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Protein–RNA interactions for Protein: Q62468
Vil1, Villin-1, mouse
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RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (Experimental data)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
Vil1
Q62468
Gm23853-201
ENSMUST00000158375
104 nt
BASIC
1.2
□□□□□ -2.22
Vil1
Q62468
Gm8034-201
ENSMUST00000178853
132 nt
BASIC
1.2
□□□□□ -2.22
Vil1
Q62468
Snord60-201
ENSMUST00000082834
78 nt
BASIC
1.2
□□□□□ -2.22
Vil1
Q62468
Gm6272-201
ENSMUST00000121256
171 nt
BASIC
1.19
□□□□□ -2.22
Vil1
Q62468
Rab11fip4os2-202
ENSMUST00000132921
355 nt
TSL 1 (best)
BASIC
1.19
□□□□□ -2.22
Vil1
Q62468
Gm24926-201
ENSMUST00000178053
79 nt
BASIC
1.19
□□□□□ -2.22
Vil1
Q62468
Gm22632-201
ENSMUST00000178266
79 nt
BASIC
1.19
□□□□□ -2.22
Vil1
Q62468
Gm22753-201
ENSMUST00000083657
107 nt
BASIC
1.19
□□□□□ -2.22
Vil1
Q62468
Polr2k-ps-201
ENSMUST00000120170
175 nt
BASIC
1.18
□□□□□ -2.22
Vil1
Q62468
Gm24913-201
ENSMUST00000157286
107 nt
BASIC
1.18
□□□□□ -2.22
Vil1
Q62468
Gm22558-201
ENSMUST00000157326
95 nt
BASIC
1.18
□□□□□ -2.22
Vil1
Q62468
Gm37330-201
ENSMUST00000192606
153 nt
BASIC
1.18
□□□□□ -2.22
Vil1
Q62468
Olfr880-ps1-201
ENSMUST00000212344
229 nt
BASIC
1.18
□□□□□ -2.22
Vil1
Q62468
mt-Ts2-201
ENSMUST00000082416
59 nt
BASIC
1.18
□□□□□ -2.22
Vil1
Q62468
Snord32a-201
ENSMUST00000083285
83 nt
BASIC
1.18
□□□□□ -2.22
Vil1
Q62468
Olfr1100-202
ENSMUST00000117211
2937 nt
APPRIS P1
TSL 5
BASIC
1.17
□□□□□ -2.22
Vil1
Q62468
Gm24579-201
ENSMUST00000103964
144 nt
BASIC
1.17
□□□□□ -2.22
Vil1
Q62468
Mir1191-201
ENSMUST00000116883
120 nt
BASIC
1.17
□□□□□ -2.22
Vil1
Q62468
Mir1899-201
ENSMUST00000122798
96 nt
BASIC
1.17
□□□□□ -2.22
Vil1
Q62468
Gm36956-201
ENSMUST00000193830
214 nt
BASIC
1.17
□□□□□ -2.22
Vil1
Q62468
Trbv25-201
ENSMUST00000194700
273 nt
BASIC
1.17
□□□□□ -2.22
Vil1
Q62468
Mir219b-201
ENSMUST00000198317
65 nt
BASIC
1.17
□□□□□ -2.22
Vil1
Q62468
Gm23126-201
ENSMUST00000104260
134 nt
BASIC
1.16
□□□□□ -2.22
Vil1
Q62468
Gm13577-201
ENSMUST00000121365
205 nt
BASIC
1.16
□□□□□ -2.22
Vil1
Q62468
Gm24223-201
ENSMUST00000158827
90 nt
BASIC
1.16
□□□□□ -2.22
Vil1
Q62468
Gm26290-201
ENSMUST00000158891
145 nt
BASIC
1.16
□□□□□ -2.22
Vil1
Q62468
Gm37796-201
ENSMUST00000195327
134 nt
BASIC
1.16
□□□□□ -2.22
Vil1
Q62468
Gm44469-201
ENSMUST00000198558
79 nt
BASIC
1.16
□□□□□ -2.22
Vil1
Q62468
AC159093.2-201
ENSMUST00000227881
297 nt
BASIC
1.16
□□□□□ -2.22
Vil1
Q62468
Mir500-201
ENSMUST00000093600
92 nt
BASIC
1.16
□□□□□ -2.22
Vil1
Q62468
Gm24894-201
ENSMUST00000122744
118 nt
BASIC
1.15
□□□□□ -2.23
