtQ99MR6 Gm25337-201ENSMUST00000083723 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SrrtQ99MR6 Gm24895-201ENSMUST00000122742 74 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SrrtQ99MR6 Gm25289-201ENSMUST00000122799 119 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SrrtQ99MR6 Gm23339-201ENSMUST00000158962 139 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SrrtQ99MR6 Gm23344-201ENSMUST00000083818 68 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SrrtQ99MR6 Vmn1r75-204ENSMUST00000227611 4336 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SrrtQ99MR6 Gm26080-201ENSMUST00000104069 131 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SrrtQ99MR6 Gm10945-201ENSMUST00000105596 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SrrtQ99MR6 Gm22233-201ENSMUST00000157464 114 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SrrtQ99MR6 Gm25868-201ENSMUST00000158253 114 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SrrtQ99MR6 Mir1933-201ENSMUST00000158930 88 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SrrtQ99MR6 Gm25851-201ENSMUST00000082794 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SrrtQ99MR6 Mir148b-201ENSMUST00000083626 97 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SrrtQ99MR6 Gm25992-201ENSMUST00000102437 109 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SrrtQ99MR6 Gm22149-201ENSMUST00000104442 136 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SrrtQ99MR6 Gm27993-201ENSMUST00000184362 85 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SrrtQ99MR6 Gm36956-201ENSMUST00000193830 214 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SrrtQ99MR6 mt-Tc-201ENSMUST00000082400 66 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SrrtQ99MR6 Gm22251-201ENSMUST00000083216 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SrrtQ99MR6 Gm25128-201ENSMUST00000083339 76 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SrrtQ99MR6 Gm24476-201ENSMUST00000157437 131 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SrrtQ99MR6 AC117232.1-201ENSMUST00000197964 119 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SrrtQ99MR6 AC166341.8-201ENSMUST00000221267 108 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SrrtQ99MR6 Zfp960-201ENSMUST00000127027 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
SrrtQ99MR6 Gm25022-201ENSMUST00000102205 83 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SrrtQ99MR6 Gm22761-201ENSMUST00000102278 96 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SrrtQ99MR6 Mir467a-6-201ENSMUST00000177790 83 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SrrtQ99MR6 Mir467a-3-201ENSMUST00000178082 83 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SrrtQ99MR6 Mir467a-7-201ENSMUST00000178635 83 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SrrtQ99MR6 Mir467a-10-201ENSMUST00000179320 83 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SrrtQ99MR6 Mir467a-5-201ENSMUST00000179352 83 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SrrtQ99MR6 Mir467a-2-201ENSMUST00000179447 83 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SrrtQ99MR6 Mir467a-9-201ENSMUST00000179752 83 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SrrtQ99MR6 Mir467a-4-201ENSMUST00000179923 83 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SrrtQ99MR6 Mir467a-8-201ENSMUST00000180070 83 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SrrtQ99MR6 Trgj4-201ENSMUST00000184430 61 ntAPPRIS P1 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SrrtQ99MR6 AC132833.2-201ENSMUST00000228699 157 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SrrtQ99MR6 Gm22753-201ENSMUST00000083657 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SrrtQ99MR6 Gm23038-201ENSMUST00000083873 104 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SrrtQ99MR6 Olfr307-203ENSMUST00000217494 4515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SrrtQ99MR6 Arhgap5-204ENSMUST00000219443 9323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SrrtQ99MR6 Zfp654-201ENSMUST00000052588 4741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
SrrtQ99MR6 Gm10548-202ENSMUST00000165672 272 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SrrtQ99MR6 Gm26466-201ENSMUST00000179615 79 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SrrtQ99MR6 n-R5s157-201ENSMUST00000122543 121 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SrrtQ99MR6 Gm11749-201ENSMUST00000127327 184 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SrrtQ99MR6 Gm22515-201ENSMUST00000158273 305 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SrrtQ99MR6 Gm22770-201ENSMUST00000158368 67 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SrrtQ99MR6 Gm28794-201ENSMUST00000185276 136 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SrrtQ99MR6 Gm44932-201ENSMUST00000206799 121 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SrrtQ99MR6 Gm25899-201ENSMUST00000082672 141 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SrrtQ99MR6 Mir30a-201ENSMUST00000083471 71 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SrrtQ99MR6 Gm25495-201ENSMUST00000104431 131 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SrrtQ99MR6 Gm44488-201ENSMUST00000199467 119 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SrrtQ99MR6 Gm24311-201ENSMUST00000082570 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SrrtQ99MR6 Gm11694-201ENSMUST00000118637 159 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SrrtQ99MR6 Gm26133-201ENSMUST00000157363 100 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SrrtQ99MR6 Gm23900-201ENSMUST00000157569 108 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SrrtQ99MR6 Gm22466-201ENSMUST00000175278 69 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SrrtQ99MR6 Pcdh11x-208ENSMUST00000193899 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SrrtQ99MR6 Gm22559-201ENSMUST00000157329 134 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SrrtQ99MR6 Gm23857-201ENSMUST00000158379 111 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SrrtQ99MR6 Gm25014-201ENSMUST00000158401 103 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SrrtQ99MR6 Gm24129-201ENSMUST00000158537 97 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SrrtQ99MR6 Gm23301-201ENSMUST00000082713 65 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SrrtQ99MR6 Gm24527-201ENSMUST00000082920 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SrrtQ99MR6 Gm12869-201ENSMUST00000156265 344 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SrrtQ99MR6 Gm26158-201ENSMUST00000158973 119 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SrrtQ99MR6 Gm22129-201ENSMUST00000179034 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SrrtQ99MR6 Gm27326-201ENSMUST00000183504 95 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 162.6 ms