Vil1
Q62468
Gm26498-201
ENSMUST00000177799
79 nt
BASIC
1.15
□□□□□ -2.23
Vil1
Q62468
Gm26230-201
ENSMUST00000180141
79 nt
BASIC
1.15
□□□□□ -2.23
Vil1
Q62468
Gm44488-201
ENSMUST00000199467
119 nt
BASIC
1.15
□□□□□ -2.23
Vil1
Q62468
Gm26054-201
ENSMUST00000083037
107 nt
BASIC
1.15
□□□□□ -2.23
Vil1
Q62468
Gm24492-201
ENSMUST00000083798
107 nt
BASIC
1.15
□□□□□ -2.23
Vil1
Q62468
Gm25683-201
ENSMUST00000083940
131 nt
BASIC
1.15
□□□□□ -2.23
Vil1
Q62468
Gm22772-201
ENSMUST00000104451
121 nt
BASIC
1.14
□□□□□ -2.23
Vil1
Q62468
Gm12469-201
ENSMUST00000117623
207 nt
BASIC
1.14
□□□□□ -2.23
Vil1
Q62468
Gm24476-201
ENSMUST00000157437
131 nt
BASIC
1.14
□□□□□ -2.23
Vil1
Q62468
Gm38274-201
ENSMUST00000195689
148 nt
BASIC
1.14
□□□□□ -2.23
Vil1
Q62468
Gm24920-201
ENSMUST00000083018
85 nt
BASIC
1.14
□□□□□ -2.23
Vil1
Q62468
Gm23416-201
ENSMUST00000175520
95 nt
BASIC
1.13
□□□□□ -2.23
Vil1
Q62468
AC116319.1-201
ENSMUST00000227765
222 nt
BASIC
1.13
□□□□□ -2.23
Vil1
Q62468
Gm24445-201
ENSMUST00000083981
107 nt
BASIC
1.13
□□□□□ -2.23
Vil1
Q62468
Gm22196-201
ENSMUST00000116865
109 nt
BASIC
1.12
□□□□□ -2.23
Vil1
Q62468
Gm23881-201
ENSMUST00000116872
66 nt
BASIC
1.12
□□□□□ -2.23
Vil1
Q62468
n-R5s39-201
ENSMUST00000122613
108 nt
BASIC
1.12
□□□□□ -2.23
Vil1
Q62468
Gm22828-201
ENSMUST00000083768
107 nt
BASIC
1.12
□□□□□ -2.23
Vil1
Q62468
Gm25646-201
ENSMUST00000178527
79 nt
BASIC
1.11
□□□□□ -2.23
Vil1
Q62468
AC124687.1-201
ENSMUST00000221868
189 nt
BASIC
1.11
□□□□□ -2.23
Vil1
Q62468
Gm24148-201
ENSMUST00000082762
80 nt
BASIC
1.11
□□□□□ -2.23
Vil1
Q62468
Gm25629-201
ENSMUST00000084001
107 nt
BASIC
1.11
□□□□□ -2.23
Vil1
Q62468
Snord69-201
ENSMUST00000104024
80 nt
BASIC
1.1
□□□□□ -2.23
Vil1
Q62468
Gm23654-201
ENSMUST00000116758
126 nt
BASIC
1.1
□□□□□ -2.23
Vil1
Q62468
Gm24649-201
ENSMUST00000157106
134 nt
BASIC
1.1
□□□□□ -2.23
Vil1
Q62468
Gm22340-201
ENSMUST00000157717
114 nt
BASIC
1.1
□□□□□ -2.23
Vil1
Q62468
Defb38-201
ENSMUST00000066416
286 nt
APPRIS P1
TSL 1 (best)
BASIC
1.1
□□□□□ -2.23
Vil1
Q62468
Gm22509-201
ENSMUST00000082775
107 nt
BASIC
1.1
□□□□□ -2.23
Vil1
Q62468
Gm23507-201
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107 nt
BASIC
1.1
□□□□□ -2.23
Vil1
Q62468
Snord78-201
ENSMUST00000104032
66 nt
BASIC
1.09
□□□□□ -2.23
Vil1
Q62468
Mir362-201
ENSMUST00000093592
65 nt
BASIC
1.09
□□□□□ -2.23
Vil1
Q62468
Olfr867-203
ENSMUST00000216538
4617 nt
APPRIS P1
TSL 5
BASIC
1.09
□□□□□ -2.24
Vil1
Q62468
Mir695-201
ENSMUST00000102261
109 nt
BASIC
1.08
□□□□□ -2.24
Vil1
Q62468
Gm12086-201
ENSMUST00000120863
228 nt
BASIC
1.08
□□□□□ -2.24
Vil1
Q62468
Gm22431-201
ENSMUST00000158545
107 nt
BASIC
1.08
□□□□□ -2.24
Vil1
Q62468
Gm10548-202
ENSMUST00000165672
272 nt
BASIC
1.08
□□□□□ -2.24
Vil1
Q62468
Vmn1r-ps69-201
ENSMUST00000172759
201 nt
BASIC
1.08
□□□□□ -2.24
Vil1
Q62468
Mir21c-201
ENSMUST00000184910
78 nt
BASIC
1.08
□□□□□ -2.24
Vil1
Q62468
Gm24431-201
ENSMUST00000104073
66 nt
BASIC
1.07
□□□□□ -2.24
Vil1
Q62468
Gm23708-201
ENSMUST00000104367
123 nt
BASIC
1.07
□□□□□ -2.24
Vil1
Q62468
Gm23203-201
ENSMUST00000104374
107 nt
BASIC
1.07
□□□□□ -2.24
Vil1
Q62468
Gm25753-201
ENSMUST00000116792
121 nt
BASIC
1.07
□□□□□ -2.24
Vil1
Q62468
Gm22031-201
ENSMUST00000116945
126 nt
BASIC
1.07
□□□□□ -2.24
Vil1
Q62468
n-R5s6-201
ENSMUST00000122663
88 nt
BASIC
1.07
□□□□□ -2.24
Vil1
Q62468
Gm23986-201
ENSMUST00000157144
63 nt
BASIC
1.07
□□□□□ -2.24
Vil1
Q62468
Gm26158-201
ENSMUST00000158973
119 nt
BASIC
1.07
□□□□□ -2.24
Vil1
Q62468
Gm22638-201
ENSMUST00000179674
107 nt
BASIC
1.07
□□□□□ -2.24
Vil1
Q62468
Gm44211-201
ENSMUST00000204867
145 nt
BASIC
1.07
□□□□□ -2.24
Vil1
Q62468
AC211878.4-201
ENSMUST00000220970
262 nt
BASIC
1.07
□□□□□ -2.24
Vil1
Q62468
Gm25138-201
ENSMUST00000083248
136 nt
BASIC
1.07
□□□□□ -2.24
Vil1
Q62468
Gm22055-201
ENSMUST00000083388
107 nt
BASIC
1.07
□□□□□ -2.24
Vil1
Q62468
Gm26338-201
ENSMUST00000102372
110 nt
BASIC
1.06
□□□□□ -2.24
Vil1
Q62468
Gm22786-201
ENSMUST00000104086
122 nt
BASIC
1.06
□□□□□ -2.24
Vil1
Q62468
Gm23321-201
ENSMUST00000104465
126 nt
BASIC
1.06
□□□□□ -2.24
Vil1
Q62468
Gm25680-201
ENSMUST00000116917
126 nt
BASIC
1.06
□□□□□ -2.24
Vil1
Q62468
Gm22635-201
ENSMUST00000116962
126 nt
BASIC
1.06
□□□□□ -2.24
Vil1
Q62468
Gm28270-201
ENSMUST00000188550
109 nt
BASIC
1.06
□□□□□ -2.24
Vil1
Q62468
Gm28328-201
ENSMUST00000188869
109 nt
BASIC
1.06
□□□□□ -2.24
Vil1
Q62468
Mir466-201
ENSMUST00000093591
73 nt
BASIC
1.06
□□□□□ -2.24
Vil1
Q62468
Gm22089-201
ENSMUST00000158336
102 nt
BASIC
1.05
□□□□□ -2.24
Vil1
Q62468
Mir100-201
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80 nt
BASIC
1.05
□□□□□ -2.24
Vil1
Q62468
Gm27587-201
ENSMUST00000185116
163 nt
BASIC
1.05
□□□□□ -2.24
Vil1
Q62468
Gm42844-201
ENSMUST00000200355
112 nt
BASIC
1.05
□□□□□ -2.24
Vil1
Q62468
Gm23601-201
ENSMUST00000157259
131 nt
BASIC
1.04
□□□□□ -2.24
Vil1
Q62468
Gm24323-201
ENSMUST00000175342
77 nt
BASIC
1.04
□□□□□ -2.24
Vil1
Q62468
Gm25693-201
ENSMUST00000175443
85 nt
BASIC
1.04
□□□□□ -2.24
Vil1
Q62468
Gm22070-201
ENSMUST00000178475
107 nt
BASIC
1.04
□□□□□ -2.24
Vil1
Q62468
Gm44301-201
ENSMUST00000200362
143 nt
BASIC
1.04
□□□□□ -2.24
Vil1
Q62468
Mir369-201
ENSMUST00000083627
79 nt
BASIC
1.04
□□□□□ -2.24
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